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[新手求助] 使用B3LYP-D3(BJ)/def2svp //B3LYP-D3(BJ)/def2tzvpp计算晶体密度和生成焓是否合理

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计算的目的是预测分子的密度和爆轰性质。首先使用B3LYP-D3(BJ)/def2svp优化结构和振动分析,使用Multiwfn的分子表面分析功能得到分子的密度。选择B3LYP-D3(BJ)/def2svp的原因是该泛函与基组得到的密度和实验值最为接近(和B3LYP/6-31G(d,p); B3LYP/6-311G(d,p); B3LYP/6-311+G(d,p); m06-2x/def2svp; B3LYP/def2svp都进行了对比),此外还将优化得到的分子结构的键长和键角和单晶数据进行RSME的计算,该泛函与基组得到结构也是与单晶数据最为接近。在小基组下计算了密度之后,使用B3LYP-D3(BJ)/def2tzvpp进行单点能计算,查阅得到该泛函基组下ZPE校正因子0.9912,使用shermo得到焓值,等键法计算得到了气相标准生成焓。再使用大基组下单点能计算得到的fchk文件,使用multiwfn得到一系列GIPF描述符,使用公式计算得到了蒸发焓,固态标准生成焓以及一系列爆轰性质。
请问各位老师,选择B3LYP-D3(BJ)/def2svp //B3LYP-D3(BJ)/def2tzvpp以及计算流程是否合理?如果不合理应该进行怎样的更改?如果后续要进行静电势图绘制和HOMO-LUMO计算是否还可以使用单点能计算的水平?优化的分子是TNAZ,如图所示。



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发表于 Post on 2025-9-21 02:36:02 | 只看该作者 Only view this author
“选择B3LYP-D3(BJ)/def2svp的原因是该泛函与基组得到的密度和实验值最为接近” 纯属胡乱凑数据。各种方法和基组组合,总有一个能表面上能凑出和实验很接近的,然而这种做法毫无意义。下文提到的预测公式原文里参数在什么级别下拟合的,你就必须用相应级别做计算,哪怕预测出来的结果和已知实验值吻合得不是最好的
使用Multiwfn预测晶体密度、蒸发焓、沸点、溶解自由能等性质
http://sobereva.com/337http://bbs.keinsci.com/thread-3571-1-1.html

B3LYP算能量早就过时了,即便加上色散校正也无济于事。认真看下文
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
坚持使用B3LYP算有机体系能量的人的下场
http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html


B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVPP用于结合Multiwfn做波函数分析、考察分子轨道没问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-21 15:26:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-21 02:36
“选择B3LYP-D3(BJ)/def2svp的原因是该泛函与基组得到的密度和实验值最为接近” 纯属胡乱凑数据。各种方法 ...

谢谢社长的耐心回答,我已将B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVPP改为M06-2x/def2-TZVPP进行单点能计算。再次阅读了您提到的博文,我仍有几个问题:
1.我预测密度使用的是Multiwfn功能12的给出的M/Vm值,并未使用拟合的预测公式,该方法是否就不必使用特定的级别进行计算?
2.我的目的是以该分子为骨架,更改基团进行修饰,预测修饰后的分子的性质。因此想通过对已有实验数据的分子进行优化,比较不同方法与基组得到的预测结果哪个更为接近实验值,选用该级别进行后续的预测。我浅薄的认为对于相似的分子,使用筛选后的方法进行计算结果可能会更加精确。这样的作法仍是无意义的吗?
3.您说的”下文提到的预测公式原文里参数在什么级别下拟合的,你就必须用相应级别做计算“。那么我使用文中的升华焓的预测公式进行计算,我是否必须重新使用相应的B3LYP/6-311++G(2df,2p)//B3LYP/6-31G级别进行计算后代入公式?(因为我看了许多计算含能分子的爆轰性能的文献,使用该公式时都未在这个级别下进行计算)

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发表于 Post on 2025-9-21 21:50:17 | 只看该作者 Only view this author
l33221593 发表于 2025-9-21 15:26
谢谢社长的耐心回答,我已将B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVPP改为M06-2x/def2-TZVPP进行单点能计算。再次阅读了您 ...

1 是。但这种方式估计原理上并不确切,明显忽略了在凝聚相下分子表面的穿透

2 以同样的预测方法,横向比较比较不同基团修饰后的结构的差异可以。至于计算级别的筛选毫无意义,纯属凑数,审稿人也不都外行

3 是。别被那些文章误导
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