VASP的最简单的安装方法（含全程视频演示）

zorow

请问sob老师，我按您的上述方法进行到了ifort -V这步，但是在编译libfftw3xf_intel.a 的时候出现这种错误，是什么原因啊？(PS: 服务器中似乎以前装有14.0的库，不知是否对fftw的编译19.0有影响)
[root@localhost fftw3xf]# make libintel64
make -f  makefile lib _IA=intel64
make[1]: Entering directory `/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/inter
faces/fftw3xf'mkdir -p ./obj_intel
icc  -Wall -Werror  -I/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/include -I/o
pt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/include/fftw     -c /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/interfaces/fftw3xf/wrappers/fftw_alignment_of.c -o obj_intel/fftw_alignment_of.oerror #13003: message verification failed for: 28003; reverting to internal message
compilation aborted for /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/interfaces
/fftw3xf/wrappers/fftw_alignment_of.c (code 1)make[1]: *** [obj_intel/fftw_alignment_of.o] Error 1
make[1]: Leaving directory `/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/interf
aces/fftw3xf'make: *** [libintel64] Error 2

zorow

zorow 发表于 2019-1-10 13:15
请问sob老师，我按您的上述方法进行到了ifort -V这步，但是在编译libfftw3xf_intel.a 的时候出现这种错误， ...

找到问题了，似乎是之前编译Intel2019库少了东西？我重新编译了一遍，编译Intel2019时严格按照老师的视频选择需要的组件，就可以在后面成功编译fftw了，现在已经成功编译vasp了！按着视频无脑编译就行！

shiqiantao

请问出现undefined reference to "errfc"怎么解决？

Libesi

非常感谢，出错的时候，特别要注意，是不是有什么字母或者符号打错了。。。。

小苹果

sob老师好，前面认真按照介绍逐步完成，最后make all编译时出现如下错误怎么回事？已经安装Intel mpi库了，谢谢！机器的Linux版本是CentOS Linux release 7.2.1511。

mpiifort -free -names lowercase -assume byterecl -w -O2 -xhost -I/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/include/fftw -c openmp.f90
make[2]: *** No rule to make target `mpi.f90', needed by `mpi.o'.  Stop.
make[2]: Leaving directory `/home/gp/bin/vasp.5.4.4/build/std'
cp: cannot stat ‘vasp’: No such file or directory
make[1]: *** [all] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/gp/bin/vasp.5.4.4/build/std'
make: *** [std] Error 2

sobereva

小苹果 发表于 2019-1-27 17:31
sob老师好，前面认真按照介绍逐步完成，最后make all编译时出现如下错误怎么回事？已经安装Intel mpi库了， ...

从这上看不出来。如果源文件包内容齐全，严格按照帖子操作，理应不会有这个问题

cahndengbin

按视频操作，成功安装，多谢sobereva老师！

dt97511

我按照视频中的步骤安装好VASP5.4.4后，进行了对原胞的收敛性测试，准备开始进行正式的结构弛豫计算，但一开始计算就报错，主要是：
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
我网上看了一圈，设置方面的建议都试了下，不行，然后只剩下了vasp编译方面的建议
由于我是按照视频和教程安装的，对他们说的编译设置不是很懂，就直接换回了按照http://bbs.keinsci.com/thread-4267-1-1.html在centos6.6下安装的vasp5.4.1，发现能够正常计算
但我还是想用5.4.4版本，请问有人遇到过同样的问题吗，对视频中演示的安装方法，有没有什么简单点的解决方案

sobereva

dt97511 发表于 2019-2-25 17:50
我按照视频中的步骤安装好VASP5.4.4后，进行了对原胞的收敛性测试，准备开始进行正式的结构弛豫计算，但一 ...

把-xhost去掉再试，还不行把-O2改成-O1再试（去掉这俩都会降低性能），或者用CentOS 6.6按照我文中的做法编译5.4.4再试。我这里计算完全正常。

kaypu

Sob老师，您好，按照视频安装parallel_studio_xe_2019_update3_cluster_edition后，如果再root账户的bashrc中加入source opt/intel/parallel_studio_xe_2019/psxevars.sh后，则无法利用xftp软件登陆到服务器，但是ssh没有问题。只要在bashrc中去掉source opt/intel/parallel_studio_xe_2019/psxevars.sh 这句，就可以ftp上服务器。请问sob老师，这个问题怎么处理，非常感谢

sobereva

kaypu 发表于 2019-3-29 17:31
Sob老师，您好，按照视频安装parallel_studio_xe_2019_update3_cluster_edition后，如果再root账户的bashrc ...

把/opt/intel/parallel_studio_xe_2019/psxevars.sh里面的echo语句注释掉

alwens

obaica 发表于 2019-1-1 16:01

教育网免费半年啊

kaypu

sob老师，您好，目前用vasp计算任务，log文件中显示
**************************************************************
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000001571BD3  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread-2.17.s  00007F152D49C5D0  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000064D4D6  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000D8AA4D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000DEF5D3  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000013DA4FF  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000013B6DB6  Unknown               Unknown  Unknown
***************************************
可能是centos的堆栈太小，通过命令ulimit -s unlimited后，再提交任务，可以计算，不过opt十步后，就无法链接到服务器，任务也被ban掉了。目前不太清楚什么原因，感觉intel 编译器2019利用impi编译vasp有点问题

tianya126

虽然摸索了好久已经装好了。不过这个实在是太赞了，对初学者太有用了。

dt97511

sobereva 发表于 2019-2-26 00:34
把-xhost去掉再试，还不行把-O2改成-O1再试（去掉这俩都会降低性能），或者用CentOS 6.6按照我文中的做法 ...

终于抽空把系统由换回了centos7.6试了一下，但去掉-xhost，-O2改成O1,O0都不行，执行命令ulimit -s unlimited倒是可以算，但看到有大佬反映十多步后依然有问题，担心把服务器弄坏了，就又换回了centos6.6，依然按照该方法编译，结果编译不了，报错如下：
mkdir build/std ; \
        cp src/makefile src/.objects makefile.include build/std ; \
        make -C build/std VERSION=std all
mkdir: \u65e0\u6cd5\u521b\u5efa\u76ee\u5f55"build/std": \u6587\u4ef6\u5df2\u5b58\u5728
make[1]: Entering directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std'
rsync -ru ../../src/lib .
cp makefile.include lib
make -C lib -j1
make[2]: Entering directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/lib'
make libdmy.a
make[3]: Entering directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/lib'
make[3]: \u201clibdmy.a\u201d\u662f\u6700\u65b0\u7684\u3002
make[3]: Leaving directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/lib'
make[2]: Leaving directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/lib'
rsync -ru ../../src/parser .
cp makefile.include parser
make -C parser -j1
make[2]: Entering directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/parser'
make libparser.a
make[3]: Entering directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/parser'
icpc -D YY_parse_DEBUG=1 -c sites.cpp -o sites.o
icpc: error #10417: Problem setting up the Intel(R) Compiler compilation environment.  Requires 'install path' setting gathered from 'g++'
make[3]: *** [sites.o] \u9519\u8bef 1
make[3]: Leaving directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/parser'
make[2]: *** [all] \u9519\u8bef 2
make[2]: Leaving directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std/parser'
make[1]: *** [parser] \u9519\u8bef 2
make[1]: Leaving directory `/root/vasp.5.4.4/vasp.5.4.4/build/std'
make: *** [std] \u9519\u8bef 2
这种问题应该不是偶然，希望大佬能找出原因，进一步完善该安装方法，让以后的人少走点弯路。我现在急着用，还是自己老老实实的继续再编译一次5.4.1吧