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楼主 Author: sobereva
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[ORCA] 量子化学程序ORCA的安装方法

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发表于 Post on 2020-3-29 14:34:29 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-3-29 14:18
压根就不支持,咋使用

我好像看到帖子说支持,我也不是特别清楚

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发表于 Post on 2020-3-29 14:41:03 | 只看该作者 Only view this author
a617788816 发表于 2020-3-29 14:34
我好像看到帖子说支持,我也不是特别清楚

目前就是不支持。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-31 02:50:12 | 只看该作者 Only view this author
a617788816 发表于 2020-3-29 13:46
请教一下,ORCA,如何使用GPU加速

公开版本根本没有GPU
Neese组里貌似有人搞GPU,但即便搞完了也不会有什么实用性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2020-12-28 15:33:50 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 alonewolfyang 于 2020-12-28 15:35 编辑

老师,我参照本文设置在小服务器配置ORCA4.2.1,但是测试的时候提示错误,环境变量设置感觉没错误,MPI能正常显示版本号

2.jpg (26.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 221)

2.jpg

1.jpg (33.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 230)

1.jpg
用心去观察这纷纷扰扰的红尘

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-29 08:06:56 | 只看该作者 Only view this author
alonewolfyang 发表于 2020-12-28 15:33
老师,我参照本文设置在小服务器配置ORCA4.2.1,但是测试的时候提示错误,环境变量设置感觉没错误,MPI能正 ...

第四行LIBRARY拼错了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-12-29 08:54:16 | 只看该作者 Only view this author
我老眼昏花了,谢谢老师
用心去观察这纷纷扰扰的红尘

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发表于 Post on 2020-12-31 00:13:24 | 只看该作者 Only view this author
请教老师,我装的17G大小的静态库版本的4.2.1为什么也还是需要联网使用呀?怎么设置才能让orca突然断网也能正常使用呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-2 00:05:56 | 只看该作者 Only view this author
yinhang 发表于 2020-12-31 00:13
请教老师,我装的17G大小的静态库版本的4.2.1为什么也还是需要联网使用呀?怎么设置才能让orca突然断网也能 ...

并不需要联网
只不过机子必须有网卡,而且处于启用状态,这是OpenMPI库的要求,和ORCA自身无关
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发表于 Post on 2021-1-2 17:42:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-1-2 00:05
并不需要联网
只不过机子必须有网卡,而且处于启用状态,这是OpenMPI库的要求,和ORCA自身无关

谢谢卢老师~

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发表于 Post on 2021-1-28 21:24:06 | 只看该作者 Only view this author
谢谢分享,按照说明成功安装了ORCA4.2.0,并运行了测试文件。
Timings for individual modules:

Sum of individual times         ...        2.680 sec (=   0.045 min)
GTO integral calculation        ...        0.435 sec (=   0.007 min)  16.2 %
SCF iterations                  ...        2.246 sec (=   0.037 min)  83.8 %
                             ****ORCA TERMINATED NORMALLY****
TOTAL RUN TIME: 0 days 0 hours 0 minutes 3 seconds 85 msec

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发表于 Post on 2021-2-6 00:41:26 | 只看该作者 Only view this author
请问社长在对msmpisetup.exe进行安装时出现“MS-MPl Installation failed with error code 4317.The currently installedversion can not be upgraded. lt must be manually uninstalled fromAdd/Remove Programs before this installation can continue.”MS-MPL安装失败,错误代码4317。当前安装版本无法升级。必须手动从Add/Remove程序中卸载,才能继续此安装。是怎么回事,导致不能正常运行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-6 03:39:53 | 只看该作者 Only view this author
sun666 发表于 2021-2-6 00:41
请问社长在对msmpisetup.exe进行安装时出现“MS-MPl Installation failed with error code 4317.The curren ...

卸了重装呗
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2021-2-7 10:56:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yqiusheng 于 2021-2-7 11:00 编辑

请问,gcc编译器那个版本的来编openmpi3.1.4 比较合适?   4.8得还是更高的? 我现在是4.5 是不是有点太低了?

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发表于 Post on 2021-2-7 15:54:15 | 只看该作者 Only view this author
yqiusheng 发表于 2021-2-7 10:56
请问,gcc编译器那个版本的来编openmpi3.1.4 比较合适?   4.8得还是更高的? 我现在是4.5 是不是有点太低 ...

编一下试试就知道,能编过就可以用,编不过再升级
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-3-24 05:21:00 | 只看该作者 Only view this author
I have a question, I try with mpi 3.1.4 because I'm trying with Orca 4.2.1, with mpi I can't see any error with the instalation, go so fast though, add the lines to the /.bashrc file but when I execute mpiexec -V it says: "mpiexec (OpenRTE) 1.10.2". I'm using ubuntu 16.

So i understand that mpi 3.1.4 was not sucesfully installed, what should I do? Maybe try with root permission? I alredy try changing like this ($PATH:/sob/openmpi313/bin to /sob/openmpi313/bin:$PATH, and change $LD_LIBRARY_PATH:/sob/ Change openmpi313/lib to /sob/openmpi313/lib:$LD_LIBRARY_PATH) in the /.bashrc file.

Thanks in advance.

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