ORCA 5 ,Yes

biogon · 发表于 Post on 2021-7-6 16:36:33

wzkchem5 发表于 2021-7-6 00:08
ORCA 5发布会部分PPT和视频已开放下载：https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/dlext/?cat=15
注：如下载 ...

我发现了我的电脑上装了orca5以后高斯跑scf迭代轮数很多的时候莫名其妙的会死掉，注释掉以后发现就好了，怀疑是openmpi的问题
不知道有没有别人遇到过这些问题

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-6 16:41:34

biogon 发表于 2021-7-6 09:36
我发现了我的电脑上装了orca5以后高斯跑scf迭代轮数很多的时候莫名其妙的会死掉，注释掉以后发现就好了， ...

你是说把什么注释掉？以及这个问题可以重复吗？

biogon · 发表于 Post on 2021-7-7 20:16:52

wzkchem5 发表于 2021-7-6 16:41
你是说把什么注释掉？以及这个问题可以重复吗？

把openmpi环境变量注释掉就没问题了，不注释掉就反复出现

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-7 20:54:02

biogon 发表于 2021-7-7 13:16
把openmpi环境变量注释掉就没问题了，不注释掉就反复出现

那你把设置openmpi环境变量的语句写到调用orca的脚本里就行了，不写到bashrc里，这样就不会影响到高斯
好像orca手册也是建议这样做的

sobereva · 发表于 Post on 2021-7-7 21:17:48

ene 发表于 2021-7-4 15:15
再说一个有关orca_md的问题，不知道为什么运行步数超过1000，任务就自动停掉了……任务停下时会报这样一个 ...

我也发现有bug，每次跑到1203步时候必死，试了几种体系、各种设置，现象都一样。已经发到官方论坛
https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=11&p=32944#p32944

asdf · 发表于 Post on 2021-7-8 09:16:59

sobereva 发表于 2021-7-7 21:17
我也发现有bug，每次跑到1203步时候必死，试了几种体系、各种设置，现象都一样。已经发到官方论坛
https ...

我也是这种情况，都是1137步就死
select: Bad file descriptor
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
.... aborting the run

biogon · 发表于 Post on 2021-7-8 11:20:33

wzkchem5 发表于 2021-7-7 20:54
那你把设置openmpi环境变量的语句写到调用orca的脚本里就行了，不写到bashrc里，这样就不会影响到高斯
...

那只能先这么用了，openmpi4.0.5的时候都没有遇到这种问题

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-8 15:30:06

asdf 发表于 2021-7-8 02:16
我也是这种情况，都是1137步就死
select: Bad file descriptor
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458] ...

这个问题ORCA 5.0.1会修复。本质上是orca_md有一个文件每步MD都会打开，但是忘了关

hdhxx123 · 发表于 Post on 2021-7-8 17:07:41

本帖最后由 hdhxx123 于 2021-7-8 17:32 编辑

TRAH应该是存在bug还是啥的，会收敛着就卡在一个能量上，而显示的能量变化又是在一直降低的，但实际是在震荡。DIIS的veryslowconv特别迅速地就收敛了，没有明显的震荡。另外需要注意的是，TRAH与slowconv及veryslowconv并不会一起用，如果要一直用slowconv或veryslowconv的DIIS时记得用noTRAH把TRAH关掉

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-8 20:53:25

hdhxx123 发表于 2021-7-8 10:07
TRAH应该是存在bug还是啥的，会收敛着就卡在一个能量上，而显示的能量变化又是在一直降低的，但实际是在震 ...

注意一个问题：你把thresh和tcut设得比默认值还松（使用verytightscf时， thresh默认为1e-12，tcut默认为1e-14）。。。这么松的thresh和tcut应该是不足以收敛到verytightscf的标准的。我去掉thresh和tcut的设定，并打开TRAH后，SCF 89步收敛，收敛能量-764.036712959977。你另一个帖子算Tb也有这个问题，本想把积分阈值设严，结果比默认还松，当然不收敛。。。
TRAH能量降低又跳回原值不是bug，是因为TRAH有macroiteration和microiteration，每步macroiteration的最后一步microiteration的能量可以比下一步macroiteration的第一步microiteration低。参见TRAH原始文献https://aip.scitation.org/doi/pdf/10.1063/5.0040798

hdhxx123 · 发表于 Post on 2021-7-8 21:01:03

wzkchem5 发表于 2021-7-8 20:53
注意一个问题：你把thresh和tcut设得比默认值还松（使用verytightscf时， thresh默认为1e-12，tcut默认为 ...

了解了，谢谢老师

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-8 21:07:03

hdhxx123 发表于 2021-7-8 10:07
TRAH应该是存在bug还是啥的，会收敛着就卡在一个能量上，而显示的能量变化又是在一直降低的，但实际是在震 ...

另外顺便一提，TRAH和slowconv/veryslowconv不能结合使用是feature而不是bug。一般只有在能量振荡的时候才会用到slowconv/veryslowconv，而TRAH是自带linear search的，如果能量升高，会自动退回到上一步波函数并缩小步长，也就是该slow的时候才slow，发现上一步迈大了就撤销上一步然后重新走一小步，不需要slow的时候就放开步子走。所以，发现TRAH和slowconv不会一起用就关掉TRAH是没有任何道理的。

hdhxx123 · 发表于 Post on 2021-7-8 21:08:41

wzkchem5 发表于 2021-7-8 21:07
另外顺便一提，TRAH和slowconv/veryslowconv不能结合使用是feature而不是bug。一般只有在能量振荡的时候 ...

但是我尝试了一下发现veryslowconv的DIIS速度比TRAH的速度收敛快的多。。在波函数质量有保证的前提下，如果DIIS能收敛的话可以选择关掉TRAH

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-8 22:07:45

hdhxx123 发表于 2021-7-8 14:08
但是我尝试了一下发现veryslowconv的DIIS速度比TRAH的速度收敛快的多。。在波函数质量有保证的前提下，如 ...

那就是程序自动开TRAH的阈值对于这个体系太松了

hdhxx123 · 发表于 Post on 2021-7-8 22:25:20

wzkchem5 发表于 2021-7-8 22:07
那就是程序自动开TRAH的阈值对于这个体系太松了

老师，想请问一下Tcut和Thresh在orca4.2.1中的设置与scf级别的设置是怎么样的呢？是orca5中有改变吗？我在orca4.2.1手册的9.6节SCF convergence中没有找到具体的定义

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