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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2023-6-7 02:10:16 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2023-6-6 16:56
请问各位老师,有没有什么软件或者方法可以计算总的Kisc呢

什么叫”总的“?
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发表于 Post on 2023-6-7 08:56:55 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-6 19:21
假如ρ(BCP)确实这么小的话,不用ρ(BCP)就可以判断出来没有氢键,例如通过键长判断就足够了。当ρ(BCP) ...

老师,距离最近是2.3个埃米,但是是C---H---O之间的,我们在课本上学习的氢键多为N\O\F这类电负性大的原子之间,所以我想通过一些定量的数值判断是否存在氢键。老师,那我能用以上的计算过程说明虽然键长在氢键范围,但是不存在氢键的结论吗?谢谢王老师

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发表于 Post on 2023-6-7 09:04:12 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,大家经常说的过渡金属配合物的价态是氧化数还是化合价呀?哪个更好呀?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 09:28:53 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-6-7 09:04
各位老师好,大家经常说的过渡金属配合物的价态是氧化数还是化合价呀?哪个更好呀?

就是这里说的
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362http://bbs.keinsci.com/thread-5118-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 09:29:47 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-6-7 08:56
老师,距离最近是2.3个埃米,但是是C---H---O之间的,我们在课本上学习的氢键多为N\O\F这类电负性大的原 ...

只有埃,没有埃米

C-H...O的氢键极弱,看下文
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html
形式上可以说是氢键,但本质和一般强度的氢键有极大差别,强度也弱一个数量级,实际中算不算氢键只是说法问题
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发表于 Post on 2023-6-7 09:40:24 | 只看该作者 Only view this author

gaussian wb97x

gaussian中用wb97x计算弱相互作用体系要考虑加色散吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 09:53:02 | 只看该作者 Only view this author
xyz0101 发表于 2023-6-7 09:40
gaussian中用wb97x计算弱相互作用体系要考虑加色散吗?

毫无理由用这个算弱相互作用,明明有一起提出的专门适合算弱相互作用的wB97XD,还有后来更好的wB97X-D3、wB97X-V,以及更好的wB97M-V
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发表于 Post on 2023-6-7 10:00:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2023-6-7 10:02 编辑
wzkchem5 发表于 2023-6-7 02:10
什么叫”总的“?

可能我的表述不太准确,我想表达的是“Σkisc(Sn-Tm)”
因为我想通过τ=1/(kr+kic+kisc)来反求kic,kr可以通过计算振子强度和激发能,用式"2(fν^2)/3“”来算得,τ则使用测试的值(我有印象sob老师说,如果退激发过程几乎100%通过辐射跃迁,则计算的荧光寿命和测试值几乎可以完美对应,那么如果非辐射跃迁退激发过程明显,是否可以通过测试的τ和计算的kr来得到kic+kisc)。如果可以通过计算“总kisc”就可以求出唯一的未知量kic(因为我之前有看到博文说kic是无法通过直接的方法计算出来的)。
这是我的一点想法,不知道是否有不妥,还请老师指正。

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发表于 Post on 2023-6-7 10:08:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 糖糖糖豆9988 于 2023-6-7 10:40 编辑
sobereva 发表于 2023-6-7 09:29
只有埃,没有埃米

C-H...O的氢键极弱,看下文

谢谢社长,我去学习一下。我是看到之前师姐的毕业论文里对反应复合物的讨论,提到氢键的形成促使了氢提取反应复合物的形成。①既然是弱氢键,那么反应复合物的形成是为什么呢?我可以直接说是极化作用和色散作用吸引所致吗?②在分析复合物的时候就不需要进行键强度的计算了,直接说明C-H---O的氢键很弱即可?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 13:14:59 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-6-7 10:08
谢谢社长,我去学习一下。我是看到之前师姐的毕业论文里对反应复合物的讨论,提到氢键的形成促使了氢提取 ...

我的JCC文章里非常明确说了氢键的本质,那么弱的氢键根本就不可能极化作用起什么可查觉的作用
具体体系是什么样都不交代,没人能给你具体答案

想算就算,绝对数值的研究的问题如果不重要可以不算
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发表于 Post on 2023-6-7 14:27:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-7 13:14
我的JCC文章里非常明确说了氢键的本质,那么弱的氢键根本就不可能极化作用起什么可查觉的作用
具体体系 ...

社长,就是如图的四环庚烷的氢提取反应体系,我再看下您的文章,谢谢社长

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 14:47:24 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-6-7 14:27
社长,就是如图的四环庚烷的氢提取反应体系,我再看下您的文章,谢谢社长

下面那个C-H...O对复合物产生的贡献极其次要。除了C-H...O本身就很弱以外,当前结构下这氢键键角还特别大,更弱了
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发表于 Post on 2023-6-7 14:56:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-7 14:47
下面那个C-H...O对复合物产生的贡献极其次要。除了C-H...O本身就很弱以外,当前结构下这氢键键角还特别大 ...

谢谢社长回复,我看过您之前在一张统计氢键的幻灯片,里面有“H-氢键给体-氢键受体夹角小于30°” 内容,请问您说的氢键键角大也是按照这个标准吗?

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发表于 Post on 2023-6-7 15:26:30 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-6-7 01:56
老师,距离最近是2.3个埃米,但是是C---H---O之间的,我们在课本上学习的氢键多为N\O\F这类电负性大的原 ...

3埃的话ρ(BCP)这么小还比较正常,2.3埃(注意那个叫埃,不叫埃米)ρ(BCP)只有0.00001量级,我怀疑是算错了。是不是读成另外一个不相关的BCP的密度值了
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发表于 Post on 2023-6-7 15:35:45 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-7 15:26
3埃的话ρ(BCP)这么小还比较正常,2.3埃(注意那个叫埃,不叫埃米)ρ(BCP)只有0.00001量级,我怀疑是算 ...

老师,H5-O13的距离在Gview里面就是2.23 埃,图片是我在multiwfn里CP labels开启开启后的BCP的序号,我就输入了32,输出的结果就是那么小。

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