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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2025-7-17 18:06:08 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2025-7-17 16:19
各位老师好,目前需要算锕系离子和各种气体的反应,研究反应路径,了解到静态相关强,但本人目前技术十分有 ...

最好查类似体系的文献确定,如果没有类似文献,自己做一些benchmark确定。可能最优泛函也和你研究的气体有关
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2025-7-18 01:07:04 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian 16 opt 优化问题

优化最终结果显示:
NAtoms=  194 NActive=  194 NUniq=  194 SFac= 1.00D+00 NAtFMM=   60 NAOKFM=T Big=T
Integral buffers will be    131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned off.
Nuclear repulsion after empirical dispersion term =    38713.5129773059 Hartrees.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=  2406 RedAO= T EigKep=  2.30D-04  NBF=  2406
NBsUse=  2406 1.00D-06 EigRej= -1.00D+00 NBFU=  2406
Initial guess from the checkpoint file:  "TB12CPPC70.chk"
B after Tr=     0.003769   -0.021051    0.070933
         Rot=    1.000000   -0.000096    0.000325    0.000093 Ang=  -0.04 deg.
ExpMin= 1.17D-01 ExpMax= 2.19D+04 ExpMxC= 3.30D+03 IAcc=2 IRadAn=         4 AccDes= 0.00D+00
Harris functional with IExCor= 1009 and IRadAn=       4 diagonalized for initial guess.
HarFok:  IExCor= 1009 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=         4 IDoV= 1 UseB2=F ITyADJ=14
ICtDFT=  3500011 ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=        2001
         NFxFlg=           0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
         wScrn=  0.000000 ICntrl=       500 IOpCl=  0 I1Cent=   200000004 NGrid=           0
         NMat0=    1 NMatS0=      1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
Symmetry not used in FoFCou.
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on             energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.

请问老师这个是什么原因,是收敛不了吗

TB12CPPC70.gjf

11.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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发表于 Post on 2025-7-18 03:01:10 | 只看该作者 Only view this author
这个看上去是还在计算中?如果进程已经终止了是不是意外终止了?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-18 06:19:45 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2025-7-17 16:19
各位老师好,目前需要算锕系离子和各种气体的反应,研究反应路径,了解到静态相关强,但本人目前技术十分有 ...

DFT范畴内,建议用PBE0-D3(BJ)做这个的opt freq,多数情况定性正确
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-18 07:18:54 | 只看该作者 Only view this author
qf_code 发表于 2025-7-18 01:07
优化最终结果显示:
NAtoms=  194 NActive=  194 NUniq=  194 SFac= 1.00D+00 NAtFMM=   60 NAOKFM=T Bi ...

正常提示
还在算就继续等着
如果任务已经停了,下文里搜 停了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
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发表于 Post on 2025-7-19 16:36:51 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请问对于用gaussian做ONIOM,高层电荷自旋分别为-2、1,低层为2,1,那么在电荷/自旋多重度那一行应该怎么写呢?是 “2 1 -2 1 -2 1” 吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-25 15:11:50 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2025-7-19 16:36
各位老师好,请问对于用gaussian做ONIOM,高层电荷自旋分别为-2、1,低层为2,1,那么在电荷/自旋多重度那一 ...

把北京科音中级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KBQC)幻灯片这两页看懂了自然就明白了


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发表于 Post on 2025-7-31 14:29:21 | 只看该作者 Only view this author
社长好,我在提交ORCA任务时报错了,看了一下日志好像是内存不足?机器是9950X,内存96G,我应该如何设置呢?期待回答 orca.out (72.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-31 15:01:05 | 只看该作者 Only view this author
wbqdssl 发表于 2025-7-31 14:29
社长好,我在提交ORCA任务时报错了,看了一下日志好像是内存不足?机器是9950X,内存96G,我应该如何设置呢 ...

硬盘可能也写满了,检查临时文件的尺寸
降低核数,要么别用DLPNO-CCSD(T)。你这个体系用wB97M-V就已经能得到足够好的结果
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发表于 Post on 2025-7-31 15:13:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-7-31 15:01
硬盘可能也写满了,检查临时文件的尺寸
降低核数,要么别用DLPNO-CCSD(T)。你这个体系用wB97M-V就已经能 ...

好的,感谢社长的解答!

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发表于 Post on 2025-7-31 21:00:55 | 只看该作者 Only view this author

建模文件计算时出现无法计算的问题

用建模分子之后生成的gjf文件(里面是坐标),导入计算时出现了Error Massage # 2066,这个要怎么解决呢?

202507312059422033..png (25.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202507312059422033..png

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鸩羽

4572#
发表于 Post on 2025-7-31 21:23:23 | 只看该作者 Only view this author
虽然不建议贴这个信息量极少界面来问报错 但当前问题能看出来应该是缓存目录没权限/磁盘满
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-1 02:17:14 | 只看该作者 Only view this author
WHY12138 发表于 2025-7-31 21:00
用建模分子之后生成的gjf文件(里面是坐标),导入计算时出现了Error Massage # 2066,这个要怎么解决呢?
...

正确拼写Message。Massage是按摩

99%的可能性是Gaussian没恰当安装,临时文件目录被指定到了不存在的目录或者没有写入权限的目录,导致临时文件没法创建
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发表于 Post on 2025-8-1 08:40:20 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-7-31 21:23
虽然不建议贴这个信息量极少界面来问报错 但当前问题能看出来应该是缓存目录没权限/磁盘满

谢谢

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4575#
发表于 Post on 2025-8-1 08:40:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-8-1 02:17
正确拼写Message。Massage是按摩

99%的可能性是Gaussian没恰当安装,临时文件目录被指定到了不存在的 ...

好的好的,谢谢

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