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能量最小化后NVT 升温初始步 LINCS 崩溃（madrid 2019的H3O+体系，CUDA error #700）	分子模拟 (Molecular Modeling)	kogareru1z halfhour ago	00	kogareru1z halfhour ago
IGMH分析苯环与酯基之间的弱相互作用如何解释？	波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn)	clayer yesterday 23:57	127	sobereva 14 min ago
输入gmx指令时遇到First time point for annealing ＞init_t报错如何解决	分子模拟 (Molecular Modeling)	PPPhua yesterday 23:52	16	tptp 3 hour ago
关于ORCA QM/MM功能的一些疑问和求助	量子化学 (Quantum Chemistry)	aaxk yesterday 22:29	111	wal yesterday 22:59
请问做完分子动力学模拟后如何导出溶质分子的轨迹文件	分子模拟 (Molecular Modeling)	TUT yesterday 22:09	125	sobereva 11 min ago
GROMACS轨迹周期性边界可视化处理	分子模拟 (Molecular Modeling)	lts！ yesterday 21:48	222	lts！ yesterday 22:59
关于使用GROMACS模拟COF结构的疑问	分子模拟 (Molecular Modeling)	spinel yesterday 20:07	129	sobereva 8 min ago
关于ORCA手册中SF-TDDFT的查找CI Minima Between Excited States的疑问	量子化学 (Quantum Chemistry)	ABetaCarw yesterday 19:38	337	ABetaCarw yesterday 22:42
电荷密度文件如何修改？	第一性原理 (First-principles)	XxxXOO yesterday 18:28	119	sobereva yesterday 19:26
请教LAMMPS轨迹在VMD中分子显示不完整的问题	分子模拟 (Molecular Modeling)	qingqingBANG yesterday 16:37	240	Uus/pMeC6H4-/キ yesterday 19:08
求助吸附态*H与溶液中存在的OH负离子生成吸附态H2O分子过程的能量差计算	第一性原理 (First-principles)	不吃香菜 yesterday 15:29	00	不吃香菜 yesterday 15:29
求助：配体限制文件中的索引序号	分子模拟 (Molecular Modeling)	crush yesterday 15:23	124	sobereva yesterday 17:20
VMD绘制fukui函数图，着色与color bar上下限不一致	分子模拟 (Molecular Modeling)	xcgotk yesterday 15:12	118	sobereva yesterday 16:20
求助，使用GROMACS模拟疏水力的时候，模拟作用程和试验差别很大，审稿人问这个怎么回	分子模拟 (Molecular Modeling)	ljs yesterday 14:53	215	sobereva yesterday 16:50
DFT高估一系列CT复合物的结合自由能变，如何改进？	量子化学 (Quantum Chemistry)	andycheng2026 yesterday 13:20	244	sobereva yesterday 16:43
求不对称催化具体体系机理研究指导	量子化学 (Quantum Chemistry)	sword_blade yesterday 11:40	00	sword_blade yesterday 11:40
求助：相同的参数，vasp5.4.4能正常跑，刚装好的vasp6.5.1结构优化有大问题	第一性原理 (First-principles)	Marymass yesterday 09:52	342	灰飞的旋律 yesterday 14:36
准备用CP2K计算一个150个原子结构内水分子扩散的MSD，cutoff和realcutoff怎么选择	第一性原理 (First-principles)	yang543 yesterday 09:45	136	sobereva yesterday 16:27
用IRI可视化分子间弱相互作用如何处理	波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn)	1795467706 yesterday 09:08	18	sobereva yesterday 09:12
求助：无势垒的反应，扫描要断的化学键，发现电子能逐渐大于产物	量子化学 (Quantum Chemistry)	Gauss小白 yesterday 01:36	5110	Gauss小白 3 hour ago
使用gCP方法考虑BSSE时如何计算弱相互作用能？	量子化学 (Quantum Chemistry)	121089576 yesterday 00:45	371	sobereva 18 min ago
第一次优化未收敛后的再次优化与第一次结果差距较大是否正常？	第一性原理 (First-principles)	hlsc 前天 22:10	336	hlsc yesterday 07:29
镧系金属配合物单点能报错，对于赝势基组格式不确定	量子化学 (Quantum Chemistry)	声聚变前天 21:54	651	声聚变 yesterday 09:31
