编写了一个过渡态寻找程序，求测试例子

HATRE · 发表于 Post on 2023-12-8 10:44:34

本帖最后由 HATRE 于 2023-12-8 11:26 编辑

Walter 发表于 2023-12-7 19:00
楼主能帮忙找下抽氢反应的过渡态嘛，最近在找但一直没找出来。用的是M062x方法，6-31+g(d,p)的基组，断键原 ...

这个体系的自旋和电荷我看文件中写的是-1 2 ，确认一下哈

HATRE · 发表于 Post on 2023-12-8 10:45:43

本帖最后由 HATRE 于 2023-12-8 11:25 编辑

msbc 发表于 2023-12-7 15:16
您好，能否帮忙找一个过渡态。成键：4 8；断键7 8。

优化+频率：B97-3c
单点计算：PWPB95/def2-TZVPP

计算结果链接：

Walter · 发表于 Post on 2023-12-8 12:47:07

HATRE 发表于 2023-12-8 10:44
这个体系的自旋和电荷我看文件中写的是-1 2 ，确认一下哈

是的老师，这个是一个阴离子自由基抽氢反应，打算看一下能垒

DDb · 发表于 Post on 2023-12-20 09:39:38

本帖最后由 DDb 于 2023-12-20 09:48 编辑

老师您好想找一下NO3加成到苯胺胺基间位C上和与胺基直接相连的C上的过渡态还有NO3抽提胺基上的H的过渡态麻烦老师了

HATRE · 发表于 Post on 2023-12-22 14:00:45

DDb 发表于 2023-12-20 09:39
老师您好想找一下NO3加成到苯胺胺基间位C上和与胺基直接相连的C上的过渡态还有NO3抽提胺基上的H的过渡态 ...

给我一个简单的机理图吧

DDb · 发表于 Post on 2023-12-22 15:23:20

HATRE 发表于 2023-12-22 14:00
给我一个简单的机理图吧

老师就是苯胺与NO3反应2个加成一个H抽提

ionexchangeC · 发表于 Post on 2023-12-24 14:27:47

乙炔三聚成苯，如果需要的话我可以放上我自己找到的结果

HATRE · 发表于 Post on 2023-12-25 17:27:22

ionexchangeC 发表于 2023-12-24 14:27
乙炔三聚成苯，如果需要的话我可以放上我自己找到的结果

结构优化：B3LYP/6-31G(D,P)
单点能：M062X/DEF2-TZVP
计算结果链接：
https://alphacat.deepchem.cn/sha ... acd94ce1d32a2be6f9c

糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2023-12-27 11:13:19

老师您好，可以麻烦您找一下图中反应的过渡态吗？反应是图中的三元环C-C键断裂形成双自由基。谢谢您

myl · 发表于 Post on 2023-12-27 22:02:09

您好，可以计算自由基偶联过程中自旋极化单重态的过渡态吗?

HATRE · 发表于 Post on 2023-12-28 10:46:02

myl 发表于 2023-12-27 22:02
您好，可以计算自由基偶联过程中自旋极化单重态的过渡态吗?

可以发一下你想要计算的内容看看

myl · 发表于 Post on 2023-12-28 12:25:06

HATRE 发表于 2023-12-28 10:46
可以发一下你想要计算的内容看看

C:\Users\a\Desktop\1111.png
是这两个自由基偶联的自旋极化单重态的过渡态，麻烦您尝试一下可以吗？

HATRE · 发表于 Post on 2024-1-2 13:28:01

myl 发表于 2023-12-28 12:25
是这两个自由基偶联的自旋极化单重态的过渡态，麻烦您尝试一下可以吗？

计算结果可以做参考：
结构优化+频率计算：WB97X-D3/DEF2-SVP；
单点计算：PWPB95/DEF2-TZVPP
结果链接:https://alphacat.deepchem.cn/sha ... b8887d2935b35c8bfb1

myl · 发表于 Post on 2024-1-2 17:13:47

HATRE 发表于 2024-1-2 13:28
计算结果可以做参考：
结构优化+频率计算：WB97X-D3/DEF2-SVP；
单点计算：PWPB95/DEF2-TZVPP

好的，收到，谢谢

Sui1999 · 发表于 Post on 2024-1-2 17:46:22

你好，可以帮忙找一下这个酰胺结构在S1态的水解吗

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[算法与编程] 编写了一个过渡态寻找程序，求测试例子