编写了一个过渡态寻找程序，求测试例子

mettlyz · 发表于 Post on 2024-9-9 21:59:37

风清木木发表于 2024-9-9 16:42
太酷了，支持一下楼主
可以找一个过渡态吗，是一个乙酰化的咪唑类物质加水水解生成乙酸和甲基咪唑的反应

xtb2下计算的，8核下花了47分钟
https://alphacat.deepchem.cn/sha ... 3c0bfacc18635f094d9
纯水下面应该比较困难，需要酸、碱催化的吧
建议登录一下这个平台，自己好好研究一下

风清木木 · 发表于 Post on 2024-9-10 09:02:20

mettlyz 发表于 2024-9-9 21:59
xtb2下计算的，8核下花了47分钟
https://alphacat.deepchem.cn/share#/detail/70120ff04bb043c0bfacc186 ...

谢谢大佬，好的，我去研究一下

YUANBAO · 发表于 Post on 2025-1-7 09:33:35

您好，能不能尝试算一下这个反应，断键:13 24；成键 :7 13，反应物xyz坐标放在附件中了

HATRE · 发表于 Post on 2025-1-7 15:55:14

YUANBAO 发表于 2025-1-7 09:33
您好，能不能尝试算一下这个反应，断键:13 24；成键 :7 13，反应物xyz坐标放在附件中了

SHGH · 发表于 Post on 2025-2-10 15:07:41

可以试一下这个反应吗，C40-H86断键，Ni1-H86成键。

HATRE · 发表于 Post on 2025-2-11 09:54:10

SHGH 发表于 2025-2-10 15:07
可以试一下这个反应吗，C40-H86断键，Ni1-H86成键。

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[算法与编程] 编写了一个过渡态寻找程序，求测试例子