第16届北京科音初级量子化学培训班将于10月3~6日于北京举行,是量子化学初学者迅速、正确上手计算的最佳机会!报名已经开始,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码
 现在注册!
查看: 6349|回复: 117

[ORCA] ORCA 5 ,Yes

[复制链接]

350

帖子

0

威望

752

eV
积分
1102

Level 4 (黑子)

娃娃儿鱼

发表于 2021-7-2 00:03:19 | 显示全部楼层 |阅读模式
官网可以下载了!等dalao们的评测!先开贴
真·探

11

帖子

0

威望

554

eV
积分
565

Level 4 (黑子)

发表于 2021-7-2 00:05:07 | 显示全部楼层
yyds

120

帖子

0

威望

6505

eV
积分
6625

Level 6 (一方通行)

发表于 2021-7-2 00:11:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 ChrisZheng 于 2021-7-2 08:35 编辑

顺手跑了一个双杂化的扫描:37 min vs. 32 min

129

帖子

0

威望

2778

eV
积分
2907

Level 5 (御坂)

发表于 2021-7-2 00:25:54 | 显示全部楼层
本帖最后由 paramecium86 于 2021-7-2 00:36 编辑

大概随手测了测DLPNO-CCSD(T)速度
! DLPNO-CCSD(T) normalPNO RIJK cc-pVTZ cc-pVTZ/JK cc-pVTZ/C tightSCF noautostart miniprint nopop

氯苯的单点能。

这个4.2用了780s  5.0用了650s
shared lib版 5.0
https://share.weiyun.com/gXejzAvK
传一个微云的分享。省的有些小伙伴用百度网盘很慢。

31

帖子

1

威望

326

eV
积分
377

Level 3 能力者

发表于 2021-7-2 01:31:13 | 显示全部楼层
本帖最后由 ms860309 于 2021-7-2 06:43 编辑

我用shared和我原來的job比較
freq快大概30%
備註:
不能單看快30%,因為預設grid變高了,而且rijcosx預設格點比以前的還要好..
所以說就是更快更準

2702

帖子

0

威望

1565

eV
积分
4267

Level 6 (一方通行)

发表于 2021-7-2 01:50:00 | 显示全部楼层
ChrisZheng 发表于 2021-7-1 17:11
链接: https://pan.baidu.com/s/1xfAA1pXeGqGpRzfD8LZR-g 提取码: fj2k 复制这段内容 ...

提醒一下大家:
虽然ORCA对学术用户是免费的,但是原则上讲,只有从官网(https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/dlext/?cat=13)直接下载才是合法的。原因是:
(1)只有从官网直接下载,才能视同你同意了ORCA的license。
(2)ORCA对非学术用户是收费的。如果商业用户假装自己是学术用户,从官网下载了ORCA,由此对ORCA团队产生的损失是这个商业用户赔偿;如果商业用户从网盘下载了ORCA,而且因为网盘下载不要求下载者先同意license,导致这个商业用户确实不知道自己不能免费下载,那么搞不好上传网盘的这个人要吃官司。商业用户获取ORCA请联系FAccTs公司(Fast & Accurate Computational Chemistry Tools – FAccTs)。
(3)我们需要靠注册用户数以及下载数来判断ORCA的用户数目是多少,而用户数目越多,我们申请经费就会越容易,所以如果不注册账号、不从官网下载的话,我们会有间接的经济损失。
另见下面的截图(截自ORCA的EULA,在ORCA官网上有全文)

ORCA-EULA.jpg

评分

参与人数 11eV +43 收起 理由
Senses_Y + 5 我很赞同
玉米猫 + 2 我很赞同
panernie + 2 我很赞同
wang7344412 + 5 我很赞同
wsz + 3
Butadiene + 1
biogon + 5 GJ!
ChrisZheng + 5 谢谢
hdhxx123 + 5 我很赞同
beyond + 5 我很赞同
hebrewsnabla + 5 我很赞同

查看全部评分

190

帖子

5

威望

3338

eV
积分
3628

Level 5 (御坂)

