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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-18 06:25:04 | 只看该作者 Only view this author
xu123123 发表于 2025-7-17 10:33
请问老师,我画静电势的图
对于同一个结构,我双击脚本文件ESP.bat ESP.pt,然后算出来的文件density1.cub ...

使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html

文中明确说了,脚本修改了默认的格点间距

认真把下文看了了解脚本运行原理,自然就全都清楚了
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2025-7-25 22:25:07 | 只看该作者 Only view this author
渲染之后图片的像素比较低,运行VMDrender_full.bat之后得到的图片像素提高了,但亮度太高,使结构无法清楚展示,请问老师这个要怎么解决

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-26 12:25:19 | 只看该作者 Only view this author
zmx. 发表于 2025-7-25 22:25
渲染之后图片的像素比较低,运行VMDrender_full.bat之后得到的图片像素提高了,但亮度太高,使结构无法清楚 ...

调整渲染选项
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-7-26 21:19:16 | 只看该作者 Only view this author

好的,我试一下,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2025-7-28 21:57:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zmx. 于 2025-7-28 22:01 编辑
zmx. 发表于 2025-7-26 21:19
好的,我试一下,谢谢sob老师

老师您好,之前提问过的问题:Tachyon渲染之后图片的像素比较低,运行VMDrender_full.bat或者VMDrender_noshadow之后得到的图片像素提高了,但亮度太高导致曝光。您之前回答我说可以调整渲染选项,但是我尝试了一下没有找到调哪个地方,新手求老师详细指教

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发表于 Post on 2025-7-28 23:51:12 | 只看该作者 Only view this author
zmx. 发表于 2025-7-28 21:57
老师您好,之前提问过的问题:Tachyon渲染之后图片的像素比较低,运行VMDrender_full.bat或者VMDrender_n ...

目前我是将VMDrender_full.bat里的内容修改了一下,已经得到了相对清晰的图片,麻烦老师了

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