简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

Adair · 发表于 Post on 2018-7-22 15:38:39

各位老师，同学；我已经使用Multiwfn计算了分子的跃迁偶极矩，接下来想计算永久偶极矩，但是不太会算，在手册上也没太找到相应的内容，哪位老师同学知道如何计算永久偶极矩，希望能够指导一下，谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-23 14:53:44

Adair 发表于 2018-7-22 15:38
各位老师，同学；我已经使用Multiwfn计算了分子的跃迁偶极矩，接下来想计算永久偶极矩，但是不太会算，在 ...

轻易一搜论坛就有答案
http://bbs.keinsci.com/thread-10443-1-1.html

mly12345 · 发表于 Post on 2018-7-24 17:50:33

老师好，我像问一下在计算分子的电荷量转移百分比的时候，应该是基态的用基态几何优化的结果，激发态用激发态的几何优化结果吗？
输入文件：
基态：
%mem=2GB
%chk=B-charge-S0.chk
#p CAM-B3LYP/genecp int=fine

B3LYP

0 1
坐标
=================
S1激发态：
%mem=2GB
%chk=B-charge-S1-1.chk
#p CAM-B3LYP/genecp int=fine td(root=1) density out=wfn

title

0 1
================

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-24 18:20:35

mly12345 发表于 2018-7-24 17:50
老师好，我像问一下在计算分子的电荷量转移百分比的时候，应该是基态的用基态几何优化的结果，激发态用激发 ...

研究垂直激发的过程就用基态优化的结构，研究垂直发射的过程就用激发态优化的结构

329678001 · 发表于 Post on 2018-7-26 17:25:48

sob老师，我想用Multiwfn算Wiberg或者Mayer键级。我得到了4个输出的键级。1.Bond order matrix for alpha electrons ，2.Bond order matrix for beta electrons 3.Bond order matrix for all electrons ，4.Bond order matrix from mixed density 。
一：我想判断成键强弱，我应该用那种输出的键级呢？
二：我高斯自带的是NBO3.1版本的。Multiwfn得到的Wiberg键级是属于哪个版本下的呢？
三：我这里保存了一个之前的fchk文件，我用GV查看，好像也没破损啊，不知为何我用Multiwfn查看键序时候闪退了。

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-26 18:13:34

329678001 发表于 2018-7-26 17:25
sob老师，我想用Multiwfn算Wiberg或者Mayer键级。我得到了4个输出的键级。1.Bond order matrix for alpha ...

1 用Bond order matrix for all electrons
2 Multiwfn是Multiwfn，NBO是NBO，怎么会有“Multiwfn得到的Wiberg键级是属于哪个版本下的呢”这样的问题？
Multiwfn计算Wiberg键级的原理在手册3.11.3节写明了
3 fch文件有问题，说不清楚就连同输入文件压缩后上传。gv能打开就不代表fch文件就没问题

329678001 · 发表于 Post on 2018-7-26 18:35:54

sobereva 发表于 2018-7-26 18:13
1 用Bond order matrix for all electrons
2 Multiwfn是Multiwfn，NBO是NBO，怎么会有“Multiwfn得到 ...

是这样的，我高斯自带的是NBO3.1版本的，我在想Wiberg键序是不是和NBO的版本有关，所以才有此一问。
我查看其中N=O键键级，距离是1.19935埃。高斯算的wiberg是1.7346，Multiwfn上得到的是2.42010262。Multiwfn上得到的Mayer键级是1.76085609。
（本来我课题组一直沿用的都是高斯上自带的NBO算键序。我师妹之前算不同体系的N=O键级时候，发现得到的结果不准确，有的N=O更长，但是Wiberg键级却更大。）

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-26 18:45:42

329678001 发表于 2018-7-26 18:35
是这样的，我高斯自带的是NBO3.1版本的，我在想Wiberg键序是不是和NBO的版本有关，所以才有此一问。
我 ...

NBO程序一直都是基于NAO算Wiberg键级，公式就是Multiwfn手册上的。不同NBO版本原理上没差异，但可能由于不同NBO版产生的NAO不同，导致结果有异
Multiwfn算Wiberg键级用的是Lowdin正交化后的基函数算的
若无特殊情况，也没用弥散函数，用Multiwfn里的Mayer键级就完了，甭用Wiberg键级也甭用NBO

lianghuashou · 发表于 Post on 2018-7-27 10:22:21

sobereva老师，我想分析 In-Br 成键的类型是离子键和共价键，做了电荷密度差的图，如果只考虑黄色区域的话，实线表示离子键，如果考虑红色区域的话，实线虚线都有，就不知道是什么键了
希望老师指点一下，
另外我也做了Mayer bond order， IN-Br的键级是0.384

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-27 20:44:22

lianghuashou 发表于 2018-7-27 10:22
sobereva老师，我想分析 In-Br 成键的类型是离子键和共价键，做了电荷密度差的图，如果只考虑黄色区域的话 ...

只要原子成键区域中央有电子密度增加的区域（如你黄色方框所示），就代表有一定程度的共价作用。所以当前可以认为有一定共价作用，但鉴于Mayer键级不大，所以只是较弱的共价作用

TreeHoleTeller · 发表于 Post on 2018-7-30 08:49:29

sobereva老师您好，我需要考察对多环芳烃不同位置加氢后对特定C-C键能的影响，之前考虑利用NBO中的Lewis轨道占据来解释这个影响，但教程后面提到NBO不适用于高度电子离域的体系，所以选择NBO是否不妥呢？是的话，请问利用Multiwfn中的哪项分析功能更合适呢？
感谢sobereva老师！

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-30 10:53:17

TreeHoleTeller 发表于 2018-7-30 08:49
sobereva老师您好，我需要考察对多环芳烃不同位置加氢后对特定C-C键能的影响，之前考虑利用NBO中的Lewis轨 ...

用Multiwfn计算拉普拉斯键级，或者用Multiwfn做AIM分析考察BCP属性来分析多好，参考比如
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414
成键分析问题用Multiwfn比NBO强得多得多

刘小英雄steven · 发表于 Post on 2018-7-31 09:13:50

sob老师，文章提到Fe-N/C (分别属于NO和CO) 之间有电子富集区的重叠，所以N/C和Fe的键能很大，这是为什么呢？如果两个原子间是电子损失区的重叠，是不是也说明键能很大？谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2018-8-1 05:25:50

刘小英雄steven 发表于 2018-7-31 09:13
sob老师，文章提到Fe-N/C (分别属于NO和CO) 之间有电子富集区的重叠，所以N/C和Fe的键能很大，这是为什么呢 ...

共价作用导致成键原子间的成键区域中电子密度增加。如果电子密度减小，那就说明没有共价作用，而且还可能存在严重交换互斥，导致它们倾向于分离

刘小英雄steven · 发表于 Post on 2018-8-1 09:53:09

sobereva 发表于 2018-8-1 05:25
共价作用导致成键原子间的成键区域中电子密度增加。如果电子密度减小，那就说明没有共价作用，而且还可能 ...

谢谢sob老师，您真的是太赞了！

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