简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

sobereva · 发表于 Post on 2018-6-22 22:18:03

Chenglong_li 发表于 2018-6-22 15:53
（1）使用Multiwfn将有机化合物保存为*.pdb文件；（2）使用VMD打开该pdb文件；（3）输入set all [atomsel ...

对

Chenglong_li · 发表于 Post on 2018-6-24 00:02:57

本帖最后由 Chenglong_li 于 2018-6-24 00:04 编辑

请问使用Multiwfn算出每个原子附近表面静电势时，原子编号是否是和GaussView打开fch文件时label在原子上的编号一致？多谢

sobereva · 发表于 Post on 2018-6-24 11:47:51

Chenglong_li 发表于 2018-6-24 00:02
请问使用Multiwfn算出每个原子附近表面静电势时，原子编号是否是和GaussView打开fch文件时label在原子上的 ...

一致
PS：进入Multiwfn主功能0，直接就能看到原子编号

ABetaCarw · 发表于 Post on 2018-6-30 12:12:47

老师好，我想做一个配合物的CDA 分析，计算的时候中心那个金属原子用的是赝势基组。然后Multiwfn提示我
Error: The sum of the number of basis functions in all fragments is inconsistent with complex! Please carefully check the basis set you used in each calculation.
这种情况是不是只能所有的原子包括中心配体金属都用一个基组才能算？例如用def2svp

sobereva · 发表于 Post on 2018-6-30 16:45:41

ABetaCarw 发表于 2018-6-30 12:12
老师好，我想做一个配合物的CDA 分析，计算的时候中心那个金属原子用的是赝势基组。然后Multiwfn提示我
E ...

不是。如果你基组写的格式方面没问题，通常是因为有的计算用的是笛卡尔型基函数，有的用的是球谐型基函数。计算时候所有计算都加上5d 7f就可解决问题。

Chenglong_li · 发表于 Post on 2018-7-5 16:00:44

有机化合物opt几何优化完成后，使用polar关键词计算静态（超）极化率，后在Multiwfn分析的结果中Dipole moment的X, Y, Z数据与Gaussian的LOG文件中Dipole moment (field-independent basis, Debye)的X, Y, Z数据不同，请问这个是什么原因？多谢！

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-6 01:28:51

Chenglong_li 发表于 2018-7-5 16:00
有机化合物opt几何优化完成后，使用polar关键词计算静态（超）极化率，后在Multiwfn分析的结果中Dipole mom ...

Gaussian输出的偶极矩一种是标准朝向下的，一种是输入朝向下的（末尾的archive段落），Multiwfn给出的对应后者
不懂什么叫标准朝向看
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297

mly12345 · 发表于 Post on 2018-7-7 23:52:44

老师好，在计算激发态的轨道时发现各激发态由多个轨道共同贡献，所以选择MULTIWFN里的HOLE-ELECTRON的方式来表示电子跃迁情况。想请问一下为什么会出现以上的情况呢？是由于分子结构吗？比如分子偶极距或者共轭程度的原因？没有看到相关的文献所以希望老师指教，谢谢了！

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-8 04:23:10

mly12345 发表于 2018-7-7 23:52
老师好，在计算激发态的轨道时发现各激发态由多个轨道共同贡献，所以选择MULTIWFN里的HOLE-ELECTRON的方式 ...

不要想多
本来这就是电子态之间的跃迁，一个电子态对应一个多电子波函数，而分子轨道只是单电子近似下的产物，哪可能总是只用一对轨道跃迁就能完美描述

mly12345 · 发表于 Post on 2018-7-9 09:30:14

sobereva 发表于 2018-7-8 04:23
不要想多
本来这就是电子态之间的跃迁，一个电子态对应一个多电子波函数，而分子轨道只是单电子近似下 ...

谢谢老师，那同样的分子不同的构型会导致激发态和分子轨道特征不同吗？分子结构和激发态的轨道特征又是如何联系的呢？

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-9 09:38:30

mly12345 发表于 2018-7-9 09:30
谢谢老师，那同样的分子不同的构型会导致激发态和分子轨道特征不同吗？分子结构和激发态的轨道特征又是如 ...

会
没有简单联系

mly12345 · 发表于 Post on 2018-7-9 09:54:47

sobereva 发表于 2018-7-9 09:38
会
没有简单联系

谢谢老师，那我具体应该看一些关于哪方面的资料呢？

xjtu_wcl · 发表于 Post on 2018-7-9 10:29:23

Sob老师 Multiwfn 能用matlab调用吗？我想用multiwfn做分子静电势的批处理，记得您说过批处理的问题，但找不到了，想问下您matlab可以吗？multiwfn的静电势的统计结果输出除了复制粘贴能否输出txt或者其他格式

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-9 13:02:07

xjtu_wcl 发表于 2018-7-9 10:29
Sob老师 Multiwfn 能用matlab调用吗？我想用multiwfn做分子静电势的批处理，记得您说过批处理的问题，但找 ...

没试过matlab调用
通过重定向的方式就能把输出信息导出到文本文件里，看手册5.2和5.3节

Adair · 发表于 Post on 2018-7-10 17:18:25

本帖最后由 Adair 于 2018-7-10 17:21 编辑

各位坛友，老师:我在用Multiwfn绘制跃迁密度矩阵平面图（TDM）的时候，按照操作步骤，中间有一步提示“If symmetrizing the transition density matrix?<y/n>”我不太明白这一步选“y”或是选“n”,在结果上有会造成什么样的区别，烦请各位有明白这一块的能给我点拨一下，谢谢。下面的图是我选择“y”和“n”分别得到的跃迁密度矩阵平面图。
E:\pic\choose-y.png
E:\pic\choose-n.png

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