简单量子化学问题答疑专帖

hehe321123 · 发表于 Post on 2023-6-13 19:49:43

sobereva 发表于 2023-6-13 16:50
0 1 0 1 0 2 0 2设得不对
第二个和第三个片段的alpha都比beta电子数多一个，显然整体的自旋多重度不可能 ...

sob老师，我想问一下片段初猜首先是构建片段组合波函数，然后再生成自旋极化单重态，我是不是可以直接将第二步替换成柔性扫描或直接优化过渡态？

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-13 22:31:05

hehe321123 发表于 2023-6-13 19:49
sob老师，我想问一下片段初猜首先是构建片段组合波函数，然后再生成自旋极化单重态，我是不是可以直接将 ...

柔性扫描、优化过渡态等各种任务都可以用guess=read从构造片段组合波函数任务产生的chk文件里读取波函数当初猜

MercuryLamp · 发表于 Post on 2023-6-13 23:30:23

老师好，我在寻找一个反应的过渡态时，先通过柔性扫描确定了初猜结构，但在构建过渡态的计算输入文件时，我忘了将上一步中扫描的变量删掉（即输入文件最后的B 10 111 S 4 -0.100000），这样会对过渡态的计算有影响吗（比如说优化过程中键长会被固定）？我从输出的结果来看，似乎是没有影响的(扫描的键长在优化过程中是变化的)。
这个是我的过渡态计算输入文件

%chk=aaa.chk
#p opt=(calcfc,ts,noeigen) freq ub3lyp def2svp em=gd3bj
Title Card Required
0 2
坐标
B 10 111 S 4 -0.100000

复制代码

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-14 09:55:34

MercuryLamp 发表于 2023-6-13 23:30
老师好，我在寻找一个反应的过渡态时，先通过柔性扫描确定了初猜结构，但在构建过渡态的计算输入文件时，我 ...

没影响
当前没有任何关键词去读那部分信息

hehe321123 · 发表于 Post on 2023-6-14 14:30:06

各位老师，我想问一下怎么用ef方法追踪特定的振动模式？以及ef方法的写法以及格式？

hehe321123 · 发表于 Post on 2023-6-14 15:30:12

请问各位老师，这个得到的是自旋极化单重态吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-14 15:54:29

hehe321123 发表于 2023-6-14 08:30
请问各位老师，这个得到的是自旋极化单重态吗？

是。由自旋密度非零，以及alpha、beta电子数相同这两点就足以判断了

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-14 15:54:59

hehe321123 发表于 2023-6-14 07:30
各位老师，我想问一下怎么用ef方法追踪特定的振动模式？以及ef方法的写法以及格式？

必须告诉我们你用的是什么计算软件，我们才可能回答。支持EF的程序不唯一

hehe321123 · 发表于 Post on 2023-6-14 15:55:53

wzkchem5 发表于 2023-6-14 15:54
必须告诉我们你用的是什么计算软件，我们才可能回答。支持EF的程序不唯一

高斯

LWS · 发表于 Post on 2023-6-14 16:13:16

【求助】请问各位老师尿素过氧化氢配合物（UHP）中O-O间的键能怎么算？

DFT RB3LYP/6-31++G(d,p) opt+freq 找到UHP的能量，然后断开O-O键生成的还是一个片段，计算能量，发现最后键能为0。这种断开键之后还是一个片段的，应该如何计算键能？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-14 16:27:55

LWS 发表于 2023-6-14 09:13
【求助】请问各位老师尿素过氧化氢配合物（UHP）中O-O间的键能怎么算？

DFT RB3LYP/6-31++G(d,p) opt+f ...

参见http://sobereva.com/522。这篇讲的是氢键，但是举一反三不难知道类似情况下的共价键键能怎么算。
另一种做法是拉长O-O键以后算三重态而非自旋破缺单重态，这样可以避免两个OH自由基复合

LWS · 发表于 Post on 2023-6-14 16:30:44

wzkchem5 发表于 2023-6-14 16:27
参见http://sobereva.com/522。这篇讲的是氢键，但是举一反三不难知道类似情况下的共价键键能怎么算。
...

谢谢老师，我马上去试试

kimariyb · 发表于 Post on 2023-6-15 00:23:07

卢老师和各位老师，我想问一下，在初级班计算激发态的那一部分，有些有机体系是先用 B3LYP、wB97XD 以及 M06-2X 其中之一的泛函来优化基态后，再用 PBE0 泛函计算 TDDFT。但是我还看见有些有机体系是基态和激发态的计算都使用了 PBE0，学生不太理解为什么优化基态和计算激发态都使用 PBE0，或者说这和先用 B3LYP 等泛函优化基态后，再用 PBE0 计算激发态有什么区别呢。

MercuryLamp · 发表于 Post on 2023-6-15 01:46:57

sobereva 发表于 2023-6-14 09:55
没影响
当前没有任何关键词去读那部分信息

谢谢老师，还有一个问题想请教一下您。我在结构优化和振动分析时使用的是B3LYP/def2-SVP，现在想用Shermo计算分子的热力学数据，但找不到该计算级别的频率校正因子，我看到您在博文《谈谈谐振频率校正因子》(http://sobereva.com/221)中提到“各类校正因子对于所用基组都不敏感，可以直接用此方法在相近的基组下的校正因子”，那我用B3LYP/6-31G**的频率校正因子来代替进行计算是否可行？

sherrylikecat · 发表于 Post on 2023-6-15 10:45:46

老师好，我有一个关于VASP的问题。在ENCUT的使用方面，无论是大师兄的教程，还是VASP官方使用指南都是写了用ENMAX*1.3作为ENCUT的值。请问为什么大师兄使用的ENCUT值更高呢
大师兄教程中：Fe的ENCUT 默认值是：ENMAX = 267.882 eV，前面单点计算设置的 450 eV。结构优化设置成600 eV

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