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楼主 Author: hdhxx123
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发表于 Post on 2021-7-2 15:08:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-2 15:01
就是基组线性相关问题吧。。。
之前这边有人有计划调整AutoAux产生的辅助基组,来缓解基组线性相关问题 ...

你是指辅助基的线性相关问题?不是原基组的线性相关问题?
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发表于 Post on 2021-7-2 15:13:28 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-7-2 14:40
给ma-def2系列基组用AutoAux翻车 能否介绍一下是什么情况?

ma-def2-QZVP或者QZVPP加autoaux有时会提示辅助基组线性相关问题,双杂化基本到MP2部分必报错,wB97M-V在SCF开始前随机报错,看了半天手册没搞定怎么改...

一次wB97M-V/ma-def2-QZVP/smd RI+RIJCOSX算一个中性有机Pd(II)的过渡态单点,初猜是某斯PBE0/def2-SVP几何优化的波函数,算出来比底物高大概540 kcal/mol,怀疑是没收敛到基态;改用slowconv以后收敛到了比底物低90 kcal/mol左右。底物往前几步相对能量都很正常,感觉SCF没问题。
后来改用了maug-cc-pvqz和-PP来算,主族用预设的/JK基组,Pd用autoaux,算出来就很正常。两个方法算底物绝对能量大概差0.03 Ha,所以感觉是之前autoaux收敛到了奇怪的能量过低的解。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-2 15:16:50 | 只看该作者 Only view this author
Satoru 发表于 2021-7-2 15:13
ma-def2-QZVP或者QZVPP加autoaux有时会提示辅助基组线性相关问题,双杂化基本到MP2部分必报错,wB97M-V在 ...

感觉这是操作的问题,如果要读波函数的话一般需要是同zeta的,基组SVP和QZVP是2zeta到4zeta,波函数质量差得有点太多了,按照你的这个orca计算级别,某斯应该是pbe0/def2tzvp起步
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发表于 Post on 2021-7-2 15:19:42 | 只看该作者 Only view this author
hdhxx123 发表于 2021-7-2 15:16
感觉这是操作的问题,如果要读波函数的话一般需要是同zeta的,基组SVP和QZVP是2zeta到4zeta,波函数质量 ...

比较懒x之前还没翻过车
针对这个例子,某斯wB97X-D/def2-TZVP波函数初猜我也尝试过,不记得是收敛到哪个解了,反正是不对...
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发表于 Post on 2021-7-2 15:24:14 | 只看该作者 Only view this author
Satoru 发表于 2021-7-2 15:19
比较懒x之前还没翻过车
针对这个例子,某斯wB97X-D/def2-TZVP波函数初猜我也尝试过,不记得是收敛到哪个 ...

辅助基线性相关问题不好解决。SCF收敛性问题、收敛到正确的解上,这十分好解决。
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发表于 Post on 2021-7-2 15:25:42 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-7-2 08:08
你是指辅助基的线性相关问题?不是原基组的线性相关问题?

对,这个是autoaux的主要问题,容易有线性相关,导致SCF出现variational instability。
我不知道ORCA 5有没有把他们说的改进加进去,如果加了的话,ORCA 5的autoaux会有改善
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发表于 Post on 2021-7-2 15:32:29 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-7-2 15:24
辅助基线性相关问题不好解决。SCF收敛性问题、收敛到正确的解上,这十分好解决。

qwq所以收敛到比(理想的)正确解低90 kcal/mol左右也可以救回来嘛
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发表于 Post on 2021-7-2 15:41:15 | 只看该作者 Only view this author
Satoru 发表于 2021-7-2 08:32
qwq所以收敛到比(理想的)正确解低90 kcal/mol左右也可以救回来嘛

这个属于线性相关问题。。。他应该是说除了基组线性相关以外的SCF收敛问题好解决
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-2 15:42:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-2 15:41
这个属于线性相关问题。。。他应该是说除了基组线性相关以外的SCF收敛问题好解决

nearly all done
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发表于 Post on 2021-7-2 15:47:32 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-2 15:41
这个属于线性相关问题。。。他应该是说除了基组线性相关以外的SCF收敛问题好解决

感谢orz这两天去试试拿5.0重算下
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发表于 Post on 2021-7-2 16:28:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-2 01:50
提醒一下大家:
虽然ORCA对学术用户是免费的,但是原则上讲,只有从官网(https://orcaforum.kofo.mpg.d ...

我算DLPNO-STEOM出了如下的错误是bug吗?
------------------------------------------------------------------------------
                           ORCA POPULATION ANALYSIS
------------------------------------------------------------------------------
Input electron density              ... 1.mdcip
BaseName (.gbw .S,...)              ... 1
[pc-AS-2023US-TR4:200440] *** Process received signal ***
[pc-AS-2023US-TR4:200440] Signal: Floating point exception (8)
[pc-AS-2023US-TR4:200440] Signal code: Integer divide-by-zero (1)
[pc-AS-2023US-TR4:200440] Failing at address: 0xba0de2
[pc-AS-2023US-TR4:200438] *** Process received signal ***
[pc-AS-2023US-TR4:200438] Signal: Floating point exception (8)
[pc-AS-2023US-TR4:200438] Signal code: Integer divide-by-zero (1)
[pc-AS-2023US-TR4:200438] Failing at address: 0xba0de2
[pc-AS-2023US-TR4:200438] [ 0] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x3efd0)[0x155112408fd0]
[pc-AS-2023US-TR4:200438] [ 1] [pc-AS-2023US-TR4:200441] *** Process received signal ***

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发表于 Post on 2021-7-2 16:37:10 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2021-7-2 09:28
我算DLPNO-STEOM出了如下的错误是bug吗?
---------------------------------------------------------- ...

建议发到orca论坛的bugs版面
顺便你可以测一下,在你的机子上其他类似的方法会不会在population那里报错,比如EOM-CCSD,这样方便我们锁定问题所在
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2021-7-2 16:53:20 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-2 16:37
建议发到orca论坛的bugs版面
顺便你可以测一下,在你的机子上其他类似的方法会不会在population那里报错 ...

这个体系四十多原子,没DLPNO的恐怕搞不动吧

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发表于 Post on 2021-7-2 17:09:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-2 16:37
建议发到orca论坛的bugs版面
顺便你可以测一下,在你的机子上其他类似的方法会不会在population那里报错 ...

我刚才试了跑别的体系,给64核scf迭代的时候就崩了,32核就没事

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发表于 Post on 2021-7-2 17:25:35 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2021-7-2 10:09
我刚才试了跑别的体系,给64核scf迭代的时候就崩了,32核就没事

你的服务器有多少个核?有跨节点跑吗?
比较新的OpenMPI好像要求任务用的核数不能超过服务器的物理核数。比较老的版本可以超过物理核数,甚至超过逻辑核数可能都行
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