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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-2-18 20:35:56 | 只看该作者 Only view this author
了解了,谢谢您!

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发表于 Post on 2017-2-18 20:54:42 | 只看该作者 Only view this author
请问gauss中怎么计算活化能?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-18 21:03:56 | 只看该作者 Only view this author
clvn 发表于 2017-2-18 20:54
请问gauss中怎么计算活化能?

TS的自由能减反应物的自由能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-2-18 21:37:22 | 只看该作者 Only view this author
可是,我记得活化自由能是包括3部分的,但是又不记得是哪3个了,请您指教!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-18 21:41:54 | 只看该作者 Only view this author
clvn 发表于 2017-2-18 21:37
可是,我记得活化自由能是包括3部分的,但是又不记得是哪3个了,请您指教!

怎么算自由能看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
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发表于 Post on 2017-2-19 12:40:22 | 只看该作者 Only view this author
寻找过渡态,频率计算,焓变,自由能,内能等计算是不是必须在相同的计算方法(如MP2,必须所有都是MP2,不能使ump2吗?),相同的基组下完成吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-19 18:03:53 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-2-19 12:40
寻找过渡态,频率计算,焓变,自由能,内能等计算是不是必须在相同的计算方法(如MP2,必须所有都是MP2,不 ...

频率计算和优化必须是一个级别,但是和单点不需要一个级别。内能、焓等热力学量是单点能和频率计算得到的热力学量校正之和。

高斯里对自旋多重度>1的开壳层体系写MP2自然而然就是UMP2
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发表于 Post on 2017-2-19 18:58:54 | 只看该作者 Only view this author
请教问题:我看了sob老师的计算TST速率的Excel,我想请问,为什么exp内部包含R呢,我记得公式里面没有吧?
还有就是关于配分函数,您说包含ZPE用Q(v=0),而我老师说用Q(bot),我很疑惑:下面是他发给我的一段话:The lines labeled BOT are for the vibrational partition function computed with the zero of energy being the bottom of
the well, while those labeled with (V=0) are computed with the zero of energy being the first vibrational level. Again, special lines are printed out for the low frequency modes.
还请您答疑解惑,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-19 19:44:44 | 只看该作者 Only view this author
clvn 发表于 2017-2-19 18:58
请教问题:我看了sob老师的计算TST速率的Excel,我想请问,为什么exp内部包含R呢,我记得公式里面没有吧?
...


本来exp里就是有R的(不过通常在公式里用kb表示),用R是因为势垒用的是每mol的
用电子能量求差才用Q(bot),用U(0)求差就用Q(v=0)。
如果不信你可以和kisthelp程序的结果对比验证。
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发表于 Post on 2017-2-19 19:52:00 | 只看该作者 Only view this author
那您的单分子公式可以做单分子的cvt吗?

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发表于 Post on 2017-2-19 19:57:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-2-19 19:44
本来exp里就是有R的(不过通常在公式里用kb表示),用R是因为势垒用的是每mol的
用电子能量求差才用Q( ...

1.那Kb不是玻尔兹曼常数吗?在您的公式里,exp内部有了R,就没有了Kb
2.目前我想做没有过渡态的cvt,请问您在用kisthelp的时候还需要计算IRC吗?

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发表于 Post on 2017-2-19 20:08:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-2-19 19:44
本来exp里就是有R的(不过通常在公式里用kb表示),用R是因为势垒用的是每mol的
用电子能量求差才用Q( ...

还有一个问题,能请您解答一下吗?就是关于您Excel速率计算exp内部的式子,能请您解释一下吗?

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发表于 Post on 2017-2-19 22:18:14 | 只看该作者 Only view this author
请问老师gaussian算频率后如何查到熵值S?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-20 01:11:17 | 只看该作者 Only view this author
clvn 发表于 2017-2-19 19:57
1.那Kb不是玻尔兹曼常数吗?在您的公式里,exp内部有了R,就没有了Kb
2.目前我想做没有过渡态的cvt,请 ...

已经回复了,用R是因为势垒用的是每mol的
或许有自由能垒,计算IRC每个点的自由能。如果连自由能垒都没有,就与IRC无关了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-20 01:18:19 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2017-2-19 22:18
请问老师gaussian算频率后如何查到熵值S?


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