简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

lufenghxu

sobereva 发表于 2018-10-16 01:26
轨道定域化方法和NBO的搜索方法在思想和实现上截然不同，你仔细看看下面这篇。定域化轨道在产生轨道的过 ...

老师经过对比发现，NBO的分析有些原子之间的化学键都没有显示出来。但是，orbital localization analysis能不能显示localized orbital的组成？还有能量的计算不知道哪儿有教程？另外，multiwfn计算给出的localized orbital有些内核轨道显示有问题，例如图1显示Cu原子的s轨道，图2是Cu原子的p轨道，不知道是什么问题。

sobereva

lufenghxu 发表于 2018-10-16 20:06
老师经过对比发现，NBO的分析有些原子之间的化学键都没有显示出来。但是，orbital localization analysis ...

目前最新版本multiwfn做完轨道定域化直接用就把轨道中起首要贡献的原子的贡献显示出来了。如果要更深入做分析，看
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131

怎么产生LMO轨道的能量这里写明了，例子也都给了
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380
手册里也写明了（Multiwfn的所有功能一定在手册里都有详细介绍）

默认的pipek-mezey方法给出的内核轨道有时候可能不太合理，可尝试Foster-Boys方法

不懂计算

sob老师，关于CDA分析，对复合物轨道H-3轨道进行分解，发现片段1的H-1轨道与片段2的L+15轨道的d值较大，说明这两条轨道发生了混合。那么混合的难易程度与这两条片段轨道的能级差有关系吗？ 相差1.49eV是否会较难发生混合？

Chenglong_li

sobereva 发表于 2018-10-14 00:35
Multiwfn默认在当前目录下找settings.ini，如果找不到，而且Multiwfnpath环境变量也没指向存放settings.i ...

确实奇怪，我又更新了3.6(dev) Last update: 2018-Oct-17，settings.ini是可以找到的。
推断可能是CentOS系统的问题，或者是设置的问题。

erya123

老师，multiwfn寻找B2H6的3c-2e轨道，但是结果找到了好多轨道，不知道为啥？
---- Current candidate orbital list, sorted according to occupation ----
26 Occ:  1.8311 Atom:   5B    6H    7H
25 Occ:  1.8410 Atom:   5B    6H    8H
24 Occ:  1.8520 Atom:   3H    5B    6H
23 Occ:  1.8644 Atom:   1B    3H    4H
22 Occ:  1.8706 Atom:   1B    2H    3H
21 Occ:  1.8770 Atom:   4H    5B    6H
20 Occ:  1.8863 Atom:   2H    5B    6H
19 Occ:  1.8913 Atom:   1B    3H    6H
18 Occ:  1.9013 Atom:   1B    3H    8H
17 Occ:  1.9215 Atom:   1B    3H    7H
16 Occ:  1.9848 Atom:   1B    3H    5B
15 Occ:  1.9875 Atom:   1B    5B    6H
14 Occ:  1.9899 Atom:   1B    4H    7H
13 Occ:  1.9899 Atom:   1B    5B    8H
12 Occ:  1.9906 Atom:   1B    4H    6H
11 Occ:  1.9906 Atom:   4H    5B    7H
10 Occ:  1.9913 Atom:   3H    5B    7H
  9 Occ:  1.9917 Atom:   1B    2H    5B
  8 Occ:  1.9918 Atom:   1B    4H    8H
  7 Occ:  1.9919 Atom:   1B    3H    4H
  6 Occ:  1.9925 Atom:   5B    6H    7H
  5 Occ:  1.9948 Atom:   2H    5B    7H
  4 Occ:  1.9957 Atom:   5B    7H    8H
  3 Occ:  1.9974 Atom:   1B    2H    4H
  2 Occ:  1.9977 Atom:   1B    5B    7H
  1 Occ:  1.9979 Atom:   1B    4H    5B

有点小冒失

大家有没有遇到过安装了GaussView 6.0 版本，然后打开opt文件里面的optimization不能使用的情况，哪位大神遇到过求解答

暗黑烧酒小圆

老师老师我用Multiwfn作出的等值面图f+不太会看。请问是正负等值面都大（蓝绿）的位点容易发生反应吗？后面附上我用7-1-1算的简缩Fukui函数。

sobereva

有点小冒失 发表于 2018-10-19 10:55
大家有没有遇到过安装了GaussView 6.0 版本，然后打开opt文件里面的optimization不能使用的情况，哪位大神 ...

帖子合并错了

此类简单问题直接到http://bbs.keinsci.com/thread-806-1-1.html提问。
一般不会有这种情况。如果确实碰到，输入文件压缩后上传

sobereva

erya123 发表于 2018-10-18 00:20
老师，multiwfn寻找B2H6的3c-2e轨道，但是结果找到了好多轨道，不知道为啥？
---- Current candidate orb ...

仔细看
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

里面详细说了挑轨道的过程。此乃正常情况

sobereva

不懂计算 发表于 2018-10-17 15:14
sob老师，关于CDA分析，对复合物轨道H-3轨道进行分解，发现片段1的H-1轨道与片段2的L+15轨道的d值较大，说 ...

和这个没有直接关系，和轨道形状关系更密切

sobereva

暗黑烧酒小圆 发表于 2018-10-19 16:34
老师老师我用Multiwfn作出的等值面图f+不太会看。请问是正负等值面都大（蓝绿）的位点容易发生反应吗？后面 ...

密度差图一看作的就不对，两个波函数文件坐标不对应
怎么分析手册4.5.4节有例子

暗黑烧酒小圆

sobereva 发表于 2018-10-19 17:41
密度差图一看作的就不对，两个波函数文件坐标不对应
怎么分析手册4.5.4节有例子

是的！我以为直接拿优化的中性分子的.out文件另存.gif后改电荷和多重态再算单点就完了。没注意到再保存的gif文件坐标也变了！感谢sob老师！

不懂计算

sobereva 发表于 2018-10-19 17:39
和这个没有直接关系，和轨道形状关系更密切

好的 谢谢sob大神

暗黑烧酒小圆

sobereva 发表于 2018-10-19 17:41
密度差图一看作的就不对，两个波函数文件坐标不对应
怎么分析手册4.5.4节有例子

老师，我看您的博文中http://sobereva.com/113有写到计算等值面图不需要加nosymm,可我在计算时用的的确是优化后的chk文件直接保存gif算单点的，为啥两个波函数分子坐标会不一致呢？

xiayu1985

图中显示的是MO轨道的一部分，multiwfn能不能给出图中，Cu和Ni之间形成的轨道是由Cu和Ni的哪些轨道形成的（Cu的像dz2），但是只是感官上是这样，能不能通过查询波函数来查询它主要是Cu和Ni的哪个轨道组合而成。另外还有比较low的问题，5个d轨道之间的空间位置是固定的吗？比如dxy旋转，dyz也会动。谢谢老师！