量子化学程序ORCA的安装方法

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-6 15:45:20

luzujia 发表于 2021-12-6 01:58
安装的是openmpi411。所有输出文件已上传

同一个算例如果只用一个核跑，会报相同的错误吗？

luzujia · 发表于 Post on 2021-12-6 17:11:41

本帖最后由 luzujia 于 2021-12-6 17:21 编辑

wzkchem5 发表于 2021-12-6 15:45
同一个算例如果只用一个核跑，会报相同的错误吗？

用一个核跑不会报错。老师，会不会是gfortran没有正确安装？我是用yum命令装的。查看版本信息如下

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-6 17:26:17

luzujia 发表于 2021-12-6 10:11
用一个核跑不会报错。老师，会不会是gfortran没有正确安装？我是用yum命令装的。查看版本信息如下

你看一下这个方法有没有帮助 https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=7866

luzujia · 发表于 Post on 2021-12-6 17:29:12

wzkchem5 发表于 2021-12-6 17:26
你看一下这个方法有没有帮助 https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=7866

好的，谢谢老师~

luzujia · 发表于 Post on 2021-12-6 17:36:30

wzkchem5 发表于 2021-12-6 17:26
你看一下这个方法有没有帮助 https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=7866

老师，这个方法指的是在编译的时候加--disable-builtin-atomics ? 我在按本贴安装的时候就已经加了呀

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-6 18:20:07

luzujia 发表于 2021-12-6 10:36
老师，这个方法指的是在编译的时候加--disable-builtin-atomics ? 我在按本贴安装的时候就已经加了呀

那你在orca论坛的installation或者bug版发个帖报一下问题吧（把硬件配置、操作系统版本之类的都说清楚），也可能对于你的机子确实还需要做一些额外的操作。orca团队没办法事先预期到所有用户的机器配置情况，所以遇到兼容性问题也是难免，即使是安装gfortran那个问题，也是ORCA 5.0发布以后一大堆用户反映没法并行计算，才发现原因的，因为我们内部的机器全都本来就带了gfortran，所以没有提前发现这个问题。

luzujia · 发表于 Post on 2021-12-6 18:47:58

wzkchem5 发表于 2021-12-6 18:20
那你在orca论坛的installation或者bug版发个帖报一下问题吧（把硬件配置、操作系统版本之类的都说清楚） ...

好的，感谢老师的耐心帮助~

luzujia · 发表于 Post on 2021-12-22 19:04:22

wzkchem5 发表于 2021-12-6 18:20
那你在orca论坛的installation或者bug版发个帖报一下问题吧（把硬件配置、操作系统版本之类的都说清楚） ...

老师，我的问题解决了，我之前用的是centos8-stream，换成centos7.6后就没这个问题了。

Sigma · 发表于 Post on 2022-5-12 09:45:25

本帖最后由 Sigma 于 2022-5-12 09:47 编辑

请教一个问题：

我下载的最新的5.0.3版本的，远程xshell登录ubuntu20系统，输入命令后报错。
sigma@sigma-B560M-AORUS-ELITE:~$ orca
Unable to init server: Could not connect: Connection refused
Unable to init server: Could not connect: Connection refused

(orca:410257): dbind-WARNING **: 09:38:15.006: Could not open X display
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/bin/orca", line 44, in <module>
from orca import orca
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/orca/orca.py", line 73, in <module>
from . import mouse_review
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/orca/mouse_review.py", line 569, in <module>
reviewer = MouseReviewer()
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/orca/mouse_review.py", line 323, in __init__
seat = Gdk.Display.get_default_seat(display)
TypeError: Argument 0 does not allow None as a value

我没用xmanger。似乎是orca跳出了什么图形界面需要我操作，然后命令行操作界面报错。第一次安装不是很了解，看之前的帖子似乎都是命令行界面。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-5-12 14:40:24

Sigma 发表于 2022-5-12 02:45
请教一个问题：

我下载的最新的5.0.3版本的，远程xshell登录ubuntu20系统，输入命令后报错。

有些linux系统自带一个屏幕阅读器，也叫做orca，如果PATH变量没设置对，会导致调用linux自己的那个orca，而不是你装的orca

Sigma · 发表于 Post on 2022-5-12 14:57:10

wzkchem5 发表于 2022-5-12 14:40
有些linux系统自带一个屏幕阅读器，也叫做orca，如果PATH变量没设置对，会导致调用linux自己的那个orca， ...

谢谢您，是我看那个说明帖子不仔细，问题解决了，不能不说orca真是算的快

scottwu · 发表于 Post on 2022-5-23 19:41:04

乐平发表于 2021-7-29 10:55
谢谢！

openmpi 总是显示那么多 warning，看着很碍眼。

mpirun后面加

-mca btl_openib_allow_ib 1

复制代码

即可。

https://pearl-cluster.readthedocs.io/en/latest/03-03_mpi.html

的run-time tuning parameters部分

https://www.open-mpi.org/faq/?category=openfabrics

的Q2

waker · 发表于 Post on 2022-6-29 16:41:50

sober老师，我用您的输入inp文件。结果在SCF计算时报错是什么原因呢？
ORCA finished by error termination in SCF
Calling Command: mpiexec -np 4 E:\ORCA\orca_scf_mpi.exe test.gbw b test
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
.... aborting the run

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-30 00:41:38

waker 发表于 2022-6-29 16:41
sober老师，我用您的输入inp文件。结果在SCF计算时报错是什么原因呢？
ORCA finished by error terminati ...

上传完整输出文件

waker · 发表于 Post on 2022-6-30 10:15:37

sobereva 发表于 2022-6-30 00:41
上传完整输出文件

请老师看看

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[ORCA] 量子化学程序ORCA的安装方法