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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2023-7-19 11:34:04 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian输出文件中含有的警示性标语交流

大家好,我用的版本是Gaussian C.01,在输出文件里总是有“ Unable to Open any file for archive entry.”和“ The archive entry for this job was punched.”两句话,如下图,想请问下各位大佬,这个是表示有什么问题吗?如何去解决这个问题?我看别人的Gaussian A.03就没有这两句话。附件上传不了




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-19 13:36:28 | 只看该作者 Only view this author
TYCHEN 发表于 2023-7-19 11:34
大家好,我用的版本是Gaussian C.01,在输出文件里总是有“ Unable to Open any file for archive entry.” ...

看清楚板块再发贴,求助学术贴不得发到“公社大厅”板块,公社大厅板块http://bbs.keinsci.com/forum-79-1.html版头超级巨大的红字提示得极其明确。这次给你移动了,下次如果普通学术求助帖再发到“公社大厅”板块,直接删帖+记违规+扣分处理。

不用管。该有的信息都有就行了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-19 13:38:51 | 只看该作者 Only view this author
Gzh_NJ 发表于 2023-7-18 10:48
老师们好,请教下BDE在M062X/def2tzvp级别下 计算出来相差 3.5kcal/mol能否说明键的强度有差异?感谢老师们 ...

得说具体什么键。比如有机体系里类似的而且是单键,那比较容易算准,能说明问题(虽然建议再结合其它比较准确的方法,比如wB97M-V的结果对照一下)。如果是过渡金属配位键,M06-2X描述得就很烂,没法说事
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-19 13:39:36 | 只看该作者 Only view this author
betteron 发表于 2023-7-18 14:49
老师,其他软件运行ok的,这是他运行时显示的错误,具体我不知道该怎么解决
Warning) Detected a mismat ...

如果是1.9.4非正式版,老老实实改用VMD 1.9.3,前者几乎没法用
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发表于 Post on 2023-7-19 13:50:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 TYCHEN 于 2023-7-19 13:56 编辑
sobereva 发表于 2023-7-19 13:36
看清楚板块再发贴,求助学术贴不得发到“公社大厅”板块,公社大厅板块http://bbs.keinsci.com/forum-79- ...

好的好的,谢谢社长,实在不好意思,下次一定注意

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发表于 Post on 2023-7-19 14:44:59 | 只看该作者 Only view this author
做完固定优化后,开始做过渡态,使用guess=read,geom=allcheck 会不会把固定优化固定原子的信息也读进去

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-19 15:00:28 | 只看该作者 Only view this author
hehe321123 发表于 2023-7-19 14:44
做完固定优化后,开始做过渡态,使用guess=read,geom=allcheck 会不会把固定优化固定原子的信息也读进去

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本帖最后由 TYCHEN 于 2023-7-19 15:48 编辑

各位大佬,做的#p pm6 opt freq,为啥第27步收敛了,但是第28步(最后一步)又不收敛了,遇到这种情况应该怎么办?选哪个作为优化的结果(备注:第26步之前都是不收敛的)








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发表于 Post on 2023-7-19 16:54:35 | 只看该作者 Only view this author
自由基与金属的加成有必要找自旋极化单重态吗?算过渡态是有必要加guess=mix等关键词吗?还有我用柔性扫描沿着键断裂的方向找过渡态?那什么时候取初猜比较合适呢?比如下图环丁烷拉成丁烷双自由基

QQ图片20230719165305.png (139.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

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发表于 Post on 2023-7-19 17:04:08 | 只看该作者 Only view this author
hehe321123 发表于 2023-7-19 09:54
自由基与金属的加成有必要找自旋极化单重态吗?算过渡态是有必要加guess=mix等关键词吗?还有我用柔性扫描 ...

发帖格式不符合要求,按http://sobereva.com/620的要求把背景信息补充全以后,我们再回答
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-7-19 17:04:45 | 只看该作者 Only view this author
TYCHEN 发表于 2023-7-19 08:44
各位大佬,做的#p pm6 opt freq,为啥第27步收敛了,但是第28步(最后一步)又不收敛了,遇到这种情况应该 ...

参见http://sobereva.com/278
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-7-19 17:23:53 | 只看该作者 Only view this author

牛啊,原来是opt收敛了,最后一步freq没有收敛,不过确实没有虚频。强啊

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-19 19:52:06 | 只看该作者 Only view this author
hehe321123 发表于 2023-7-19 16:54
自由基与金属的加成有必要找自旋极化单重态吗?算过渡态是有必要加guess=mix等关键词吗?还有我用柔性扫描 ...

信息不充分,没法具体回答。你若怀疑有就尝试对之前找到的过渡态用stable做波函数稳定性测试,不稳定就stable=opt看能搞出来什么
guess=mix不保证一定能得到自旋极化单重态
该说的都说了
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

此例子根本就是无势垒的
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发表于 Post on 2023-7-19 20:01:58 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,我做了一个自由基加成到铜上的自由基加成的过程。一开始做了个柔性扫描,扫描到第五帧的时候直接变成了产物,结构发生了变化,想问一下该怎么解决,我想找一个自旋极化单重态?使用了guess(mix,always) 。

QQ图片20230719195747.png (44.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

QQ图片20230719195747.png

QQ图片20230719195822.png (51.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

QQ图片20230719195822.png

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发表于 Post on 2023-7-19 20:03:01 | 只看该作者 Only view this author
hehe321123 发表于 2023-7-19 20:01
各位老师,我做了一个自由基加成到铜上的自由基加成的过程。一开始做了个柔性扫描,扫描到第五帧的时候直接 ...

这是柔性扫描的结果,没算完

TS3-scan.7z

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柔性扫描

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