计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

  [复制链接 Copy URL]

1万

帖子

0

威望

9002

eV
积分
20758

Level 6 (一方通行)

3376#
发表于 Post on 2024-6-7 20:40:29 | 只看该作者 Only view this author
2313150935 发表于 2024-6-7 13:18
mrci 15电子12轨道,冻结了AL的1s2s2p,O的1s,至于态只计算了cs对称性下的2个A‘和1个A’‘,请问wzkchem5 ...

简单来说,如果在你研究的势能面范围内,你平均的某一个态会和你没平均的某一个态接近简并,那么就应该多平均一个态,把后者也平均进来。然后再重新检查一下有没有另一个你没平均的态和你平均的态接近简并了,如此往复直至没有这样的情况
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

7

帖子

0

威望

49

eV
积分
56

Level 2 能力者

3377#
发表于 Post on 2024-6-7 20:44:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2313150935 于 2024-6-7 20:45 编辑
wzkchem5 发表于 2024-6-7 20:40
简单来说,如果在你研究的势能面范围内,你平均的某一个态会和你没平均的某一个态接近简并,那么就应该多 ...

谢谢wzkchem5老师,但是我尝试过增加平均的态的个数,但是也不能很好的解决不连续的问题,除此之外还有其他的解决方法吗?

72

帖子

0

威望

290

eV
积分
362

Level 3 能力者

3378#
发表于 Post on 2024-6-8 08:56:09 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-7 16:02
我已经说了,单知道氢键键能无法判断是否可以忽略色散作用,必须知道你需要达到的精度才能判断

我明白了,只有在明确要比较级别/精度,才能确定这个色散作用能否忽略,老师,我能请问一下如果单从精度来说,什么样的精度才无法忽略色散作用呢?

1

帖子

0

威望

13

eV
积分
14

Level 1 能力者

3379#
发表于 Post on 2024-6-8 12:47:03 | 只看该作者 Only view this author

求助看看这个报错啥意思

这是报错信息,算了一个多小时了
FROM WHENCE IT HAPPENS, THAT THEY WHICH TRUST TO BOOKS, DO AS THEY THAT CAST UP MANY LITTLE SUMMS INTO GREATER,
WITHOUT CONSIDERING WETHER THOSE LITTLE SUMMES WERE RIGHTLY CAST UP OR NOT...
AND AT LAST FINDING THE ERROUR VISIBLE, AND NOT MISTRUSTING THEIR FIRST GROUNDS,
KNOW NOT WHICH WAY TO CLEERE THEMSELVES...
BUT SPEND TIME IN FLUTTERING OVER THEIR BOOKES....
AS BIRDS THAT ENTERING BY THE CHIMNEY, AND FINDING THEMSELVES INCLOSED IN A CHAMBER,
FLUTTER AT THE FALSE LIGHT OF A GLASSE WINDOW,
FOR WANT OF WIT TO CONSIDER WHICH WAY THEY CAME IN....
           LEVIATHAN
Error termination request processed by link 9999.
Error termination via Lnk1e in C:\G09W\l9999.exe at Sat Jun 08 01:42:51 2024.
Job cpu time:       0 days  1 hours 28 minutes 27.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    152 Int=      0 D2E=      0 Chk=      5 Scr=      1

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120177

管理员

公社社长

3380#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-8 13:07:47 | 只看该作者 Only view this author
zmhao 发表于 2024-6-8 12:47
这是报错信息,算了一个多小时了
FROM WHENCE IT HAPPENS, THAT THEY WHICH TRUST TO BOOKS, DO AS THEY  ...

认真看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
起码把输入输出文件上传

如果几何优化难收敛,看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1万

帖子

0

威望

9002

eV
积分
20758

Level 6 (一方通行)

3381#
发表于 Post on 2024-6-8 16:28:30 | 只看该作者 Only view this author
2313150935 发表于 2024-6-7 13:44
谢谢wzkchem5老师,但是我尝试过增加平均的态的个数,但是也不能很好的解决不连续的问题,除此之外还有其 ...

检查不同结构下的活性轨道是否连续变化
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

1万

帖子

0

威望

9002

eV
积分
20758

Level 6 (一方通行)

3382#
发表于 Post on 2024-6-8 16:29:49 | 只看该作者 Only view this author
wang_ 发表于 2024-6-8 01:56
我明白了,只有在明确要比较级别/精度,才能确定这个色散作用能否忽略,老师,我能请问一下如果单从精度 ...

先预估一下色散作用大概有多大,假如是x,你需要的精度是y,那么当x远小于y时,可以忽略色散作用,当x远大于y时,不能忽略色散作用,当x和y可比时,无法严格确定能不能忽略
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

72

帖子

0

威望

290

eV
积分
362

Level 3 能力者

3383#
发表于 Post on 2024-6-8 16:40:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-8 16:29
先预估一下色散作用大概有多大,假如是x,你需要的精度是y,那么当x远小于y时,可以忽略色散作用,当x远 ...

明白啦,谢谢老师的解答,解释得非常通俗清楚了

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

3384#
发表于 Post on 2024-6-9 01:09:14 | 只看该作者 Only view this author
请问在您的文章http://sobereva.com/406构建被显式溶剂层包裹的分子的简单方法中,如图部分的输入文件里 ,geom=connectivity是必要的吗
放下

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120177

管理员

公社社长

3385#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-9 01:18:54 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-6-9 01:09
请问在您的文章http://sobereva.com/406构建被显式溶剂层包裹的分子的简单方法中,如图部分的输入文件里,g ...

最好带着,这样确保原子间连接关系判断正确,否则分子力场的计算可能异常
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

3386#
发表于 Post on 2024-6-9 10:37:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-9 01:18
最好带着,这样确保原子间连接关系判断正确,否则分子力场的计算可能异常

好的 感谢
放下

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

3387#
发表于 Post on 2024-6-9 10:58:50 | 只看该作者 Only view this author
用Gaussian做UFF力场时出现报错,已查找,发现此报错较少,我尝试删去PDBNAME=C,RESNAME=,RESNUM=1,依然没有效果
Symbolic Z-matrix:
Charge =  1 Multiplicity = 1
Error parsing atomic flags:
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
PDBNAME=C,RESNAME=,RESNUM=1
放下

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

3388#
发表于 Post on 2024-6-9 11:52:42 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-6-9 10:58
用Gaussian做UFF力场时出现报错,已查找,发现此报错较少,我尝试删去PDBNAME=C,RESNAME=,RESNUM=1,依然 ...

已解决,纵向编辑把所有的PDBNAME=,RESNAME=,RESNUM=都删了即可,注意后面的原子坐标要对齐
放下

10

帖子

0

威望

305

eV
积分
315

Level 3 能力者

3389#
发表于 Post on 2024-6-9 12:35:26 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我使用CCSD(T)进行单点能计算的时候报错L801,改用CCSD(T,FULL)进行计算,输出文件中“CCSD(T)=”处没有显示能量,我该如何读取能量?

AuO-CCSDt-x2c-1.out

130.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120177

管理员

公社社长

3390#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-9 13:26:04 | 只看该作者 Only view this author
无糖热可乐 发表于 2024-6-9 12:35
老师您好,我使用CCSD(T)进行单点能计算的时候报错L801,改用CCSD(T,FULL)进行计算,输出文件中“CCSD(T)= ...

后HF任务不要和stable=opt搅合在一起做
正确做法是先做HF stable=opt任务,得到稳定波函数,然后后HF计算时guess=read读取稳定的HF波函数当初猜
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 00:41 , Processed in 0.409102 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list