计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125416

管理员

公社社长

5371#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 20:44:17 | 只看该作者 Only view this author
小潘潘 发表于 2017-12-19 20:33
我是一个高斯计算新人在用优化好的分子计算频率的时候总会莫名掉下来,就好像没有算完一样,但是并不是服务 ...

程序bug,或者程序与系统兼容问题都有可能造成。
重新算一遍。
如果还这样,尝试其它版本。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

34

帖子

0

威望

524

eV
积分
558

Level 4 (黑子)

5372#
发表于 Post on 2017-12-19 20:48:33 | 只看该作者 Only view this author
好的,非常感谢老师的解答

13

帖子

0

威望

79

eV
积分
92

Level 2 能力者

5373#
发表于 Post on 2017-12-19 20:57:17 | 只看该作者 Only view this author

输入文件哪里错了,请指教,谢谢!

下面是我对Gaussview创建的乙烯分子模型进行优化,但问什么运行时
立刻就错误终止了呢?请问输入文件哪里有错误呢?谢谢。

%chk=1.chk
%mem=1GB
%NProcShared=4
%rwf=1,19900000mb,2,19900000mb,3,19900000mb,4,19900000mb
#p hf/6-31G(d) opt

c2h4

0 1
C                 -2.04691913    0.10971787    0.00000000
C                 -0.72100313    0.10971787    0.00000000
H                 -2.64050413    1.03375587    0.00000000
H                 -2.64053513   -0.81429613   -0.00002200
H                 -0.12741813   -0.81432013   -0.00001900
H                 -0.12738713    1.03373187    0.00002600

1 2 2.0 3 1.0 4 1.0
2 5 1.0 6 1.0
3
4
5
6

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125416

管理员

公社社长

5374#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 20:58:17 | 只看该作者 Only view this author
ironman_2 发表于 2017-12-19 20:43
gaussian16太大了,3.37G,是这样的吗

本来就这样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125416

管理员

公社社长

5375#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 21:03:16 | 只看该作者 Only view this author
mumeizili 发表于 2017-12-19 20:57
下面是我对Gaussview创建的乙烯分子模型进行优化,但问什么运行时
立刻就错误终止了呢?请问输入文件哪里 ...

关键词没错
估计是%不恰当设定所致
没事不要%rwf分那么多,你当前的设置根本没意义,或者说根本设它就是多余的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6

帖子

0

威望

39

eV
积分
45

Level 2 能力者

5376#
发表于 Post on 2017-12-19 21:13:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ironman_2 于 2017-12-19 21:27 编辑

高斯16现在到了什么版本?刚下载了一个是G16-A03-AVX2,怎么看我的电脑支持不支持这个版本呢?
另外问下大神,能用高斯计算荧光强度吗?

32

帖子

0

威望

83

eV
积分
115

Level 2 能力者

5377#
发表于 Post on 2017-12-19 21:28:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-19 19:12
那只能利用ONIOM分层设定实现,高层和底层的显示方式不同。

sob老师,具体操作流程可以在哪里找到吗?谢谢老师

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125416

管理员

公社社长

5378#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 21:54:54 | 只看该作者 Only view this author
ironman_2 发表于 2017-12-19 21:13
高斯16现在到了什么版本?刚下载了一个是G16-A03-AVX2,怎么看我的电脑支持不支持这个版本呢?
另外问下 ...

用aida64或CPU-Z等程序查看CPU信息,如果显示支持AVX2就能用

荧光看
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125416

管理员

公社社长

5379#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 21:56:43 | 只看该作者 Only view this author
chrishuo 发表于 2017-12-19 21:28
sob老师,具体操作流程可以在哪里找到吗?谢谢老师


gview里Edit - Select layers,摸索两下就会了。low层是细线表示,high层是球棍表示
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

32

帖子

0

威望

83

eV
积分
115

Level 2 能力者

5380#
发表于 Post on 2017-12-19 22:47:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-19 21:56
gview里Edit - Select layers,摸索两下就会了。low层是细线表示,high层是球棍表示

好的,谢谢sob老师!

175

帖子

0

威望

1057

eV
积分
1232

Level 4 (黑子)

5381#
发表于 Post on 2017-12-20 10:14:45 | 只看该作者 Only view this author
1.%rwf是干嘛的?我们课题组都是带这个,一直也没懂干嘛的,前面sob老师说的不要把%rwf分那么多是什么意思啊呢,我之前看别人说有%rwf才能在断电后用restart续算。
2.我最近算任务总是通进去算很久没结果,群里大神告诉我RMS,Max变大就把任务杀死,可是我发现有时候这两个值增大最后还能变小,并且算出结果。如果我把任务杀死,可是我再算的时候还是会碰到这种情况啊,不知道应该怎么处理。。另外我之前算过一个任务,增大步长后,更快得到了结果,这是偶然的么?

6

帖子

0

威望

39

eV
积分
45

Level 2 能力者

5382#
发表于 Post on 2017-12-20 11:09:03 | 只看该作者 Only view this author
群里各位大神,高斯16在计算速度各方面比09版快吗?想安装gaussian16,但是解压后已经高达7.59G

6

帖子

0

威望

39

eV
积分
45

Level 2 能力者

5383#
发表于 Post on 2017-12-20 11:09:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-19 21:54
用aida64或CPU-Z等程序查看CPU信息,如果显示支持AVX2就能用

荧光看

谢谢SOB大神

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125416

管理员

公社社长

5384#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-20 12:31:10 | 只看该作者 Only view this author
ironman_2 发表于 2017-12-20 11:09
群里各位大神,高斯16在计算速度各方面比09版快吗?想安装gaussian16,但是解压后已经高达7.59G

g16和g09默认格点精度和acc2e都有差别,假设设置设为相同,则g16和g09相同指令集版本性能没有差别,AVX2 g16和SSE4.2的g09比前者快不少。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125416

管理员

公社社长

5385#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-20 12:33:23 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2017-12-20 10:14
1.%rwf是干嘛的?我们课题组都是带这个,一直也没懂干嘛的,前面sob老师说的不要把%rwf分那么多是什么意思 ...


1 rwf是Gaussian临时文件当中体积最大的。你要是保留%rwf就写路径就完了,何必分成那么多块,硬盘也不是没地方。
2 我不知道你听哪群的哪个所谓的“大神”说的,没有前提的情况下这么判断根本完全错误。要是诸如思想家公社群里liyuanhe等水平很好的人告诉你的,那肯定是你理解错了。要是杂七杂八的群里来路不明的人告诉你的,那纯粹是在坑你。
你应当先搞清楚你当前任务到底在干什么。

PS:建议有机会参加科音的初级量化培训班,把思路和计算常识搞清楚

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
329678001 + 3 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-3-8 14:33 , Processed in 0.743153 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list