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我对计算化学一直保持浓厚的兴趣，常在论坛学习。研究生毕业后（研究生期间实验为主），自己终于有机会购买计算机做自己喜欢的研究。对比（Xeon 8275CL双路当时几家报价都在34000左右）和纠结好久后于2021年10月20日在*宝购买一套服务器，配置如下: CPU Xeon 8375C(步进6，主频2.8G，实测满载3.3G）x 2，
内存三星ECC 16G(3200 MHz）x 16，
主板 超微X12DPI-N，
电源海韵GX 1300W，
固态PM983 1.92T U.2转PCI,
散热 猫头鹰4189 U12 x2 搭配NF-A12X25 PWM风扇x4
机箱 先马黑洞玻璃侧透版 机箱自带两把12厘米风扇。
无税价格：36700元 （店家在windows10专业版烤机三天后发货）
作为新手，买到后自己使用软件满载烤机两天也没有出现问题，就装了centos 8.3系统。接下来，自己将遇到一系列问题与大家分享，避免掉坑里。
（1) 装完系统装vasp 6.1，发现intel 2019 update 1和intel 2020 update 4，在跑大体系是都会出现mpi内存泄漏被localhost杀掉，并且与Intel2019 update 1相比，intel 2020 update 4在同样体系中，计算速度慢了近30%。最后在QQ群求助，解决方法就是换用intel 2018 update1(ifort 18.0.5)，后来同时编译vaspsol optcell vtst也能顺利通过，相比xeon 8280双路（centos 7.9, intel 2019 update1,vasp 6.1)，满载速度提升在1.5-1.8倍。
（2）cp2k在MD大体系中速度太诱人了，就按照社长博文(http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html)安装cp2k 8.2。采用toolchain结合intel 2018 update1 MKL数据库，gcc， intel mpi并行使用，速度和稳定性最好。另外采用博文（http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html）里面SiC杂化泛函例子，相比较与E5 2696V3双路，计算耗时在3.5倍左右的提升。升级到cp2k 9.1过程中，编译elpa，总是不过，后来发现是elpa脚本默认采用ifort编译会打补丁，注释掉就能顺利编译通过，实测两个版本的速度差别不大，并且在GLOBAL部分不添加PREFERRED_DIAG_LIBRARY SL，也不会出现优化卡住的现象（http://bbs.keinsci.com/thread-25553-1-1.html）。曾经尝试singularity运行cp2k 8.2，总是singularity出现路径报错，后才google才智，可能是centos 8.3系统的问题，新版singularity（换名字了）没有测试。
(3) 想安装Ambertools来产生拓扑文件，换用各种版本的ambertools编译过程总和intel mpi 冲突，导致cp2k和vasp无法使用，即使相应bashrc部分注释掉也不无法顺利编译。好在社长sobtop博文（http://bbs.keinsci.com/thread-27803-1-1.html）给我找到解决方法，直接安装sobtop就行，功能更强大。结合RESP计算电荷，简单的操作方法给我这样的小白带来福利。
（4）gromacs 2020.8 按照博文（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）编译必须采用cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/your/path/,亲测在centos8.1，8.3和8.5都要这样编译，结合-DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON这样不容易出现报错，并且编译会自动使用CPU AVX512指令集。
（5）X12DPI-N主板CPU1没有mos散热片，在这个机箱中发现CPU1 mos温度能到100度，甚至105度。CPU2 mos温度满载运行也在90以上，甚至能到97度。可能还是该主板供电设计用料的问题，正在定做散热片。
（6）先马黑洞玻璃侧透机箱对于这种配置需要加装额外的散热风扇，本机箱散热CPU风扇从下往上，其他风扇从前往后吹风。使用一段时间后，现发CPU温度在85度左右，又在机箱顶部和机箱后面增加3把NF-A12X25 PWM，此后CPU温度满载稳定在75度左右，很多时候稳定在70度以内。满载噪声稳定40分贝。建议选用追风者614机箱，风道设计也更合理，存储扩展空间大。
（7）CPU功率真是大。满载运行cp2k 9.1 cp2k.popt 760W，g16 830W（g16.c.01 avx2)，vasp 6.1 730W。所以选择该配置必须选好电源。要是加装GPU，电源最少1600W。现在Xeon 8375C（300W）正式版价格和ES差距不大，建议正式版。
以上是本人使用该配置以来的感受，所遇到的问题和挑战在论坛和QQ群都能得到回复和解答，在此万分感谢。作为一名兴趣驱使的计算小白，期待cp2k培训班（希望我有时间参加）。
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发表于 Post on 2022-2-19 14:56:18
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