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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-11-29 15:58:33 | 只看该作者 Only view this author

gaussian问题

用gaussian计算TDDFT的第一个激发态能量是负值(开壳层结构),,请问有什么关键词可以使它不是负值?

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发表于 Post on 2017-11-29 16:09:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-28 19:26
$NBO ... $END之间的关键词是传递给NBO模块的关键词,去看NBO手册就明白了。
NBO官网上有很多资源,NB ...

老师,如何使gaussian09调用NBO6.0,而不是调用内置的模块呢?g09,NBO6.0都是安装在linux(ubuntu)平台。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-29 17:12:13 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-11-29 16:09
老师,如何使gaussian09调用NBO6.0,而不是调用内置的模块呢?g09,NBO6.0都是安装在linux(ubuntu)平台。


pop=nbo6

NBO压缩包里肯定有安装说明
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-29 17:13:22 | 只看该作者 Only view this author
彭索萍 发表于 2017-11-29 15:58
用gaussian计算TDDFT的第一个激发态能量是负值(开壳层结构),,请问有什么关键词可以使它不是负值?


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-11-29 18:44:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-28 22:21
1 用stateaverage就用态平均,默认不用
2 否。用不用态平均,都会基于活性空间产生一批组态函数,只不 ...

老师,我还是有点不大明白,比如实际基态是三个电子态的组合,权重分别是c1^2=0.1 c2^2=0.1 c3^2=0.8,用了或者不用态平均,结果会是什么样呢?

另外,在高斯中用了casscf方法计算得到的结果文件中,显示eigenvalue为0是怎么回事啊?轨道没有能量?

谢谢老师麻烦您了

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发表于 Post on 2017-11-29 21:58:14 | 只看该作者 Only view this author

求助使用新型溶剂

各位老师,学生在gaussian09中考虑溶剂化效应,在对于新型溶剂需要考虑哪些参数,以及如何进行设置呢?(学生第一次进行溶剂化效应的计算)谢谢。

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发表于 Post on 2017-11-29 22:00:45 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2017-11-29 23:23:17 | 只看该作者 Only view this author
想问下sob老师怎么做ECD。看了下相关文章,先是构象搜索,再是优化,最后拟合。但如何操作,仍是一头雾水。恳请sob老师指导一下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-30 01:06:13 | 只看该作者 Only view this author
paradise 发表于 2017-11-29 23:23
想问下sob老师怎么做ECD。看了下相关文章,先是构象搜索,再是优化,最后拟合。但如何操作,仍是一头雾水。 ...

构象搜索:
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2388

ECD绘制:
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD和VCD光谱图
http://sobereva.com/224

构象权重平均:
根据Boltzmann分布计算分子不同构象所占比例
http://sobereva.com/165
使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱
http://sobereva.com/383
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-30 01:06:28 | 只看该作者 Only view this author
布清 发表于 2017-11-29 21:58
各位老师,学生在gaussian09中考虑溶剂化效应,在对于新型溶剂需要考虑哪些参数,以及如何进行设置呢?(学 ...

里面写了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
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lastzealot 发表于 2017-11-29 18:44
老师,我还是有点不大明白,比如实际基态是三个电子态的组合,权重分别是c1^2=0.1 c2^2=0.1 c3^2=0.8,用 ...


CASSCF迭代过程是最小化能量的过程,各个根的权重决定了被最小化的能量是怎么线性组合而成的
CASSCF得到的是赝正则轨道,没有对应的能量
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发表于 Post on 2017-11-30 06:36:31 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,结合multifunction,在高斯中用TDC的方法计算transition density, 应该怎么写keyword?下面的如果都不合适,怎么写更好?

1.
# geom=allcheck guess=(read,only) density=(checkpoint,transition=1) cube=full

2.
geom=allcheck guess=read density=transition=1 iop(6/8=3)

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发表于 Post on 2017-11-30 09:31:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-30 01:08
CASSCF迭代过程是最小化能量的过程,各个根的权重决定了被最小化的能量是怎么线性组合而成的
CASSCF得 ...

1. 您的意思是:casscf得不到轨道的能量,只能得到体系的总电子能量,并且各个态的权重决定了总波函数,从而决定了体系能量值。这么理解对吧?

2.用了casscf方法,就不能绘制轨道能级图了,是吧?

3. 那么,用了态平均和不用态平均得到的能量也不一样了?在态平均方法中,手册好像写道需要人为设置权重,那么不同权重下得到的体系能量也不会一样了,对吗?

谢谢老师

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发表于 Post on 2017-11-30 10:11:30 | 只看该作者 Only view this author

困扰我一个月的问题解决了,谢谢

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发表于 Post on 2017-11-30 10:13:01 | 只看该作者 Only view this author
布清 发表于 2017-11-29 21:58
各位老师,学生在gaussian09中考虑溶剂化效应,在对于新型溶剂需要考虑哪些参数,以及如何进行设置呢?(学 ...

加关键词SCRF=(solvent=哪种溶剂)

本版积分规则 Credits rule

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