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[波函数分析求助] 有机分子的CHELPG电荷分布如何计算与显示?一般常用计算小分子电荷是用什么电荷计算?

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发表于 2020-3-9 09:49:57 | 显示全部楼层 |阅读模式
请教一下有机分子的CHELPG电荷分布如何计算与显示
一般常用计算小分子电荷是用什么电荷计算,怎样计算。

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发表于 2020-3-9 11:15:10 | 显示全部楼层
看一下卢老师的以下文章、博文、幻灯片等

各种常用原子电荷的定义和对比
原子电荷计算方法的对比
http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/10.3866/PKU.WHXB2012281

Multiwfn波函数分析程序的意义、功能与用途
的4.6节
http://sobereva.com/184

幻灯片:Multiwfn与波函数分析简介
http://sobereva.com/multiwfn/res/brief_intro.pdf

看过上面两个文件就知道Multiwfn都能算什么类型电荷了。
如何显示电荷见
使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数
http://bbs.keinsci.com/thread-10163-1-1.html
不想装VMD的话也可以把Gaussian计算的任意带有电荷的输出文件里面的Mulliken电荷手动替换成计算的其他电荷,然后用GaussView查看。

拟合静电势的最佳RESP类电荷相关的博文:
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本
http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html
RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html

按照上面的文章,其他情况可以考虑首选ADCH电荷。

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 楼主| 发表于 2020-3-9 12:04:23 | 显示全部楼层
好的,谢谢您

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 楼主| 发表于 2020-3-9 15:16:09 | 显示全部楼层
snljty 发表于 2020-3-9 11:15
看一下卢老师的以下文章、博文、幻灯片等

各种常用原子电荷的定义和对比

您好,有没有中文的学习教程,我只是用来毕设,不是化学专业,看的很费劲。

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发表于 2020-3-9 15:54:36 | 显示全部楼层
wenwen 发表于 2020-3-9 15:16
您好,有没有中文的学习教程,我只是用来毕设,不是化学专业,看的很费劲。

除了那个slides上面不都是中文么...

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发表于 2020-3-9 20:22:58 | 显示全部楼层
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素及具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的不恰当标题“分子电荷分布计算”改了,以后务必注意
并且你的问题是求助,本版有专门的求助分类,因此不要选择“波函数分析交流”
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高水准的各种量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训,是提升计算化学研究水平的最佳选择。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯!培训相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》(http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html)。
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发表于 2020-3-9 20:23:46 | 显示全部楼层
wenwen 发表于 2020-3-9 15:16
您好,有没有中文的学习教程,我只是用来毕设,不是化学专业,看的很费劲。

继续问别人之前先把别人的回复好好看了,否则是对别人的严重不尊重

Multiwfn计算原子电荷在手册4.7节有非常明确的示例
如果只能看中文资料就根本别做计算化学,但凡做计算化学就必须能读英文资料,何况英语从小学就开始学,高考还考,难道白学了?
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 楼主| 发表于 2020-3-14 10:33:42 | 显示全部楼层
难道每个人都要一点点看吗?问一下也不行?

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发表于 2020-3-14 11:53:20 | 显示全部楼层
wenwen 发表于 2020-3-14 10:33
难道每个人都要一点点看吗?问一下也不行?

这个就好比你要找个东西,别人都告诉你在哪了,你去照着找就行,没有任何技术含量的过程。亲自不实践就让别人告诉你答案,就等同于你是需要一个手把手帮你实践的人了,这种你只能在你身边找,不适合在网上求助。ps:不喜勿喷

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用心去观察这纷纷扰扰的红尘

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发表于 2020-3-17 14:24:45 | 显示全部楼层
wenwen 发表于 2020-3-14 10:33
难道每个人都要一点点看吗?问一下也不行?

向别人要吃的,别人把美食都端到你眼前了,难道还要让人喂给你?向别人问路,别人给你指出了最好的捷径,还要让人背你过去?这是搞科研的人应有的学习和研究态度么?

好好看下文,端正搞科研、做学问、向他人求助的态度。如果觉得不适合搞科研,早点转行干别的,免得最后延期毕业。
在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://sobereva.com/79http://bbs.keinsci.com/thread-57-1-1.html
有感于如今许多超懒的科研工作者
http://sobereva.com/342http://bbs.keinsci.com/thread-3703-1-1.html
其中下面这段话正应景
有些人,给他回复了问题,指出该怎么做,或者该看什么资料,可对方几乎不去动脑、不看推荐的资料、不去google(用百度不算),直接继续没完没了不停地还追着问,恨不得非得让人家跟家教似的一步步指导自己发出来文章才算罢休。还有的人,甚至摆出类似这种态度:啊啊啊,我看了你的回复,可我就是不会,我就是没基础,你看怎么办?暗示你来给我解决吧。这叫搞什么科研?是他搞科研还是我替他搞?这些人没文章毕不了业真是活该。



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