计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

  [复制链接 Copy URL]

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

1486#
发表于 Post on 2025-5-19 17:33:44 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,如果我要研究轨道相互作用,研究金属与配体的配位键,我想找出配位键的主要来源的轨道并考察金属和配体轨道与该轨道的相互作用,请问寻找配位键的主要来源的轨道只能通过一个一个观察轨道,并找一个等值面覆盖大部分配位键的轨道吗?还是可以通过Multiwfn做其他操作获得呢?
放下

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

1487#
发表于 Post on 2025-5-19 20:08:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-18 23:03

可能计算方式不当,没具体信息没法判断

辛苦老师的回复,感激不尽!
放下

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120050

管理员

公社社长

1488#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-20 02:07:37 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-5-19 17:33
请问老师,如果我要研究轨道相互作用,研究金属与配体的配位键,我想找出配位键的主要来源的轨道并考察金属 ...

用ETS-NOCV或NAdO分析
使用键级密度(BOD)和自然适应性轨道(NAdO)图形化研究化学键
http://sobereva.com/535http://bbs.keinsci.com/thread-16453-1-1.html
使用Multiwfn通过ETS-NOCV方法深入分析片段间的轨道相互作用
http://sobereva.com/609http://bbs.keinsci.com/thread-24439-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

1489#
发表于 Post on 2025-5-20 08:14:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-20 02:07
用ETS-NOCV或NAdO分析
使用键级密度(BOD)和自然适应性轨道(NAdO)图形化研究化学键
http://sobereva.com ...

谢谢老师,此外想再请问一个问题,我使用sobEDA分析金属-配体之间的相互作用,发现贡献非常显著的有Electrostatic和Pauli repulsion和Orbital,其中Orbital可以用电荷分解或者ETS-NOCV或NAdO分析来继续深入讨论,请问Electrostatic和Pauli repulsion这两项可以使用别的分析来深入讨论吗?
放下

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120050

管理员

公社社长

1490#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-21 03:41:17 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-5-20 08:14
谢谢老师,此外想再请问一个问题,我使用sobEDA分析金属-配体之间的相互作用,发现贡献非常显著的有Elect ...

Electrostatic往往可以用静电势分析进一步,如表面静电势穿透图
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html

Pauli repulsion在ETS-NOCV里可以给出对应的电子密度变化,Multiwfn可以直接显示出来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

1491#
发表于 Post on 2025-5-21 17:31:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-21 03:41
Electrostatic往往可以用静电势分析进一步,如表面静电势穿透图
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色 ...

感谢老师!
放下

154

帖子

0

威望

850

eV
积分
1004

Level 4 (黑子)

1492#
发表于 Post on 2025-5-23 15:33:28 | 只看该作者 Only view this author
CHO-bkchg.zip (11.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)
老师您好,这个文件我用Multiwfn打开的时候窗口总是会突然关闭,但是我用当前版本(最新版本)的Multiwfn打开其他此类后缀的文件都是完全ok的,文本编辑器检查了一下该文件好像也没啥问题,该文件和Multiwfn的安装目录也没有存放在C盘中,不知道为啥会有这种情况,麻烦老师的解答了,谢谢!

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120050

管理员

公社社长

1493#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-24 06:42:21 | 只看该作者 Only view this author
〇66 发表于 2025-5-23 15:33
老师您好,这个文件我用Multiwfn打开的时候窗口总是会突然关闭,但是我用当前版本(最新版本)的Multiwfn ...

第64行
H -3.396045 -0.636071-10.101994  0.055366

Y和Z坐标之间缺少空格
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

154

帖子

0

威望

850

eV
积分
1004

Level 4 (黑子)

1494#
发表于 Post on 2025-5-25 23:28:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 〇66 于 2025-5-25 23:35 编辑
sobereva 发表于 2025-5-24 06:42
第64行
H -3.396045 -0.636071-10.101994  0.055366

太感谢老师了,耽误了您宝贵的时间,这么小的细节您都能看到,以后我会认真订对文件的。
我再用excel表格检查了一下其他行,发现除了64行,好多都没有加空格,我都一并改了。
还想麻烦问一下,为什么生成的文件里会有这种小问题呢?十分感谢老师!

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120050

管理员

公社社长

1495#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-26 05:01:11 | 只看该作者 Only view this author
〇66 发表于 2025-5-25 23:28
太感谢老师了,耽误了您宝贵的时间,这么小的细节您都能看到,以后我会认真订对文件的。
我再用excel表 ...

这个文件不是Multiwfn生成的,我没法回答
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

21

帖子

0

威望

67

eV
积分
88

Level 2 能力者

1496#
发表于 Post on 2025-5-28 16:05:17 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我在阅读博文里的关于分析分子极性的文章中的步骤,先将下面的结构单点能计算结果文件导入Multiwfn,然后选择12表面分析,然后0开始分析,得到的MPI值在10000kcal/mol多,而文献里是8kcal/mol左右,是哪里出问题了?

屏幕截图 2025-05-28 095256.png (27.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 200)

屏幕截图 2025-05-28 095256.png

屏幕截图 2025-05-28 095421.png (102.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 201)

屏幕截图 2025-05-28 095421.png

OPTD.log

54.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120050

管理员

公社社长

1497#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-29 07:25:08 | 只看该作者 Only view this author
bean233 发表于 2025-5-28 16:05
老师好,我在阅读博文里的关于分析分子极性的文章中的步骤,先将下面的结构单点能计算结果文件导入Multiwfn ...

必须用含有波函数信息的文件当输入文件,认真看
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

1498#
发表于 Post on 2025-6-26 16:53:02 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,Gaussian跑AIMD得到的chk文件可以像ORCA跑AIMD得到的gbw文件一样丢到Multiwfn里做各种分析吗?
放下

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120050

管理员

公社社长

1499#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-27 06:41:57 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-6-26 16:53
请问老师,Gaussian跑AIMD得到的chk文件可以像ORCA跑AIMD得到的gbw文件一样丢到Multiwfn里做各种分析吗?

不能
ORCA跑AIMD可以要求每隔一定帧数输出一次gbw,各个gbw是独立的,Gaussian没这个功能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

211

帖子

0

威望

885

eV
积分
1096

Level 4 (黑子)

1500#
发表于 Post on 2025-6-27 09:03:36 | 只看该作者 Only view this author
老师 请问这样的igmh_inter 散点图
我描述成吸引和排斥都存在但是很弱的范德华相互作用 是合适的对吗?
第一次描述igmh 散点图

微信截图_20250627090244.png (101.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 235)

微信截图_20250627090244.png

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 12:05 , Processed in 0.157108 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list