计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

  [复制链接 Copy URL]

167

帖子

0

威望

947

eV
积分
1114

Level 4 (黑子)

76#
发表于 Post on 2018-8-5 17:33:12 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,我使用Multiwfn算Mayer键序,可以同样的N-O键序键长一样,为什么Mayer键序差那么多呢?我查验了好几遍,结果是没问题的,是我哪里出错了么?

C(HOMJ5_G}W%3XUP(~ONVM5.png (11.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 145)

C(HOMJ5_G}W%3XUP(~ONVM5.png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

77#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-6 05:56:03 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2018-8-5 17:33
sob老师您好,我使用Multiwfn算Mayer键序,可以同样的N-O键序键长一样,为什么Mayer键序差那么多呢?我查验 ...


键长并不能反应电子结构特征,这也正是键级的独到价值
你也可以结合AIM键临界点性质分析,拉普拉斯键级分析等等,看看是否规律基本相同。我也遇见极个别情况下Mayer键级明显不合理的情况。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

100

帖子

0

威望

414

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

78#
发表于 Post on 2018-8-10 21:01:57 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,关于CDA分析,做到附图中的分析了,在制表时表标题应该如何写呀? 我写的是“片段轨道对XXX配合物HOMO-n分子轨道的d、b、r项的贡献 “,不知道合不合理

1.jpg (109.25 KB, 下载次数 Times of downloads: 149)

1.jpg

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

79#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-11 06:54:16 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-8-10 21:01
sob老师,关于CDA分析,做到附图中的分析了,在制表时表标题应该如何写呀? 我写的是“片段轨道对XXX配合物 ...

XXX配合物HOMO-n分子轨道对d、b、r项的贡献的片段轨道相互作用分解
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

100

帖子

0

威望

414

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

80#
发表于 Post on 2018-8-11 10:17:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-11 06:54
XXX配合物HOMO-n分子轨道对d、b、r项的贡献的片段轨道相互作用分解

感谢sob老师

100

帖子

0

威望

414

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

81#
发表于 Post on 2018-8-20 22:02:28 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,在B3LYP/6-31G**(RECP)水平下计算铀酰离子体系的Mayer键级时,为什么没有U=O双键的键级数据呀?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

82#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-20 22:57:41 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-8-20 22:02
sob老师,在B3LYP/6-31G**(RECP)水平下计算铀酰离子体系的Mayer键级时,为什么没有U=O双键的键级数据呀?

没你的结构和文件我不好说
没有输出,应当是数值小于默认的输出阈值。可以导出键级矩阵(bndmat.txt文件)从中自行读取对应的矩阵元
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

100

帖子

0

威望

414

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

83#
发表于 Post on 2018-8-21 09:27:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 不懂计算 于 2018-8-21 09:56 编辑
sobereva 发表于 2018-8-20 22:57
没你的结构和文件我不好说
没有输出,应当是数值小于默认的输出阈值。可以导出键级矩阵(bndmat.txt文件 ...
谢谢sob老师,但是bndmat.txt文件里显示U=O键级为负值,可以取它的绝对值作为键级数据吗? 附件是我做键级的fch文件

1.rar

2.78 MB, 下载次数 Times of downloads: 1

键级文件

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

84#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-21 23:22:46 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-8-21 09:27
谢谢sob老师,但是bndmat.txt文件里显示U=O键级为负值,可以取它的绝对值作为键级数据吗? 附件是我做键级 ...

对U具体用的是什么基组?最好把高斯输入文件也贴出来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

100

帖子

0

威望

414

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

85#
发表于 Post on 2018-8-22 11:20:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-21 23:22
对U具体用的是什么基组?最好把高斯输入文件也贴出来

谢谢sob老师,输入文件已经上传

1.inp

9.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

86#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-22 22:32:21 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-8-22 11:20
谢谢sob老师,输入文件已经上传

你的关键词有严重问题,必须写genecp,否则赝势不会被读入,得到的能量和波函数都严重错误
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

195

帖子

0

威望

699

eV
积分
894

Level 4 (黑子)

87#
发表于 Post on 2018-8-23 08:59:13 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,我目前想用delta_r index来表征分子的CT特征,在您的Multiwfn手册中看到了相关的内容,是用基态的计算结果来计算delta_r。我现在想表征激发态构型下分子的CT特征(仍用delta_r index),该如何操作呢?与表征基态分子的操作区别是什么?

100

帖子

0

威望

414

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

88#
发表于 Post on 2018-8-23 09:32:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-22 22:32
你的关键词有严重问题,必须写genecp,否则赝势不会被读入,得到的能量和波函数都严重错误

明白了 谢谢sob老师指点

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

89#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 17:12:02 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2018-8-23 08:59
Sob老师,我目前想用delta_r index来表征分子的CT特征,在您的Multiwfn手册中看到了相关的内容,是用基态的 ...

"用基态的计算结果"这种表述不确切,应当说在基态的及小点结构下计算delta_r

先优化激发态,用所得的结构做一次电子激发计算,再用Multiwfn得到delta_r就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

195

帖子

0

威望

699

eV
积分
894

Level 4 (黑子)

90#
发表于 Post on 2018-8-24 17:20:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-24 17:12
"用基态的计算结果"这种表述不确切,应当说在基态的及小点结构下计算delta_r

先优化激发态,用所得的 ...

Sob老师,能否用优化激发态过程中的最后一步的电子激发信息来直接算?也就是说,优化激发态最后一步得出的电子跃迁信息,与得到激发态最优结构后再单独做一次电子激发给出的电子跃迁信息是否一致呢?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 00:57 , Processed in 0.192930 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list