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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 使用Gaussian+PySOC在TDDFT下计算旋轨耦合矩阵元

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-30 03:08:08 | 只看该作者 Only view this author
陈丢丢 发表于 2019-11-29 16:42
谢谢老师。那我想算DFT下的SOC,可以用什么软件呢?

用NWChem做SODFT在DFT计算中考虑旋轨耦合效应
http://sobereva.com/368http://bbs.keinsci.com/thread-5573-1-1.html

要么Dirac等支持二分量或四分量相对论计算的程序,旋轨耦合效应自然就体现进去了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2020-1-3 18:33:46 | 只看该作者 Only view this author
sob老师好,我用ubuntu虚拟器安装了python2.7.17和pysoc,按照您的教程修改后,运行pysoc.py命令时出现报错:

/bin/sh: 1: /sob/pysoc/bin/soc.py: not found
/bin/sh: 1: /sob/pysoc/bin/soc_td: not found

请问是什么原因呢?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-3 18:39:54 | 只看该作者 Only view this author
q1w2e3 发表于 2020-1-3 18:33
sob老师好,我用ubuntu虚拟器安装了python2.7.17和pysoc,按照您的教程修改后,运行pysoc.py命令时出现报错 ...

我只对CentOS用户提供帮助
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发表于 Post on 2020-6-9 15:46:34 | 只看该作者 Only view this author
Error when reading gaussian output
Traceback (most recent call last):
  File "/home/user039/soft/export/pysoc/pysoc/bin/soc.py", line 491, in <module>
    write_file(mo_ene, 'mo_ene.dat', '{}  ')
NameError: name 'mo_ene' is not defined
forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 171, file /home/user039/guo-ceshi/lingf/hbps/pysoc/wang/s1/soc_td_input.dat
Image              PC                Routine            Line        Source            
soc_td             0000000000426956  Unknown               Unknown  Unknown
soc_td             000000000043288B  Unknown               Unknown  Unknown
soc_td             0000000000407B24  init_prep_mp_read          26  init_prep.f90
soc_td             0000000000402D23  MAIN__                     14  soc_td.f90
soc_td             0000000000402CCE  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000037B7A1ED5D  Unknown               Unknown  Unknown
soc_td             0000000000402BD9  Unknown               Unknown  Unknown

sobereva老师,出现这种报错是怎么回事@sobereva

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-9 16:03:12 | 只看该作者 Only view this author
13104468322 发表于 2020-6-9 15:46
Error when reading gaussian output
Traceback (most recent call last):
  File "/home/user039/soft/e ...

要么操作不对,要么python版本不兼容
建议用ORCA
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发表于 Post on 2020-7-20 22:18:43 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,您好!我想知道怎样通过Gaussian+PySOC计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率?“通过本文计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率,笔者之后会另文介绍。”谢谢您~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-21 00:33:23 | 只看该作者 Only view this author
Believe 发表于 2020-7-20 22:18
sob老师,您好!我想知道怎样通过Gaussian+PySOC计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率?“通过本文计算的旋轨 ...

需要自己写程序实现,公式可参考Chem. Rev. 2017, 117, 6500
我也写过这么个程序,但发现结果不如Dalton通过响应理论算的稳健,也就没有再写博文介绍
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发表于 Post on 2020-7-21 08:46:59 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢sob老师~

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发表于 Post on 2021-10-15 16:45:28 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,您好,您在本贴中提到“至于具体如何通过本文计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率,笔者之后会另文介绍。” 我想用PySOC得到的SOC结果去计算磷光速率,但是没有找到您其他博文关于这部分内容的,所以想求助一下~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-16 03:14:29 | 只看该作者 Only view this author
shuifangren 发表于 2021-10-15 16:45
sob老师,您好,您在本贴中提到“至于具体如何通过本文计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率,笔者之后会另文 ...

用Dalton算。靠SOC矩阵元结合微扰公式,根据我的经验,明显不如Dalton基于响应函数算得准
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