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楼主 Author: jiewei
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[综合讨论] Materials Studio 7.0至2017版本常见使用方法,数据分析长期答疑贴

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发表于 Post on 2018-5-22 09:22:19 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,使用Linux的ms8.0版计算时,短时间计算都没有问题,一旦计算时间超过2,3个小时的时候,计算就自动停止了
.castep最后一行是这样的(中间没有报错)
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop      Energy                           Energy gain       Timer   <-- SCF
                                               per atom          (sec)   <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -2.90853706E+004                                      44096.75  <-- SCF
      1  -2.90852634E+004                   -7.44754593E-004   44191.47  <-- SCF
      2  -2.90852688E+004                    3.77534936E-005   44267.25  <-- SCF

gateway中Http Error Log有这样的提醒
[Tue May 22 03:27:50 2018] [warn] pid file /home/bjc/Accelrys/MaterialsStudio8.0/etc/Gateway/configurations/default/httpd.pid overwritten -- Unclean shutdown of previous Apache run?
[Tue May 22 03:27:50 2018] [notice] Apache/2.2.27 (Unix) mod_perl/2.0.4 Perl/v5.8.9 configured -- resuming normal operations

应该怎么处理呢?

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发表于 Post on 2018-8-20 09:12:17 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,请问MS做能量最小化的时候一直出现WARNING Convergence criteria are not satisfied.
是怎么回事?

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发表于 Post on 2018-8-20 09:27:20 | 只看该作者 Only view this author
一舸归 发表于 2018-8-20 09:12
老师您好,请问MS做能量最小化的时候一直出现WARNING Convergence criteria are not satisfied.
是怎么 ...

没达到收敛标准,castep和dmol3的处理办法略有差别,要看你是什么体系,含不含过渡金属等等,dmol3的办法是增加smearing,降低density mixing,增加DIIS, castep是将BFGS换成TPSD收敛方法,电子最小化方法换成all bands/edft。

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发表于 Post on 2018-8-20 14:22:11 | 只看该作者 Only view this author
我用的是forcite里面的geometry optimization做的,可以怎么进行改正?

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发表于 Post on 2018-8-23 14:41:29 | 只看该作者 Only view this author
您好,请问MS里bulid layer可以沿者x方向建立吗?

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发表于 Post on 2018-8-28 10:03:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 JasonJ 于 2018-8-28 10:10 编辑

求助Dmol3收敛问题,我做了CO在Pt3Ni(111)面的吸附模型,难以收敛。吸附前也分别进行了结构优化,优化后吸附,继续优化结构就是不收敛,optimization step优化步数进行了一步,200圈,就直接工作失败了,收敛曲线也没有出现。图片是我的参数设置和计算结果(失败)

w163h6086472_1532391566_699.png (62.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 78)

参数1

参数1

w179h6086472_1532391567_906.png (74.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 85)

参数2

参数2

w373h6086472_1532392067_221.png (8.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 90)

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发表于 Post on 2018-8-28 10:12:21 | 只看该作者 Only view this author
JasonJ 发表于 2018-8-28 10:03
求助Dmol3收敛问题,我做了CO在Pt3Ni(111)面的吸附模型,难以收敛。吸附前也分别进行了结构优化,优化后吸 ...

精度即使设置到到很低,k点很小也不行

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发表于 Post on 2018-8-28 10:54:24 | 只看该作者 Only view this author
想研究一个晶体结构中一种过渡金属元素原子被多种性质相似的原子取代,这种掺杂对结构的影响。请问共同占位该怎么处理?(扩胞的话体系很大,会超过500个原子)@jiewei

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发表于 Post on 2018-8-28 16:00:54 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2017-12-14 15:52
orbital cutoff的长度是否一样?如果同样是fine的话程序只会按照体系中原子截断半径最大的作为体系全局的 ...

老师,DMOL3里面好像只有global fine一个选项,选不了具体的数值,这怎么办呢

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发表于 Post on 2018-8-28 17:42:12 | 只看该作者 Only view this author
Joannabc 发表于 2018-8-28 16:00
老师,DMOL3里面好像只有global fine一个选项,选不了具体的数值,这怎么办呢

选下面的custom
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。
本周忙

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发表于 Post on 2018-10-10 13:56:35 | 只看该作者 Only view this author
material studio 遇到这个问题 BSTR could not be converted to narrow CP_ACP string without use of surrogate pairs, in BSTRToString()
无法导出文件怎么办

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能科top50

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发表于 Post on 2018-10-10 16:14:42 | 只看该作者 Only view this author
1601214963 发表于 2018-10-10 13:56
material studio 遇到这个问题 BSTR could not be converted to narrow CP_ACP string without use of surr ...

应该是路径中有中文,改成英文的试试
In defeat, malice. In victory, revenge.

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发表于 Post on 2018-10-11 00:19:32 | 只看该作者 Only view this author
zorow 发表于 2018-2-7 17:55
请问各位使用Materials Studio软件的老师,我在帮老师做预算,想了解一下目前购买或升级castep和dmol3模块 ...

下一个盗版的最便宜,正版的请咨询创腾公司。

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发表于 Post on 2018-10-11 14:47:34 | 只看该作者 Only view this author
hxd_yi 发表于 2018-10-11 00:19
下一个盗版的最便宜,正版的请咨询创腾公司。

感谢回复,我托人问到了创腾公司的销售经理
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发表于 Post on 2018-10-15 18:41:23 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,我想请教一下,我优化结构自己建的模型,是个Cu环状团簇,嵌入到纳米管内壁上,具体为CNT-N原子-Cu,然后DMOL优化结构,优化后Cu环状团簇团聚在一起,把N原子与纳米管之间的键拉的特别长,请问如何优化才合理?
C:\Users\ZSN\Desktop

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