基于gmx_MMPBSA程序的结合自由能计算-MMGBSA方法

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keeper14335 发表于 2026-1-23 16:04
感谢老师答疑！我已按照您提供的办法找到了amber99sb-ildn力场在mmpbsa.in文件中的写法，目前正在计算最 ...

一般来说是算RMSD平稳之后那段轨迹（间隔取样），如果模拟了200ns但只取最后1ns计算，那有点搞笑，可能会被审稿人批。
此外，MM-PBSA主要靠CPU算，不靠GPU。你可以考虑开纯CPU的机器。