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楼主 Author: sobereva
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[ORCA] 量子化学程序ORCA的安装方法

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-2 08:25:23 | 只看该作者 Only view this author
xaomidaxue 发表于 2019-4-1 22:35
sober老师,我把你的输入inp文件中的! BLYP def2-SVP noautostart miniprint pal4中的4改成24就报错。
请 ...

pal最多只能是pal8,更多核数需要用诸如%pal nprocs 36 end来指定
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发表于 Post on 2019-4-2 08:41:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-2 08:25
pal最多只能是pal8,更多核数需要用诸如%pal nprocs 36 end来指定

非常感谢,sober老师。

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发表于 Post on 2019-4-3 08:47:16 | 只看该作者 Only view this author
我安装的是orca4.1.1,按照教程安装的,但是并行计算老是报错,把PAL4删掉就能正常运行了,这是为啥呢,

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-3 10:26:37 | 只看该作者 Only view this author
kongjie 发表于 2019-4-3 08:47
我安装的是orca4.1.1,按照教程安装的,但是并行计算老是报错,把PAL4删掉就能正常运行了,这是为啥呢,

MPI没装好
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发表于 Post on 2019-4-3 10:45:10 | 只看该作者 Only view this author

但是MPI是从网盘里下载的,我的ORCA是安装的window版本的,msmpi_10.0.exe,直接安装不是就可以吗?MPI怎么才算安装好呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-4 06:18:41 | 只看该作者 Only view this author
kongjie 发表于 2019-4-3 10:45
但是MPI是从网盘里下载的,我的ORCA是安装的window版本的,msmpi_10.0.exe,直接安装不是就可以吗?MPI怎 ...

双击,下一步下一步就完了
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发表于 Post on 2019-4-20 10:36:39 | 只看该作者 Only view this author
openmpi更高的版本,openmpi4.0行不行?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-20 23:53:29 | 只看该作者 Only view this author
ddls2017 发表于 2019-4-20 10:36
openmpi更高的版本,openmpi4.0行不行?

just try
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发表于 Post on 2019-4-24 22:53:11 | 只看该作者 Only view this author
ubuntu 14.04.3,安装成功,注openmpi的make all install需要在root下才能成功安装,感谢sob老师们的教程

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-24 22:57:59 | 只看该作者 Only view this author
lty子于 发表于 2019-4-24 22:53
ubuntu 14.04.3,安装成功,注openmpi的make all install需要在root下才能成功安装,感谢sob老师们的教程

--prefix如果指定的是你当前用户有权限的路径,应当不需要root权限
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发表于 Post on 2019-4-24 23:04:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-24 22:57
--prefix如果指定的是你当前用户有权限的路径,应当不需要root权限

当时编译应当是指定的当前用户的路径的:/home/user/openmpi313,另外,ubuntu 中法使用make all install -j多核并行安装确实会报错,单核安装可用

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lty子于 发表于 2019-4-24 23:04
当时编译应当是指定的当前用户的路径的:/home/user/openmpi313,另外,ubuntu 中法使用make all install  ...

如果你不是在虚拟机下安装用-j也会出错,只能再次说明ubuntu实在太不适合科学计算用途
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发表于 Post on 2019-4-24 23:18:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-24 23:13
如果你不是在虚拟机下安装用-j也会出错,只能再次说明ubuntu实在太不适合科学计算用途

好的,感谢Sob老师深夜回复,看来以后转要CentOS

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发表于 Post on 2019-4-25 23:00:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-24 22:57
--prefix如果指定的是你当前用户有权限的路径,应当不需要root权限

今天在ubuntu14.05.5上又试了一下,确实不用root权限也可以make all install,Sob老师太赞了!

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发表于 Post on 2019-5-12 13:49:11 | 只看该作者 Only view this author
在安装 OpenMPI 时候 make后总是如下报错
  1. cd . && /bin/sh /home/parallels/Program/openmpi-3.1.3/config/missing automake-1.15 --foreign
  2. /home/parallels/Program/openmpi-3.1.3/config/missing: line 81: automake-1.15: command not found
  3. WARNING: 'automake-1.15' is missing on your system.
  4.          You should only need it if you modified 'Makefile.am' or
  5.          'configure.ac' or m4 files included by 'configure.ac'.
  6.          The 'automake' program is part of the GNU Automake package:
  7.          <http://www.gnu.org/software/automake>
  8.          It also requires GNU Autoconf, GNU m4 and Perl in order to run:
  9.          <http://www.gnu.org/software/autoconf>
  10.          <http://www.gnu.org/software/m4/>
  11.          <http://www.perl.org/>
  12. make: *** [Makefile.in] Error 1
复制代码


但是 yum insatll automake/autoconf/m4 都显示已经安装,sob 老师,这该怎么解决?

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