计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[量化理论] 乱谈激发态的计算方法

  [复制链接 Copy URL]

1294

帖子

0

威望

6236

eV
积分
7530

Level 6 (一方通行)

16#
发表于 Post on 2015-1-14 13:21:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-14 03:10
问题没有那么复杂。激发态势能面形状对泛函的敏感度也明显没有激发能那么高,不必考虑得过于精细。
简单 ...

谢谢sob的指点,也就是说:
1:一般,优化单重激发态使用的是b3lyp  或者是pbe0 。优化三重激发态用的是m062x
2:如果说,想不区分,都用一个来做,就用m062x。
3:如果说更细分:激发态是CT态,需要更多的HF来描述比较准确,所以使用m062x。
                 激发态是LE态,就用b3lyp  pbe0。
4:总的来说,泛函的选择,需要根据计算的分子的特点来选定,没有说是一成不变的,但是,上面是我们总结的经验,一般情况是这样的,
不知道以上我的理解是否有错误,谢谢sob指点
ps:我贴出的那个jacs文章,激发态用的什么方法?

谢谢sob
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

strive for greatness

177

帖子

0

威望

1567

eV
积分
1744

Level 5 (御坂)

17#
发表于 Post on 2015-3-10 16:03:41 | 只看该作者 Only view this author
Sob可否在提到GGA时把LDA和GGA型的泛函罗列一下,或者提示相关信息的来源,现在还是有些不能完全记清楚,百度或google到的感觉都不全,汗

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

18#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-3-10 18:25:36 | 只看该作者 Only view this author
ter20 发表于 2015-3-10 16:03
Sob可否在提到GGA时把LDA和GGA型的泛函罗列一下,或者提示相关信息的来源,现在还是有些不能完全记清楚,百 ...

GGA或meta-GGA有BLYP、TPSS、 BPW91、BP86、PW91PW91、PBE、OLYP、mPW1PW91、M06L、XLYP、VSXC、B95、SSB、KT1/2/3、HCTH等等

LDA就那么几种,交换部分是Slater,相关部分是VWN3、VWN5或PW。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

19#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-3-10 18:27:11 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2015-1-14 13:21
谢谢sob的指点,也就是说:
1:一般,优化单重激发态使用的是b3lyp  或者是pbe0 。优化三重激发态用的是 ...

基本就是这样。
那个文章属于非主流做法,自己调的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

20#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-3-10 22:21:35 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2015-1-14 13:21
谢谢sob的指点,也就是说:
1:一般,优化单重激发态使用的是b3lyp  或者是pbe0 。优化三重激发态用的是 ...

再补充一下,虽然小分子单重态价层激发适合用你说的PBE0,但对于有机大共轭分子,建议用HF成份高一些的,M062X是个不错的选择。GGA以及HF成分低的情况,包括B3LYP,对有机大共轭分子容易出现ghost态。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1294

帖子

0

威望

6236

eV
积分
7530

Level 6 (一方通行)

21#
发表于 Post on 2015-3-11 07:29:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-3-10 22:21
再补充一下,虽然小分子单重态价层激发适合用你说的PBE0,但对于有机大共轭分子,建议用HF成份高一些的, ...

嗯,谢谢sob的指点。very much
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

strive for greatness

18

帖子

0

威望

118

eV
积分
136

Level 2 能力者

22#
发表于 Post on 2015-3-11 16:43:52 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师!

31

帖子

0

威望

92

eV
积分
123

Level 2 能力者

23#
发表于 Post on 2016-3-13 10:16:26 | 只看该作者 Only view this author
sob大神,急需求助!我是高斯计算菜鸟,已经被nto计算折磨的身心俱疲了,我进行了nto计算,终于计算过程中没有报错,但是不知道怎么证明已经完成了nto计算,还有当我用fchk文件看nto轨道的时候我应该点完cube以后选哪种类型啊,我可以选的类型只有:molecular orbital;total density;alpha density;ESP。
以下是我做的三次计算的输入文件:
1
%nprocshared=3
%mem=200MW
%chk=E:\g9new\bmy\tpesinglet1energyNTO2.chk
# td=(singlets,nstates=10,root=2)/6-31+g(d,p) geom=connectivity density=transition=2 m062x
2
%nprocshared=3
%mem=200MW
%chk=E:\g9new\bmy\tpesinglet1energyNTO2.chk
# td=(singlets,nstates=10,root=2)/6-31+g(d,p) pop=nto density=transition=2 geom=check guess=read m062x
3
%nprocshared=3
%mem=200MW
%chk=E:\g9new\bmy\tpesinglet1energyNTO2.chk
# density=(check,transition=2) geom=allcheck guess=(read,only) pop=savento

