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楼主 Author: naoki
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[GROMACS] 请教交联聚合物拓扑文件中原子电荷的问题

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发表于 Post on 2023-2-24 01:57:11 | 只看该作者 Only view this author
大佬,我突然有个疑问,polymatic是为用于构建无定形线性聚合物而做出的程序包,可以用于构建结晶性聚合物的聚合模拟吗,而且它做出来的应该也是线性聚酰胺吧,不是交联的聚酰胺。不知道要不要接着用了,哈哈哈
目前专攻:
基于DFT、MD模拟的自由能计算
基于过渡态理论的自由能垒和反应速率常数计算
基于MD模拟的交联聚合物计算

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truffle

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-24 10:40:25 | 只看该作者 Only view this author
JCenter 发表于 2023-2-24 01:57
大佬,我突然有个疑问,polymatic是为用于构建无定形线性聚合物而做出的程序包,可以用于构建结晶性聚合物 ...

polymatic并不仅限于构建线型聚合物,其原文中已指出可用于构建交联聚合物。
举两个例子:
10.1038/nmat4638
10.1002/anie.202103555
结晶性聚合物可以构建,但是构建后应该不是结晶状态,需要后续的md步骤来做
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

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发表于 Post on 2023-2-24 10:56:50 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2023-2-24 10:40
polymatic并不仅限于构建线型聚合物,其原文中已指出可用于构建交联聚合物。
举两个例子:
10.1038/nma ...

感谢大佬的指点!🤗🤗🤗
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发表于 Post on 2024-6-28 11:14:31 | 只看该作者 Only view this author
您好,我建的模型和您的差不多,后续发现很难平衡,膜分布很不均匀,请问可以用什么办法让它均匀点吗?

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