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楼主 Author: sobereva
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[Gaussian/gview] Gaussian的安装方法及运行时的相关问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-1 02:14:43 | 只看该作者 Only view this author
a617788816 发表于 2020-1-30 23:24
我检查过是有的,如图CC右下角。 我发现当我给l1.exe单独添加可执行权限,又出现了另外的报错如图DD,gaus ...

尝试其它chmod设置,反正别所有组都有可执行权限
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发表于 Post on 2020-5-7 21:42:45 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,请问我按您的方法在win10中linux子系统中安装了gaussian09,但是在运行 g09 XX.gjf &时出现如下内容,请问是什么原因造成的呢?谢谢~

PGFIO/stdio:Bad file descriptor
PGFIO-F-/formatted read/unit=5/error code returned by host stdio - 9.
File name = stdin     formatted, sequential access   record = 1
In source file rdcard.f, at line number 13
  g09() [0x42ba08]
  g09() [0x424745]
  g09() [0x419f06]
  g09() [0x413d78]
  g09() [0x404257]
  g09() [0x40358d]
  /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(__libc_start_main+0xf3) [0x7f1e9adf70b3]
  g09() [0x403489]

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-8 08:50:59 | 只看该作者 Only view this author
heiheihaha 发表于 2020-5-7 21:42
sob老师,请问我按您的方法在win10中linux子系统中安装了gaussian09,但是在运行 g09 XX.gjf &时出现如下内 ...

无法判断。本文的做法并不完全适用于WSL,只能作为参考
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-5-8 16:14:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-5-8 08:50
无法判断。本文的做法并不完全适用于WSL,只能作为参考

好的,谢谢老师~

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发表于 Post on 2020-5-8 17:59:34 | 只看该作者 Only view this author
heiheihaha 发表于 2020-5-7 21:42
sob老师,请问我按您的方法在win10中linux子系统中安装了gaussian09,但是在运行 g09 XX.gjf &时出现如下内 ...

你找到的版本,无法在你的系统平台下运行。

类似于,你不能让微软平板运行电脑上的Office一个道理。

换一个正经的Linux系统试试吧。
那种开玩笑耍猴一样的子系统,看看就行了,干活就算了吧。
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发表于 Post on 2020-5-8 19:39:21 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2020-5-8 17:59
你找到的版本,无法在你的系统平台下运行。

类似于,你不能让微软平板运行电脑上的Office一个道理。  ...

嗯嗯,谢谢,现在在安装虚拟了~

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发表于 Post on 2020-5-16 22:55:23 | 只看该作者 Only view this author
wang的女人 发表于 2019-1-4 13:34
太感激您了,经过检查发现是我安装过程出错了。连菜鸟都算不上的小白能从中收益很多,感恩

我也遇到了和您一样的情况,我没有发现我的安装过程哪里出错了,您当时是哪里出错了?

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发表于 Post on 2020-6-28 20:45:30 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,根据您的这个帖子在linux 下安装高斯16C01 ,高斯16C01 一共有5个压缩包(Gaussian_16_C.01_AVX_Linux_x64.part1,   Gaussian_16_C.01_AVX_Linux_x64.part2, Gaussian_16_C.01_AVX_Linux_x64.part3    ,Gaussian_16_C.01_AVX_Linux_x64.part4,  Gaussian_16_C.01_AVX_Linux_x64.part5 ,解压后变成合成一个名为G16-C01-AVX_Downloadly.ir.tbj的文件,这个文件怎么也打不开,运行g16 <test.gjf> test.out时,说是找不到g16命令,请问是怎么回事呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 00:58:35 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2020-6-28 20:45
老师,您好,根据您的这个帖子在linux 下安装高斯16C01 ,高斯16C01 一共有5个压缩包(Gaussian_16_C.01_AV ...

你都没装好怎么能用g16命令
先解压tbj文件包再安装
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发表于 Post on 2020-7-15 16:31:43 | 只看该作者 Only view this author
dreamyeye 发表于 2018-9-11 21:12
sob老师,本来能正常使用G16,现在突然运行nohup g16 XX.gjf &时,在nohup.out文件中出现了如下内容,暂时 ...

打搅您了 我也遇到了这个问题 请教您这个问题是如何解决的呢

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发表于 Post on 2020-7-17 23:20:18 | 只看该作者 Only view this author
yinhang 发表于 2020-7-15 16:31
打搅您了 我也遇到了这个问题 请教您这个问题是如何解决的呢

好像已经解决了,但是确实已经很久了,忘了怎么解决的了

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发表于 Post on 2020-8-14 19:17:09 | 只看该作者 Only view this author
我加上tail -f test.out后就会出现“ addr2line: g16: 无此文件”,如果不加是可以正常计算的

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发表于 Post on 2020-10-11 07:51:35 | 只看该作者 Only view this author
最近因为其他原因重装整个Ubuntu系统,于是装了G16 C.01
按照sob老师说法添加"export GAUSS_SCRDIR=/home/han/Gaussian/scratch"后,依然出现临时文件在运行文件夹,而不是scratch文件夹的情况。
别的运行正常,包括g16, formchk, gv等命令。
请问如何解决?
谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-13 06:43:05 | 只看该作者 Only view this author
望月凝香 发表于 2020-10-11 07:51
最近因为其他原因重装整个Ubuntu系统,于是装了G16 C.01
按照sob老师说法添加"export GAUSS_SCRDIR=/home/ ...

运行echo $GAUSS_SCRDIR看看到底环境变量生效没有
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发表于 Post on 2020-10-16 19:57:13 | 只看该作者 Only view this author

电脑重新做系统了,
这次我按照文章里说的安装,发现单独打开GaussView 不会出现这个警告窗口,而且先打开GaussView,再打开 gif文件也没警告对话窗,但是直接打开gif文件会跳这个警告窗口是咋回事啊
点了ok之后又还能用......

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