求大神指教!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

24#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-13 10:20:05 | 只看该作者 Only view this author
mengyingbian 发表于 2016-3-13 10:16
sob大神,急需求助!我是高斯计算菜鸟,已经被nto计算折磨的身心俱疲了,我进行了nto计算,终于计算过程中 ...


为何搞这么复杂,直接按照此文的做法弄就完了:
跃迁密度分析方法-自然跃迁轨道(NTO)简介
http://sobereva.com/91
要算S0->S2的NTO,就写
#P m062x/6-31g(d,p) td=nstates=10 density=transition=2 pop(NTO,saveNTO)
然后用Multiwfn载入fch文件,进主功能0就能看到NTO了。gview的话,直接在轨道观看界面,看到的也是NTO。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

31

帖子

0

威望

92

eV
积分
123

Level 2 能力者

25#
发表于 Post on 2016-3-13 10:26:44 | 只看该作者 Only view this author
太感动了,竟然这么快就得到了回复!!我已经折腾了很久了。。。
直接用gview在轨道观看界面是载入new cube的,然后会有很多选项,比如看homo lumo什么的,不知道选哪个,而且输出文件中关于激发态的概率算完nto后会不会也有专门关于它的概率

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

26#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-13 10:30:21 | 只看该作者 Only view this author
mengyingbian 发表于 2016-3-13 10:26
太感动了,竟然这么快就得到了回复!!我已经折腾了很久了。。。
直接用gview在轨道观看界面是载入new cub ...

你那个是观看等值面界面。我说的是Edit-MOs那个界面,就和观看普通分子轨道一样,因为用了saveNTO后NTO已经代替MO存到了chk里了。

没有什么所谓的激发态概率,怎么解释NTO对激发的贡献在前面提到的博文里已经说了。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
mengyingbian + 4 牛!

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

31

帖子

0

威望

92

eV
积分
123

Level 2 能力者

27#
发表于 Post on 2016-3-13 10:44:18 | 只看该作者 Only view this author
我的edit mos界面是附件中的样子

IMG_0571.JPG (148 KB, 下载次数 Times of downloads: 127)

IMG_0571.JPG

31

帖子

0

威望

92

eV
积分
123

Level 2 能力者

28#
发表于 Post on 2016-3-13 10:50:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-13 10:30
你那个是观看等值面界面。我说的是Edit-MOs那个界面,就和观看普通分子轨道一样,因为用了saveNTO后NTO已 ...

是不是我算的是错的,下面是您给的例子
Alpha  occ. eigenvalues --    0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
Alpha  occ. eigenvalues --    0.00000   0.00000   0.00001   0.00003   0.00005
Alpha  occ. eigenvalues --    0.00008   0.00018   0.00077   0.00611   0.99276
Alpha virt. eigenvalues --    0.99276   0.00611   0.00077   0.00018   0.00008
Alpha virt. eigenvalues --    0.00005   0.00003   0.00001   0.00000   0.00000
Alpha virt. eigenvalues --    0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
但是我算完后occ.部分是负值。。。。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

29#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-13 12:56:00 | 只看该作者 Only view this author
mengyingbian 发表于 2016-3-13 10:50
是不是我算的是错的,下面是您给的例子
Alpha  occ. eigenvalues --    0.00000   0.00000   0.00000   ...


不代表是错的。
你先把我文中的例子重复一遍在搞你的体系。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
mengyingbian + 4 赞!

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

31

帖子

0

威望

92

eV
积分
123

Level 2 能力者

30#
发表于 Post on 2016-3-13 15:38:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-13 12:56
不代表是错的。
你先把我文中的例子重复一遍在搞你的体系。

好的 谢谢大神!!遇到问题还得请教您!!!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 10:53 , Processed in 0.196010 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list