求助电催化下苯乙烯阳离子自由基的生成的解释	量子化学 (Quantum Chemistry)	Friday 前天 21:01	351	wzkchem5 yesterday 08:03
电催化催化剂表面添加带电水层，怎么使得水层带电	第一性原理 (First-principles)	cdhhh 前天 20:46	00	cdhhh 前天 20:46
求助含卤素有机小分子RESP电荷计算以及力场选择	分子模拟 (Molecular Modeling)	lts！前天 18:56	282	lts！ yesterday 21:25
应用Amber14SB力场失败	分子模拟 (Molecular Modeling)	milk_q 前天 18:17	249	student0618 yesterday 11:40
我想在体系内添加一定的离子（KMLCA等），但amber99.ff下ions.itp没有原子类型	分子模拟 (Molecular Modeling)	苏烟流光前天 17:25	356	sobereva yesterday 17:23
Chemkin敏感性分析可以用于水相中高级氧化过程吗？	化学 (Chemistry)	Vicky_Sugar 前天 16:03	429	Vicky_Sugar 前天 19:07
求助指导配置一台用于orca与gromacs模拟的电脑	硬件配置与采购 (Hardware Configuration and Procurement)	Tanghaoru 前天 15:56	3113	Aaron2099 yesterday 11:09
O1NumHess：只用常数个梯度计算数值Hessian的程序	量子化学 (Quantum Chemistry)	wzkchem5 前天 16:27	0101	wzkchem5 前天 16:27
有205个原子的分子在计算频率时退出	量子化学 (Quantum Chemistry)	lmyqwq 前天 14:13	246	lmyqwq 前天 17:50
计算XeF6负离子结果莫名报错的问题	量子化学 (Quantum Chemistry)	楚明城前天 12:39	1261	Uus/pMeC6H4-/キ前天 15:53
求助电解液体系能量最小化无法收敛	分子模拟 (Molecular Modeling)	Wxh18130507355 前天 12:04	655	Wxh18130507355 前天 21:47
伞形采样-关于水油界面作为参考组应该如何定义？	分子模拟 (Molecular Modeling)	YZR 前天 11:34	00	YZR 前天 11:34
求助金属蛋白构建簇模结构冻结选择	分子模拟 (Molecular Modeling)	小老弟前天 11:25	113	18217265596 前天 13:13
求助：利用ONIOM分层方法计算后，最后一帧能量突升20kcal/mol，请问该如何解决？	量子化学 (Quantum Chemistry)	yy呀前天 10:58	246	sobereva 前天 23:51
求助：磁矩分别设置z与-z方向后，能带有一部分缺失	第一性原理 (First-principles)	Mrsummer 前天 10:56	00	Mrsummer 前天 10:56
求助pyscf自定义哈密顿时是否可以传入自旋轨道基下的单双电子积分	量子化学 (Quantum Chemistry)	banxia 前天 10:23	123	hebrewsnabla 前天 18:58
求助：高斯优化叠氮二聚体，加不加色散结构优化结果完全不同，不确定优化是否加色散	量子化学 (Quantum Chemistry)	wanwan 前天 09:13	373	sobereva 前天 23:50
求助：原子丢失	分子模拟 (Molecular Modeling)	kidult 3 day ago	0101	kidult 3 day ago
运算结束的.log文件显示“Incomplete structures were deleted.“	量子化学 (Quantum Chemistry)	AlvinC 3 day ago	212	AlvinC 3 day ago
GROMACS2025.2使用hbond-legacy的-nhbdist结果所有氢的氢键数始终为0是怎么回事	分子模拟 (Molecular Modeling)	cpplh 3 day ago	459	cpplh 前天 10:00
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求助：请问高斯如何计算小分子的介电常数？	量子化学 (Quantum Chemistry)	Lisy 3 day ago	261	zjxitcc 前天 14:32
MS进行NVT模拟时数值无法改动	分子模拟 (Molecular Modeling)	叶落 3 day ago	261	叶落 yesterday 09:40
PBE0泛函计算ZrO2低估了带隙	第一性原理 (First-principles)	软哨豆米 3 day ago	483	软哨豆米 yesterday 11:06
sobtop基于m2Seminario方法产生的参数合理性问题	分子模拟 (Molecular Modeling)	TretopL 3 day ago	465	TretopL 前天 07:53
请问大家为什么用gview切晶面出现原子过近甚至重叠的现象？	量子化学 (Quantum Chemistry)	GauCPGro 3 day ago	228	GauCPGro 3 day ago
多肽穿越纳米孔前后电流没有发生改变	分子模拟 (Molecular Modeling)	人生若只如初见 3 day ago	00	人生若只如初见 3 day ago

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