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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-1-11 17:13:39 | 只看该作者 Only view this author
再次麻烦下Sob老师,
我在使用混合基组时,Fe用的是lanl2dz,CHON用的是cc-pvTZ,前者是双zeta赝势,后者是三zeta基组
是否需要将两者都变成双zeta赝势或三zeta的形式?两个不一致对结果有大影响吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-11 17:25:19 | 只看该作者 Only view this author
misaki 发表于 2017-1-11 16:56
那老师优势路线是能垒最低的那条么,既是交叉了?也顺便请老师推荐下优化与单点能基组。

实际走的未必是能量最低的那条,看诸如Acc. Chem. Res. 2000, 33, 139-145的讨论
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-1-12 00:28:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lastzealot 于 2017-1-12 00:58 编辑

Sob老师您好,有一个问题想请教一下。
请问,绝热电离能ADE是是不是优化后的A(n+)离子能量减去优化后的A(n-1)+离子的能量啊?
有的文献里面常用这个能量来比较稳定性,
但是我不大清楚这个能量代表什么物理意义,为什么能够用来比较稳定性呢?
除此之外,ADE还常用来说明啥问题呢?
谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-12 03:06:52 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-1-12 00:28
Sob老师您好,有一个问题想请教一下。
请问,绝热电离能ADE是是不是优化后的A(n+)离子能量减去优化后的A(n ...

那直译不叫绝热电离能,而叫绝热电子脱附能。可以理解为阴离子的绝热电离能。
ADE比较小,说明电子容易从体系中跑掉,如果从这层含以上说不稳定也凑合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-1-12 05:38:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-1-11 03:43
HF成分越高的杂化泛函激发能越高是大趋势,基于HF的CIS激发能更是高达2~3eV,而纯泛函则明显低估激发能, ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2017-1-12 08:41:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-1-12 03:06
那直译不叫绝热电离能,而叫绝热电子脱附能。可以理解为阴离子的绝热电离能。
ADE比较小,说明电子容易 ...

首先感谢老师的解答
其实文献里面还有一个叫VDE,那就应该翻译成垂直电子脱附能了吧。
请问ADE和VDE的计算方法是不是,
ADE是阴离子和中性分子都是基态
VDE是阴离子为基态,中性分子的结构同阴离子相同而未经优化

不知道我的理解对不对
谢谢老师
麻烦您了

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发表于 Post on 2017-1-12 11:17:42 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 登登 于 2017-1-12 15:35 编辑

file:///C:\Users\Administrator\AppData\Roaming\Tencent\Users\645129224\QQ\WinTemp\RichOle\I]AY~1%2K67}GS@}7L(49CH.png
老师,您好,前些日子参加完您的量化初级班,回来我尝试了算了一下课题里面的东西。我主要计算CO2,O2,H2O和碳基质的反应(化学解离吸附和脱附问题),碳机制上会链接碱金属Na和K,还有含氧官能团,体系大概如图片所示,之前因为在普通8核的台式机上试算,我按您说的先在低级别下优化搜过渡态,在高级别下算单点,我用b3lyp/6-31g(d,p)来优化搜过渡态,用M062X/def2TZVP算单点。和导师商量之后前几天租了超算,所以想着能不能改进一下计算级别,文献中对于我这样的体系有人加弥散也有人没加,看了您的贴子但还有点不放心,所以想来问问您我这个情况应该用什么计算级别比较好。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-12 12:19:58 | 只看该作者 Only view this author
登登 发表于 2017-1-12 11:17
老师,您好,前些日子参加完您的量化初级班,回来我尝试了算了一下课题里面的东西。我主要计算CO2,O2,H ...


当前级别就非常合理。如果想省点时间可以优化时候把氢的极化去掉。
优化时候绝对不需要加弥散。对于带金属离子的,算单点的时候可以带(即ma-TZVP)。
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发表于 Post on 2017-1-12 15:35:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-1-12 12:19
当前级别就非常合理。如果想省点时间可以优化时候把氢的极化去掉。
优化时候绝对不需要加弥散。对于带 ...

谢谢老师回复

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发表于 Post on 2017-1-12 19:27:38 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,不好意思有个问题想请教一下您。
在计算tddft的输出文件中,每一个峰对应一组而不是一个跃迁方式。
但是,同一个组中每一个跃迁的能量都不一样(用终态能级能量减去初态能级能量),为什么这些跃迁方式所体现出来的吸收峰是一个单一的峰而不是一组峰呢?
谢谢老师

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发表于 Post on 2017-1-12 21:28:19 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,请教您一个问题
文献中有时会看到跃迁截面transition cross section,请问这个词有什么物理意义
另外,在做tddft时输出文件中会有各种跃迁的振子强度oscilator strength数据,请问振子强度与跃迁截面有定量关系吗
谢谢老师
麻烦您了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-13 03:47:01 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-1-12 21:28
Sob老师,请教您一个问题
文献中有时会看到跃迁截面transition cross section,请问这个词有什么物理意义
...

不清楚
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-13 03:55:16 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-1-12 19:27
Sob老师,不好意思有个问题想请教一下您。
在计算tddft的输出文件中,每一个峰对应一组而不是一个跃迁方式 ...

看此文,弄清楚实际观测的峰是怎么通过各个跃迁展宽出的峰叠加产生的
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD和VCD光谱图
http://sobereva.com/224
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发表于 Post on 2017-1-13 12:26:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-1-13 03:55
看此文,弄清楚实际观测的峰是怎么通过各个跃迁展宽出的峰叠加产生的
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-V ...

谢谢老师
您的那篇大作写的太好了 拜读了

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发表于 Post on 2017-1-13 12:50:52 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,不好意思又来打扰您。
我目前已经通过PBE方法得到了一个分子的基态电子结构,想做一下激发态曲线的势能面扫描(示意图如下),不知道我的设计思路对不对,想请教一下您。
1 做一次TDDFT,得到跃迁方式
2 按照一定顺序,通过改变不可约表示下电子占据强制把某一单电子填入空轨道,做势能面扫描(我的结构为Oh对称性,在扫描时固定对称性对称性)

不知道这个设计思路能否得到类似图中的曲线。

谢谢老师,麻烦了。

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