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楼主 Author: sobereva
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[Gaussian/gview] Gaussian的安装方法及运行时的相关问题

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发表于 Post on 2019-7-30 09:03:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-29 22:40
你都没写输入文件,显然什么都不给你算。怎么运行在文中已经写明了。

嗯呐,谢谢sob老师,但是输入文件后也出现这样的错误

12.png (112.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 156)

12.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-30 09:57:15 | 只看该作者 Only view this author
帅金1号 发表于 2019-7-30 09:03
嗯呐,谢谢sob老师,但是输入文件后也出现这样的错误

显然路径输错了
分清楚gif和gjf
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发表于 Post on 2019-7-30 10:05:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-30 09:57
显然路径输错了
分清楚gif和gjf

那第一个com文件运行时的错误了,gif的文件他读不了,com文件运行时有错误

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-30 21:07:48 | 只看该作者 Only view this author
帅金1号 发表于 2019-7-30 10:05
那第一个com文件运行时的错误了,gif的文件他读不了,com文件运行时有错误

看输出文件啊
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发表于 Post on 2019-8-13 23:28:49 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,请问我按这种方法安装好Gaussian 09 D01后,在安装完成后运行Gaussian自带的test0000.com文件没问题,在提交自己编写的gjf后,系统立即死机。请问这种问题应该如何解决?
系统是Cent OS 7.7
电脑配置:Intel Xeon Platinum 8171M CPU @ 2.30GHz x104
                RAM 128 GiB
                GPU GeForce RTX 2060

任务:
%chk=TATAopt.chk
%nprocshared=24
%mem=20GB
# opt=(calcfc,cartesian) 6-31g(d) m062x

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-13 23:58:55 | 只看该作者 Only view this author
q_7997 发表于 2019-8-13 23:28
Sob老师,请问我按这种方法安装好Gaussian 09 D01后,在安装完成后运行Gaussian自带的test0000.com文件没问 ...

死机这种事极其诡异。建议你再多试试其它的任务,弄清楚是机子有问题还是软件环境有问题
你的关键词本身没毛病
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-5 09:12:00 | 只看该作者 Only view this author
新补充内容
注意,当设定的并行核数超过64时,至少对于Gaussian 16 B.01及之前的版本来说,Gaussian一上来就会报错。解决办法是在~/.bashrc里添加比如export OMP_THREAD_LIMIT=300,这样就把并行核数上限提升到300了,因此就可以使用超过64核并行了。
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发表于 Post on 2019-12-17 21:10:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hmlyz 于 2019-12-17 21:13 编辑

老师,我按照您文章里的步骤操作,最后打不开,请问是什么原因呢?

2.png (244.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 160)

2.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-19 18:07:15 | 只看该作者 Only view this author
hmlyz 发表于 2019-12-17 21:10
老师,我按照您文章里的步骤操作,最后打不开,请问是什么原因呢?

8成是g16放的目录和你设的不符,要不然不会提示找不到g16.profile
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发表于 Post on 2019-12-20 11:17:30 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,请问在安装gv后,出现了这个错误:
[naonao5205@localhost ~]$ gv
gview.exe: symbol lookup error: gview.exe: undefined symbol: _ZN5Qwt3D11SurfacePlot16staticMetaObjectE
这时候我的变量是这样设置的:
export GV_DIR=/home/naonao5205/tools_pkg/gv
export PATH=$PATH:/home/naonao5205/tools_pkg/gv
alias gv=gview.exe
在查阅了一些帖子后,仍然不知道_ZN5Qwt3D11SurfacePlot16staticMetaObjectE对应的含义,请问sob老师知道吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-20 12:56:41 | 只看该作者 Only view this author
naonao5205 发表于 2019-12-20 11:17
sob老师您好,请问在安装gv后,出现了这个错误:
[naonao5205@localhost ~]$ gv
gview.exe: symbol looku ...

应该是和机子里的某些库不兼容
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发表于 Post on 2019-12-20 20:08:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-20 12:56
应该是和机子里的某些库不兼容

感谢sob老师回复
现在已近解决了,yum install mesa-libGL-devel即可(我是centos8)

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发表于 Post on 2020-1-30 19:53:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 a617788816 于 2020-1-30 20:10 编辑
sobereva 发表于 2019-12-20 12:56
应该是和机子里的某些库不兼容

sob老师您好。我按照您的教程安装后,环境变量设好,也给设置了权限chmod 750 -R *,但出现如下报错。觉得应该是权限问题,这如何解决呢?

AA.png (52.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 160)

AA.png

BB.png (22.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 147)

BB.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-30 22:32:10 | 只看该作者 Only view this author
a617788816 发表于 2020-1-30 19:53
sob老师您好。我按照您的教程安装后,环境变量设好,也给设置了权限chmod 750 -R *,但出现 ...

仔细看看g16目录下到底有没有l1.exe,没有的话说明压缩包不完整
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发表于 Post on 2020-1-30 23:24:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 a617788816 于 2020-1-31 15:00 编辑
sobereva 发表于 2020-1-30 22:32
仔细看看g16目录下到底有没有l1.exe,没有的话说明压缩包不完整

我检查过是有的,如图CC右下角。 我发现当我给l1.exe单独添加可执行权限,又出现了另外的报错如图DD,gaussian无法正常运行,应当如何解决呢?

CC.png (79.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 141)

CC.png

DD.png (52.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 154)

DD.png

本版积分规则 Credits rule

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