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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2024-9-8 16:35:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2024-9-8 16:36 编辑
wzkchem5 发表于 2024-9-8 14:19
什么叫跃迁过程的电子分布?只有态有电子分布,跃迁过程没有电子分布。用没有歧义的、规范术语把问题说清 ...

实在不好意思,才疏学浅、词不达意,浪费您很多时间,我用图片来展示吧。这里说的“电子”分布,是针对s0 -> sn激发进行空穴-电子分析的“电子”。图中s0 -> s1和s0 -> s3激发的电子分布几乎完全一样(作图看不出差别),请问该如何表述,S1和S3的区别呢?(垂直激发计算采用B3LYP/6-311+G**给前三周期元素/LANL08(d)给碘)

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发表于 Post on 2024-9-8 16:56:56 | 只看该作者 Only view this author
请教下大佬,自学的Gaussian,组内没有买授权,之前发期刊文章挂的其他学校老师名字,请问毕业论文里可以写Gaussian相关内容吗,是否是继续把这个老师名字放到毕业论文致谢里

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-8 21:19:56 | 只看该作者 Only view this author
PinkComedy 发表于 2024-9-8 10:57
也试过用gjf 是一样的报错结果

gjf文件不在当前目录下,你又没写目录名,当然找不到文件
属于计算基本常识的问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-8 21:24:22 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-9-8 16:35
实在不好意思,才疏学浅、词不达意,浪费您很多时间,我用图片来展示吧。这里说的“电子”分布,是针对s0 ...

首先你这个图就根本不是一般说的Multiwfn里的空穴-电子分析(下文)的图。Multiwfn给出的空穴、电子的分布都是没有相位的
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
http://sobereva.com/434http://bbs.keinsci.com/thread-10775-1-1.html

我不知道你当前绘制的到底是什么,MO还是NTO或是什么其它的。被激发的电子几乎都去了LUMO,所以自然“电子”不会有差别,但空穴明显不同,显然跃迁性质(激发能、跃迁偶极矩等)都明显不同,而且激发态与基态间的密度差也明显不同,自然对应的激发态的密度也明显不同。
激发态的电子密度(由所有电子共同决定),和电子激发分析中的“电子”(即被激发的电子去的地方。注意对于100%的单电子激发的情况,被激发的只有1个电子)的密度完全是两码事,要分清楚。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-8 21:35:05 | 只看该作者 Only view this author
yb110 发表于 2024-9-7 02:23
有没有大佬,可以回答一下ORCA 6.0.0, Windows, 64bit, autoci / parallel part ;ORCA 6.0.0, Windows, 64 ...


量子化学程序ORCA的安装方法
http://sobereva.com/451http://bbs.keinsci.com/thread-11697-1-1.html
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发表于 Post on 2024-9-8 22:20:15 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-9-8 09:35
实在不好意思,才疏学浅、词不达意,浪费您很多时间,我用图片来展示吧。这里说的“电子”分布,是针对s0 ...

因为空穴分布有区别。只要同时讨论电子的分布和空穴的分布就行了
Zikuan Wang
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Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2024-9-8 22:22:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-8 21:19
gjf文件不在当前目录下,你又没写目录名,当然找不到文件
属于计算基本常识的问题

检查了果然是这样 计算小白实在不好意思 谢谢sob老师的指点

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发表于 Post on 2024-9-8 22:24:02 | 只看该作者 Only view this author
时间似深海 发表于 2024-9-8 09:56
请教下大佬,自学的Gaussian,组内没有买授权,之前发期刊文章挂的其他学校老师名字,请问毕业论文里可以写 ...

规定上不强制,情理上应当放。类比你借用其他组仪器的情形,毕业论文可以写相关内容,但应当致谢主管仪器的老师
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2024-9-9 10:01:53 | 只看该作者 Only view this author
请问如何计算三重态的UV-Vis,是先优化三重态结构,然后用优化坐标进行TDDFT计算?TDDFT计算关键词指定为TD(triplet, nstates=10)即可,这样是对的吗?

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发表于 Post on 2024-9-9 14:21:59 | 只看该作者 Only view this author
archer 发表于 2024-9-9 03:01
请问如何计算三重态的UV-Vis,是先优化三重态结构,然后用优化坐标进行TDDFT计算?TDDFT计算关键词指定为TD ...

所有计算的自旋多重度写3,TD里面不写triplet。但因为自旋污染,结果很可能不靠谱,建议用BDF的X-TDDFT算,或用ORCA的DFT/ROCIS算,或用多参考态方法算
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2024-9-9 16:35:45 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-9-9 14:21
所有计算的自旋多重度写3,TD里面不写triplet。但因为自旋污染,结果很可能不靠谱,建议用BDF的X-TDDFT算 ...

感谢回复,TD里面不写triplet是因为triplet可能激发到singlet吗?

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发表于 Post on 2024-9-9 19:15:06 | 只看该作者 Only view this author
archer 发表于 2024-9-9 09:35
感谢回复,TD里面不写triplet是因为triplet可能激发到singlet吗?

不是,是因为triplet关键词的意思是“基态是单重态且激发态是三重态”。如果基态不是单重态,比如是n重态,那么计算会自动得到n重激发态和(n+2)重激发态,因为自旋污染的关系两者会混合。因为有这种混合,只算n重激发态而不算(n+2)重激发态反而是困难的。
相比之下,基态是闭壳层单重态的时候,激发态都是纯的单重态和三重态,所以当用户只需要单重态时,可以不算三重态以节约时间,也就导致有一个关键词专门用来打开三重态的计算
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2024-9-10 14:14:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-9-9 19:15
不是,是因为triplet关键词的意思是“基态是单重态且激发态是三重态”。如果基态不是单重态,比如是n重态 ...

谢谢回答!我的理解没问题吧,如果我的分子基态是单重态闭壳层。我想计算该分子三重态的UV-vis,就是按上述的做法,优化三重态。计算三重态的TDDFT时指定自旋为3,写上TD关键词,其中不写triplet。

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发表于 Post on 2024-9-10 15:38:01 | 只看该作者 Only view this author
archer 发表于 2024-9-10 07:14
谢谢回答!我的理解没问题吧,如果我的分子基态是单重态闭壳层。我想计算该分子三重态的UV-vis,就是按上 ...

对,但注意自旋污染问题,如果自旋污染太严重可以改用X-TDDFT或多参考态方法
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2024-9-10 18:07:38 | 只看该作者 Only view this author
请教下大佬,在CFOUR中算完得到的MOLDEN文件中每个分子轨道所显示的原子轨道组分中原子轨道的数量为什么会比输出文件中的分子轨道多?理论上应该是有多少个原子轨道就有多少个分子轨道嘛

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