使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-16 11:03:51

wavefunction123 发表于 2023-6-14 15:19
请教社长，这里所说的温度是指分子所处的环境温度，还是分子的平动温度，还是分子的内态温度？

基于的是理想气体近似模型，没有确切的环境的概念，本身也没有环境分子
平动、转动、振动态分布都对应相应温度

wavefunction123 · 发表于 Post on 2023-6-18 15:52:05

sobereva 发表于 2023-6-16 11:03
基于的是理想气体近似模型，没有确切的环境的概念，本身也没有环境分子
平动、转动、振动态分布都对应相 ...

谢谢

wangzh · 发表于 Post on 2023-7-13 10:16:32

老师您好，“本例涉及到的输入输出文件可以在这里下载：http://sobereva.com/attach/552/H2CO.zip”这个链接打不开，感谢老师！

sobereva · 发表于 Post on 2023-7-13 12:00:18

wangzh 发表于 2023-7-13 10:16
老师您好，“本例涉及到的输入输出文件可以在这里下载：http://sobereva.com/attach/552/H2CO.zip”这个链 ...

北京联通的网，能正常打开

fineren · 发表于 Post on 2023-7-26 22:40:21

在教材以及文献中，压力都用小写p，而非大写，应该是IUPAC规定的。建议手册和程序中也相应改过来

sobereva · 发表于 Post on 2023-7-26 23:47:34

fineren 发表于 2023-7-26 22:40
在教材以及文献中，压力都用小写p，而非大写，应该是IUPAC规定的。建议手册和程序中也相应改过来

这叫Sobereva's convention

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-10 19:25:04

本帖最后由 jingetiema6112 于 2023-8-12 17:40 编辑

卢老师您好，刚学习了这这篇文章。请问老师有些文献提及的 the standard molar heat capacity（ Cpm0）, standard molar entropy （Sm0） and standard molar enthalpy （Hm0）等系列热力学数据分别对应输出文件中哪部分呢

sobereva · 发表于 Post on 2023-8-10 23:22:44

jingetiema6112 发表于 2023-8-10 19:25
卢老师您好，刚学习了这这篇文章。请问老师有些文献提及的 the standard molar heat capacity（ Cpm0）, ...

Total CP
Total S
Sum of electronic energy and thermal correction to H

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-11 08:55:09

sobereva 发表于 2023-8-10 23:22
Total CP
Total S
Sum of electronic energy and thermal correction to H

收到，感谢卢老师解答

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-11 13:06:29

sobereva 发表于 2023-8-10 23:22
Total CP
Total S
Sum of electronic energy and thermal correction to H

卢老师，我还有一问，刚看了一篇文献，在298.15K下一个较大体系给出的the standard molar heat capacity（ Cpm0）, standard molar entropy （Sm0） and standard molar enthalpy （Hm0）分别是263.25 J/mol/K,663.72J/mol/K和61.05kJ/mol。其中standard molar enthalpy （Hm0）的数值感到比较困惑，该文献中的化合物体系较大，数值才61.05kJ/mol；但是程序包中自带示例体系虽然比较小，Hm0部分却是-114.164548*2525.5 kJ/mol，为什么相差这么大？恳请老师指点。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-8-11 15:16:00

jingetiema6112 发表于 2023-8-11 06:06
卢老师，我还有一问，刚看了一篇文献，在298.15K下一个较大体系给出的the standard molar heat capacity ...

大概率是能量零点不同。例如DFT算孤立体系，能量零点一般是所有原子核和电子距离无穷远的态；DFT算周期性体系，视软件不同，可能和孤立体系用的零点是一样的，也可能以所有原子距离无穷远且没有自旋极化的态为零点；做实验的人常常以单质的能量/焓为零点（这样得到的结果就是生成焓）。如果零点不同，那么结果的量级自然天差地别，好比有的程序说你身高1.8m，有的程序说你头顶处的海拔是1001.8m，有的程序说你头顶距离一楼地面11.8m，都对，但是三个数彼此之间不能比

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-11 20:14:26

wzkchem5 发表于 2023-8-11 15:16
大概率是能量零点不同。例如DFT算孤立体系，能量零点一般是所有原子核和电子距离无穷远的态；DFT算周期性 ...

感谢老师解答，我再学习下

奥利给 · 发表于 Post on 2023-9-8 07:14:42

老师好，请问如何计算相互作用体系的热力学数据，是只针对复合物进行还是分别对单体进行的？
计算相互作用能的公式是Eint=EAB-EA-EB，那么计算△G、△H、T△S的公式是否是△G=GAB-GA-GB、△H=HAB-HA-HB、T△S=TSAB-TSA-TSB？

sobereva · 发表于 Post on 2023-9-8 14:43:28

奥利给发表于 2023-9-8 07:14
老师好，请问如何计算相互作用体系的热力学数据，是只针对复合物进行还是分别对单体进行的？
计算相互作用 ...

是

黑色桃花 · 发表于 Post on 2023-9-15 17:21:03

卢老师，在4.1中计算单点能为什么用CCSD(T)/cc-pVTZ而不用热力学组合方法G4MP2-6X呢，这两个区别在哪呢，或许这么说，精度哪个更好，请您指教，谢谢您~

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