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楼主 Author: sobereva
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[Gaussian/gview] Gaussian的安装方法及运行时的相关问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-12 05:26:11 | 只看该作者 Only view this author
dreamyeye 发表于 2018-9-11 21:12
sob老师,本来能正常使用G16,现在突然运行nohup g16 XX.gjf &时,在nohup.out文件中出现了如下内容,暂时 ...

先别加nohup和&,看是什么情况。如果产生了log文件,看里面有什么信息
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发表于 Post on 2018-9-13 15:58:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-12 05:26
先别加nohup和&,看是什么情况。如果产生了log文件,看里面有什么信息

谢谢,已经搞定了,另外看到有的教程里说在解压完了以后有“./bsd/install”这一步,我发现我无论做不做这一步,都可以正常使用G16,请问sob老师,这一步有什么用呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-14 05:20:36 | 只看该作者 Only view this author
dreamyeye 发表于 2018-9-13 15:58
谢谢,已经搞定了,另外看到有的教程里说在解压完了以后有“./bsd/install”这一步,我发现我无论做不做 ...

所以如文章一开始的红字所说,那些教程都是坑爹的,毒害无数人,这是我为什么要写这篇以正视听的原因
打开这文件一看就知道运行这步根本毫无意义
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发表于 Post on 2018-9-14 09:32:35 | 只看该作者 Only view this author
dreamyeye 发表于 2018-9-13 15:58
谢谢,已经搞定了,另外看到有的教程里说在解压完了以后有“./bsd/install”这一步,我发现我无论做不做 ...

这个貌似是linda跨节点并行版才需要做的。没有linda就不需要。现在很少有买带linda的了。

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发表于 Post on 2018-9-14 12:54:03 | 只看该作者 Only view this author
void 发表于 2018-9-14 09:32
这个貌似是linda跨节点并行版才需要做的。没有linda就不需要。现在很少有买带linda的了。

谢谢,我在install这个文件里看到了“linda”的字样。

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发表于 Post on 2018-9-21 11:27:25 | 只看该作者 Only view this author
在一个user下将gaussian配置在了/data下,使用另一user访问时,提示-bash: /data/g16/bsd/g16.profile: 权限不够,请问应该如何处理这个问题?多谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-21 12:11:54 | 只看该作者 Only view this author
Chenglong_li 发表于 2018-9-21 11:27
在一个user下将gaussian配置在了/data下,使用另一user访问时,提示-bash: /data/g16/bsd/g16.profile: 权 ...

把那个user设成和之前那个user相同的组,并且把gaussian目录下的文件设成同组成员都可以访问
要么就索性把Gaussian在那个user的组下面也装一份
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发表于 Post on 2018-9-22 13:18:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-21 12:11
把那个user设成和之前那个user相同的组,并且把gaussian目录下的文件设成同组成员都可以访问
要么就索性 ...

加入相同的组,将gaussian目录权限从750更改为770

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发表于 Post on 2018-9-23 10:44:55 | 只看该作者 Only view this author
十分有用的教程,学习了

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发表于 Post on 2018-9-29 21:07:11 | 只看该作者 Only view this author
运行Gaussian16总是出现如图提示然后计算中断,相关输出文件见附件,请问这是什么原因造成的呢?

Capture.JPG (297.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 143)

Capture.JPG

Test1.log

28.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-29 21:46:45 | 只看该作者 Only view this author
月光夸克 发表于 2018-9-29 21:07
运行Gaussian16总是出现如图提示然后计算中断,相关输出文件见附件,请问这是什么原因造成的呢?

仔细看当前帖子,里面已经说明了
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发表于 Post on 2018-9-29 22:25:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-29 21:46
仔细看当前帖子,里面已经说明了

根据我读贴的理解,这可能是由于高斯版本和CPU架构不对应导致的,请问除了更换高斯版本还能有什么好的办法可以尝试吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-29 22:27:07 | 只看该作者 Only view this author
月光夸克 发表于 2018-9-29 22:25
根据我读贴的理解,这可能是由于高斯版本和CPU架构不对应导致的,请问除了更换高斯版本还能有什么好的办 ...

怎么解决文中说了,要么在支持更新指令集的机子上运行,要么换成不是基于那么新指令集编译的Gaussian,别无它法
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发表于 Post on 2018-11-7 10:51:32 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 biogon 于 2018-11-7 11:25 编辑

@灰飞的旋律  WSL你遇到过zsh: command not found: g09的错误吗,我已经添加了你之前增加的那行代码

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发表于 Post on 2018-11-7 12:34:35 | 只看该作者 Only view this author
学习了,以前是在各个网上看了好多教程,都是抄来抄去,关键还不全。

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