发表于 2021-7-2 02:32:49 | 显示全部楼层
本帖最后由 ene 于 2021-7-2 02:38 编辑

简单跑了一下orca_md,发现体系漂移的相当厉害……不知道是我的什么设置有问题还是orca没有正确地去掉体系的平动动量
两个输入文件如下:
  1. ! MD B3LYP D3 6-31G*
  2. %md
  3.   initvel 300_K
  4.   timestep 0.5_fs
  5.   thermostat none
  6.   dump position stride 1 filename "trajectory.xyz"
  7.   run 3000
  8. end
  9. * xyz 0 1
  10.   C            0.08800073    0.44000039   -0.00000000
  11.   H            0.45429137   -0.59607744    0.00000000
  12.   H            0.45431566    0.95803346    0.89727140
  13.   H            0.45431566    0.95803346   -0.89727140
  14.   H           -1.01092326    0.44000965    0.00000000
  15. *
复制代码
  1. ! MD B3LYP D3 6-31G*
  2. %md
  3.   initvel 300_K
  4.   timestep 0.5_fs
  5.   thermostat nhc 300_K timecon 25.0_fs
  6.   dump position stride 1 filename "trajectory.xyz"
  7.   run 3000
  8. end
  9. * xyz 0 1
  10.   C            0.08800073    0.44000039   -0.00000000
  11.   H            0.45429137   -0.59607744    0.00000000
  12.   H            0.45431566    0.95803346    0.89727140
  13.   H            0.45431566    0.95803346   -0.89727140
  14.   H           -1.01092326    0.44000965    0.00000000
  15. *
复制代码

我需要一些假日,但我不希望每天都是假日。因为我没有承担痛苦,因为那不是真正的自由。

9

帖子

0

威望

268

eV
积分
277

Level 3 能力者

发表于 2021-7-2 02:59:29 | 显示全部楼层
在更新后,杂化泛函算单点能会有一定的浮动,在 0.2-1.0 kJ/mol 不等。目前不大清楚是因为积分格点更新亦或是 COSX 近似导致的此结果。不过浮动的部分在相同体系可以抵消。

2702

帖子

0

威望

1565

eV
积分
4267

Level 6 (一方通行)

发表于 2021-7-2 03:03:55 | 显示全部楼层
ene 发表于 2021-7-1 19:32
简单跑了一下orca_md,发现体系漂移的相当厉害……不知道是我的什么设置有问题还是orca没有正确地去掉体系 ...

只是平动漂移吗?刚才翻了一下手册,似乎手册没提到会去除平动动量

190

帖子

5

威望

3338

eV
积分
3628

Level 5 (御坂)

发表于 2021-7-2 03:16:29 | 显示全部楼层
wzkchem5 发表于 2021-7-2 03:03
只是平动漂移吗?刚才翻了一下手册,似乎手册没提到会去除平动动量

1. 不只是平动漂移,转动同样非常明显
2. 手册在1040页提到了这个问题:
Screenshot from 2021-07-02 03-15-32.png


我需要一些假日,但我不希望每天都是假日。因为我没有承担痛苦,因为那不是真正的自由。

53

帖子

0

威望

848

eV
积分
901

Level 4 (黑子)

发表于 2021-7-2 03:21:46 | 显示全部楼层

3万

帖子

99

威望

3万

eV
积分
72635

管理员

公社社长+计算化学玩家

发表于 2021-7-2 03:22:38 | 显示全部楼层
平移的问题在ORCA 4里就有,这也是为什么Multiwfn产生的ORCA的动力学的输入文件里有个约束质心不变的设置constraint add center
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395(已满),2号:466017436(已满),3号:764390338(可加)。合计8000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

190

帖子

5

威望

3338

eV
积分
3628

Level 5 (御坂)

发表于 2021-7-2 03:48:02 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2021-7-2 03:22
平移的问题在ORCA 4里就有,这也是为什么Multiwfn产生的ORCA的动力学的输入文件里有个约束质心不变的设置co ...

NVT系综下这样做似乎没有特别大的问题,只不过需要些时间平衡体系而已。但是NVE系综下这样似乎会导致体系的总能量偏离设定的数值吧
我需要一些假日,但我不希望每天都是假日。因为我没有承担痛苦,因为那不是真正的自由。

3万

帖子

99

威望

3万

eV
积分
72635

管理员

公社社长+计算化学玩家

发表于 2021-7-2 03:56:30 | 显示全部楼层
ene 发表于 2021-7-2 03:48
NVT系综下这样做似乎没有特别大的问题,只不过需要些时间平衡体系而已。但是NVE系综下这样似乎会导致体系 ...

担心的话,也可以之后靠align消平动
ORCA缺少个消平动的设置

评分

参与人数 1eV +5 收起 理由
ene + 5

查看全部评分

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395(已满),2号:466017436(已满),3号:764390338(可加)。合计8000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1005

帖子

1

威望

1242

eV
积分
2267

Level 5 (御坂)

喵星人

发表于 2021-7-2 04:16:36 | 显示全部楼层
本帖最后由 喵星大佬 于 2021-7-2 04:18 编辑

看了下手册,似乎有VV10的梯度???阿q生气ing
不过有些关键词有改动了,输入文件的模板也要跟着改改了
您需要登录后才可以回帖 登录 | 现在注册!

本版积分规则

手机版|小黑屋|北京科音自然科学研究中心|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )

GMT+8, 2021-9-20 04:36 , Processed in 0.258164 second(s), 28 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表