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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2023-5-17 11:27:39 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,用freq这个关键词算单个原子的Gibbs自由能可以吗?反应中涉及单个原子,想算它从金属上解离的反应热力学

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-17 11:29:26 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-5-17 11:27
各位老师好,用freq这个关键词算单个原子的Gibbs自由能可以吗?反应中涉及单个原子,想算它从金属上解离的 ...

可以
但通常只是在这个任务里得到热力学校正量,然后加到更高级别下计算的电子能量上得到自由能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-5-17 14:11:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-17 11:29
可以
但通常只是在这个任务里得到热力学校正量,然后加到更高级别下计算的电子能量上得到自由能

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2023-5-17 15:55:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-17 10:48

对Gaussian而言是CASSCF任务,但通过IOp让Gaussian实际做的是CASCI

好的,好的,多谢sob老师

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发表于 Post on 2023-5-17 17:42:27 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2023-5-17 20:24:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-16 21:25
如果你就是要做CASCI,用iop(5/7=-1),此时不做轨道优化

自然轨道和定域化轨道都可以用Multiwfn产生, ...

sob老师,昨天用想试一下您说的casci,用的关键词是:cas(4,4)/def2tzvp nosym geom=allcheck Guess=read
iop(5/7=-1),但是还是没有得到带有百分比的组态信息,是关键词有什么问题吗?

FeCONOBF4_casscf-cas4_iop.log

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-17 23:56:46 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2023-5-17 20:24
sob老师,昨天用想试一下您说的casci,用的关键词是:cas(4,4)/def2tzvp nosym geom=allcheck Guess=read ...

对于组态数少的CASSCF计算,高斯用直接对角化,并输出组态信息。对于组态数多的情况,高斯用lanczos方法,且不会输出组态信息。为了让组态信息能够输出,需要用iop(4/43=3),这样L405就会输出组态信息。
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发表于 Post on 2023-5-18 00:00:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-17 23:56
对于组态数少的CASSCF计算,高斯用直接对角化,并输出组态信息。对于组态数多的情况,高斯用lanczos方法 ...

每台用过这种关键词,想问下您,这个iop(4/43=3)的关键词和iop(5/7=-1)可以同时用吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-18 00:06:45 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2023-5-18 00:00
每台用过这种关键词,想问下您,这个iop(4/43=3)的关键词和iop(5/7=-1)可以同时用吗?

自己一试便知
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发表于 Post on 2023-5-18 00:43:02 | 只看该作者 Only view this author

麻烦了sob老师了,还得再问您一下,试了iop(4/43=3),出现了一个报错,感觉做cas(4,4)的时候不太需要之前那个iop的关键词,就是始终得不到带比例的组态信息,计算casci时候要去掉cas的关键词吗?还是有什么特殊的设置吗?

202305180039261458..png (11.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

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sxh3231796 发表于 2023-5-18 00:43
麻烦了sob老师了,还得再问您一下,试了iop(4/43=3),出现了一个报错,感觉做cas(4,4)的时候不太需要之前 ...

显然不能去,去了就成做HF计算了
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发表于 Post on 2023-5-18 15:46:03 | 只看该作者 Only view this author

高斯优化势能面扫描

各位老师。第一次尝试做势能面扫描,想寻找对中间的O原子固定住,将O与两个Mo原子之间的距离做了限制性优化。然后对H进行势能面扫描,运行后立刻报错了,输出文件末尾的 No s atoms found in this molecule.在网上查询不到原因。拜求各位帮忙指正错误,非常感谢!

MoO2(OH)2(H2O)2-scan-7-20230517.gjf

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MoO2(OH)2(H2O)2-scan-7-20230517.log

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-18 15:57:06 | 只看该作者 Only view this author
abcd401 发表于 2023-5-18 15:46
各位老师。第一次尝试做势能面扫描,想寻找对中间的O原子固定住,将O与两个Mo原子之间的距离做了限制性优化 ...

格式一团糟
别随便空行,Gaussian里的空行都是有特定意义的
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发表于 Post on 2023-5-18 21:08:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-18 01:02
显然不能去,去了就成做HF计算了

拿这种情况要怎么才能得到带比例的组态系数呢?

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发表于 Post on 2023-5-19 08:59:04 | 只看该作者 Only view this author
请教各位老师,如图所示的IRC曲线端点结构是双自由基结构,输出文件<S**2>= 0.9728,但是取该端点结构进行优化,输入文件设置为“#p um062x 6-311g(d,p) guess=mix stable=opt nosymm……--Link1--…#p opt freq um062x/6-311g(d,p) int=superfine guess=read geom=allcheck nosymm”,但是优化后的结构是两个双自由基位点相连的环辛烯,这是为什么呢?谢谢老师

202305190853262073..png (68.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

IRC

IRC

202305190858039905..png (42.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

环辛烯

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