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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量

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发表于 Post on 2022-7-19 16:45:46 | 只看该作者 Only view this author

老师,您好!我发现我把QM区域改为只有底物以后,单点算不了了。我可以把优化好的底物结构,放到高斯里算N,N+1,N-1状态下的单点嘛,这样算出来的是不是就不算是在酶环境下的结果啦

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-21 11:34:11 | 只看该作者 Only view this author
Hear 发表于 2022-7-19 16:45
老师,您好!我发现我把QM区域改为只有底物以后,单点算不了了。我可以把优化好的底物结构,放到高斯里算 ...

这只能体现酶环境对分子构象的影响,但体现不了酶环境的势场对底物电子结构的影响。要体现后者,至少要把酶的原子用背景电荷表现出来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-24 06:18:09 | 只看该作者 Only view this author
给本文增加了计算局部超软度(local hyper-softness)的说明
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发表于 Post on 2024-2-29 22:35:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-2-12 10:45
看屏幕上的提示。
所有平台上Gaussian算出来的wfn文件内容都是相同的

社长您好,我在生成了3个N,N+1,N_1文件,按照步骤设置了环境变量,结果我一输入字母,快速过了一些代码然后自动关闭,我在相应的路径下就没有看到其他文件的生成

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-29 23:25:24 | 只看该作者 Only view this author
LJZZZZ 发表于 2024-2-29 22:35
社长您好,我在生成了3个N,N+1,N_1文件,按照步骤设置了环境变量,结果我一输入字母,快速过了一些代码然 ...

Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

上文里搜 闪退
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发表于 Post on 2024-3-1 00:28:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-29 23:25
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

社长你好,我检查了我的gif文件,最后一行也加上了生成wfn文件的路径,但在muti中还是生成不出来。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-1 00:40:36 | 只看该作者 Only view this author
LJZZZZ 发表于 2024-3-1 00:28
社长你好,我检查了我的gif文件,最后一行也加上了生成wfn文件的路径,但在muti中还是生成不出来。

分清楚gif和gjf
没有叫muti的东西
自己看Gaussian输出文件内容判断,看不懂就把输入输出文件上传
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发表于 Post on 2024-3-1 00:45:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-1 00:40
分清楚gif和gjf
没有叫muti的东西
自己看Gaussian输出文件内容判断,看不懂就把输入输出文件上传

不好意思,muti wfn他不让我连续打出来,我用高斯输出wfn文件时总是卡在这个I302,而且还是新换的电脑,麻烦您帮我看一下

Multiwfn_3.out

11.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2024-3-1 00:47:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-1 00:40
分清楚gif和gjf
没有叫muti的东西
自己看Gaussian输出文件内容判断,看不懂就把输入输出文件上传

这是我的gjf文件

N.gjf

785 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-1 01:32:16 | 只看该作者 Only view this author
LJZZZZ 发表于 2024-3-1 00:45
不好意思,muti wfn他不让我连续打出来,我用高斯输出wfn文件时总是卡在这个I302,而且还是新换的电脑, ...

因为那叫Multiwfn,不叫mutiwfn。论坛不允许乱拼程序名的情况出现
默写10遍Multiwfn,并且认真看下文

计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-1 01:34:57 | 只看该作者 Only view this author
LJZZZZ 发表于 2024-3-1 00:47
这是我的gjf文件

gjf文件内容本身没问题

远程说不清楚,Multiwfn直接调用windows下Gaussian如果没法正常运行,就自己手动用Gaussian一个一个算gjf文件
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发表于 Post on 2024-3-1 13:09:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-1 01:32
因为那叫Multiwfn,不叫mutiwfn。论坛不允许乱拼程序名的情况出现
默写10遍Multiwfn,并且认真看下文

...

收到谢谢社长!

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发表于 Post on 2024-3-1 13:10:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-1 01:34
gjf文件内容本身没问题

远程说不清楚,Multiwfn直接调用windows下Gaussian如果没法正常运行,就自己手 ...

我是用Gaussian一个一个算,结果卡在I302.exe了,一直没有办法解决。

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发表于 Post on 2024-3-1 13:17:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-1 01:34
gjf文件内容本身没问题

远程说不清楚,Multiwfn直接调用windows下Gaussian如果没法正常运行,就自己手 ...

可以看一眼我的out文件,一直卡在了I302.exe,没有办法解决,我用的是09W这个版本,好像是说cpu跟软件不兼容,这个我也不太懂,不知道换16版本能不能解决

Multiwfn_3.out

9.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-2 06:30:38 | 只看该作者 Only view this author
LJZZZZ 发表于 2024-3-1 13:17
可以看一眼我的out文件,一直卡在了I302.exe,没有办法解决,我用的是09W这个版本,好像是说cpu跟软件不 ...

Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
这里该说的都说了
用64bit windows版Gaussian或者用linux版
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