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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-15 10:59:53 | 只看该作者 Only view this author
dali 发表于 2019-2-15 10:35
sob老师,我厚颜再问一下。我实在是按着您的视频一步一步操作的,multiwfn也是最新的,在VMD官网下的1.9. ...

vmd.rc就是个文本文件,用什么编辑都无所谓
别把VMD安装到有空格的路径下,如果非得有空格,改Multiwfn里bat文件的时候记得路径两头加上双引号
若还有问题,在搞懂博文里说的每一步的含义的情况下,自行调试弄清楚到底是哪一步出了问题。
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发表于 Post on 2019-2-15 12:46:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-2-15 10:59
vmd.rc就是个文本文件,用什么编辑都无所谓
别把VMD安装到有空格的路径下,如果非得有空格,改Multiwfn ...

好,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2019-2-16 03:03:23 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,请问什么是组态相互作用效应,这个在计算中应该如何考虑?非常感谢

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发表于 Post on 2019-2-16 16:23:50 | 只看该作者 Only view this author

pcm的写法问题

请问sob老师用pcm溶剂化模型,可以不写这个关键词吗?之前看滥用的关键词那篇帖子里说不用写,今天看另一篇帖子说不写默认的是iefpcm模型?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-16 17:27:04 | 只看该作者 Only view this author
shiyanan 发表于 2019-2-16 16:23
请问sob老师用pcm溶剂化模型,可以不写这个关键词吗?之前看滥用的关键词那篇帖子里说不用写,今天看另一篇 ...

这里写得很清楚
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-16 17:27:30 | 只看该作者 Only view this author
lianghuashou 发表于 2019-2-16 03:03
sob老师,请问什么是组态相互作用效应,这个在计算中应该如何考虑?非常感谢

没上下文,“组态相互作用效应”没法说,本来这个词也不是什么标准、常用的词
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发表于 Post on 2019-2-16 20:27:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-2-16 17:27
没上下文,“组态相互作用效应”没法说,本来这个词也不是什么标准、常用的词

我在计算大的芳香体系的荧光性质时,采用了一般的TDDFT的方法,但是有个老师提出疑问,说大的共轭体系的组态相互作用效应比较明显,需要考虑,我没有找到组态相互作用的定义,因此想问下sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-17 08:05:29 | 只看该作者 Only view this author
lianghuashou 发表于 2019-2-16 20:27
我在计算大的芳香体系的荧光性质时,采用了一般的TDDFT的方法,但是有个老师提出疑问,说大的共轭体系的 ...

直接问他
这个词用得很不恰当
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发表于 Post on 2019-2-19 23:14:03 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Jameslzy 于 2019-2-19 23:24 编辑

Sob老师好,最近重新拜读您的双正交方法处理非限制性开壳层波函数的博文,发现可以计算双正交轨道的能量了。博文中写计算能量需要NBO的.47文件。我首先利用咱们的Multiwfn程序中主功能100的子功能2用fchk文件生成了一个.47文件,当利用这个.47文件计算双正交轨道能量的时候发生了以下错误,提示找不到Fock矩阵,想请教下老师这是什么原因导致的,是不是在写输入文件的时候缺少什么关键词,应该怎么解决比较好,谢谢老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-20 00:09:59 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2019-2-19 23:14
Sob老师好,最近重新拜读您的双正交方法处理非限制性开壳层波函数的博文,发现可以计算双正交轨道的能量了 ...

fch里不包含Fock矩阵信息,所以通过fch文件转换出来的.47里面也没有Fock矩阵。只有Gaussian等量化程序调用NBO输出的.47才包含。

如本帖1L所示,波函数分析的问题以后请到Multiwfn答疑专贴询问
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发表于 Post on 2019-2-20 09:42:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-2-20 00:09
fch里不包含Fock矩阵信息,所以通过fch文件转换出来的.47里面也没有Fock矩阵。只有Gaussian等量化程序调 ...

谢谢老师回复,我整理下问题到Multiwfn帖子中再询问一下

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发表于 Post on 2019-2-21 14:18:59 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,催化剂本身不含氧原子时, “Mars van Krevelen mechanism的反应路径就不存在”  对吗? 我使用的催化剂只有C、N、Fe三种院子,计算NO被O2催化氧化的路径,手稿里涉及ER和LH两种机制,结果审稿人要求给出Mars van Krevelen mechanism,可是我认为O原子应该都是氧气吸附在催化剂上的,既然催化剂本身无O,就不该存在Mars van Krevelen mechanism。请老师解惑

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-21 22:32:12 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2019-2-21 14:18
请问老师,催化剂本身不含氧原子时, “Mars van Krevelen mechanism的反应路径就不存在”  对吗? 我使用 ...

你这个问题太专了,没听说过,单独发个帖子吧
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发表于 Post on 2019-2-23 10:11:26 | 只看该作者 Only view this author
请问deltamu的计算公式是什么?也就是激发态与基态偶极矩的差,以前在sob老师的帖子里看到过,当时没保存,现在又找不到了。

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发表于 Post on 2019-2-23 21:33:21 | 只看该作者 Only view this author

振动分析报错WANTED AN INTEGER AS INPUT

输入文件%chk=re_II_Fe_III_2state_5_freq1.chk #p ub3lyp/genecp freq  SCRF=(SMD,Solvent=Generic,Read)   scfcyc=400 scf=vshift=300

输出文件报错信息
WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A FLOATING POINT NUMBER AS INPUT.
    1.82600000000000       0.769344841456132                                    












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Error termination via Lnk1e in /share/apps/g09b02/g09/l301.exe at Sun Feb 24 18:28:30 2019.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.6 seconds.
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   rdx 0000000000006f55, rsp 00007fff6b0117d8, rbp 00007fff6b011db0
   rsi 000000000000000b, rdi 0000000000006f55, r8  00002b5cd641aca0
   r9  0000000000000000, r10 00007fff6b011560, r11 0000000000000206
   r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007fff6b011df8
   r15 00007fff6b016558
  --- traceback not available

求帮助,谢谢!!


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