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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-28 09:54:39 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2017-9-28 09:49
请问 输出文件中scf done对应的能量和Sum of electronic and zero-point Energies对应的能量有什么区别  另 ...

优化时候取最后一个,那个是对应最后一个结构的单点能。
Sum of electronic and zero-point Energies是单点能与ZPE的加和
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-28 09:55:57 | 只看该作者 Only view this author
tj2m 发表于 2017-9-28 09:26
大家好,本人刚接触高斯计算领域,用高斯计算Gd配合物的homo-lumo能级,但是尝试过很多办法都不收敛,看了s ...


各种解决不收敛的方法都得在理解原理的基础上尝试啊,没有万能的方法,干嘛光用5和6
另外,注意自旋多重度的设定。这体系确定基态是是单重态?如果是单重态,确定是闭壳层?博文里强调了,电子态非基态时不收敛的几率也比基态时往往要大。
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发表于 Post on 2017-9-28 10:15:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 tj2m 于 2017-9-28 10:16 编辑
我本是个娃娃 发表于 2017-9-28 09:53
第一,你的自旋多重度是否设置有问题?过渡金属一般都有很高的自旋态。
第二,用了何种基组何种赝势?问 ...

请问自旋多重度怎么判断,我的是中性分子,下面是我的基组,我的附件log文件有详细的信息
Gd 0
SDD
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C H N O 0
6-31G*
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发表于 Post on 2017-9-28 10:18:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-28 09:55
各种解决不收敛的方法都得在理解原理的基础上尝试啊,没有万能的方法,干嘛光用5和6
另外,注意自旋多 ...

我的是中性分子,请问是否是单重态或闭壳层该怎么判断?

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发表于 Post on 2017-9-28 10:51:20 | 只看该作者 Only view this author
tj2m 发表于 2017-9-28 10:15
请问自旋多重度怎么判断,我的是中性分子,下面是我的基组,我的附件log文件有详细的信息
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双核配合物,看来需要做对称性破缺计算了,看此文http://sobereva.com/82

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发表于 Post on 2017-9-28 11:08:10 | 只看该作者 Only view this author
我本是个娃娃 发表于 2017-9-28 09:54
1,第一个是自洽场收敛后得到的能量,第二个是经过零点能校正后得到的能量。
2,如果是优化这样的任务输 ...

谢谢大神

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发表于 Post on 2017-9-28 11:08:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-28 09:54
优化时候取最后一个,那个是对应最后一个结构的单点能。
Sum of electronic and zero-point Energies是 ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2017-9-28 11:23:49 | 只看该作者 Only view this author
请问  我用单机版G09 计算C60的单点能时 一直出错  百度了下是输入初问题了  但找不到问题所在  求教大神们  附件贴了输出和输入文件

C60.out

3.89 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

C60.gjf

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-28 13:04:30 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2017-9-28 11:23
请问  我用单机版G09 计算C60的单点能时 一直出错  百度了下是输入初问题了  但找不到问题所在  求教大神们 ...

nprocshard是nprocshared
不要用百度,搜出来的和计算化学有关的东西大部分都是错的,用google
windows 32bit版高斯直接设2GB 8成没法跑,设1500MB稳妥
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发表于 Post on 2017-9-28 14:07:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-28 13:04
nprocshard是nprocshared
不要用百度,搜出来的和计算化学有关的东西大部分都是错的,用google
windows ...

感谢老师的解答

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发表于 Post on 2017-9-28 15:35:17 | 只看该作者 Only view this author
请问Sob老师,在不同DFT泛函的HF成分一览中提到的泛函,在Gaussian中具体的关键词在哪里有呀?

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发表于 Post on 2017-9-28 16:56:08 | 只看该作者 Only view this author
还有,1.对于TPSSh以及TPSS1KCIS泛函,在Gaussian中进行激发态计算时总会出现“ Invalid value of MaxDer in TPSSx”,这是为什么?
2.O3LYP在G09D版本中运行则出现“Different local and non-local exchange scaling not allowed for this functional”,这又是哪里有问题?
多谢Sob老师了。

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发表于 Post on 2017-9-28 17:34:30 | 只看该作者 Only view this author
大家好,本人刚开始 学习高斯,计算Si8O13H8和AsO的吸附,几何优化采用的是b3lyp/6-31g*,对AsO几何优化时用了SDD基组,请问计算能量采用什么方法和机组比较好呢?希望得到大家的指导与帮助,谢谢~

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发表于 Post on 2017-9-28 21:15:17 | 只看该作者 Only view this author
sob老师:
我采用cbs-qb3对苄基进行单点能计算,但电脑与服务器上得到不同的两种构型,相应的单点能也有所差异。
您教材里写到热力学组合方法计算不需要预先优化分子结构,直接计算,
那么这种区别是什么原因造成,该怎么避免优化到错误的结构。

ph-CH2.log

458.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

C6H5CH2.out

601.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2017-9-28 21:15:18 | 只看该作者 Only view this author
大家晚上好!现请教如下:用高斯09算某分子的吸收光谱,第一次算失败了,out文件提示用531MW内存;加大内存后,出现如图中的错误,out文件无错误提示。
第一次输入文件命令(此命令分别算成功了另外两个分子量小150和分子量大160的分子):
%chk=D1-1S-TD.chk
%mem=150MW
%rwf=loc1,2000mb,loc2,2000mb,loc3,2000mb,loc4,2000mb,loc5,2000mb,loc6,2000mb,loc7,2000mb,loc8,2000mb,loc9,2000mb
%nprocshared=3
# td=(nstates=30) b3lyp/6-31g(d) scrf=(pcm,solvent=thf)

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