使用MOKIT做多参考计算

zjxitcc

NHX 发表于 2025-5-9 00:31
Z老师您好，我准备用源码安装MOKIT，我下载的最新版Intel 工具包，编译器ifort变成了ifx，请问可以用ifx编 ...

可以的。注意，对于Intel OneAPI < 2025，ifort/ifx共存，仍然可以使用ifort编译，运行make all即可；对于Intel OneAPI >= 2025，ifort被彻底抛弃 只有ifx，此时可以运行make all -f Makefile.intel_ifx（注意，请下载v1.2.7rc7 2025-May-25或更新的版本。日期可以通过打开CHANGELOG文件看首行内容得知）

Xx_DerEnTh

zjxitcc 发表于 2025-5-26 08:14
可以的。注意，对于Intel OneAPI < 2025，ifort/ifx共存，仍然可以使用ifort编译，运行make all即可；对 ...

老师您好！我用源码安装最新版的MOKIT，我的Intel OneAPI >=2025，按照您的指示编译出现了错误，弄了很久还是没有解决，想请邹老师看看是哪里有问题，附件是出错的地方，谢谢老师！

hebrewsnabla

Xx_DerEnTh 发表于 2025-5-30 21:48
老师您好！我用源码安装最新版的MOKIT，我的Intel OneAPI >=2025，按照您的指示编译出现了错误，弄了很久 ...

不要使用太老的 python 版本，建议 3.9-3.11

zjxitcc

Xx_DerEnTh 发表于 2025-5-30 21:48
老师您好！我用源码安装最新版的MOKIT，我的Intel OneAPI >=2025，按照您的指示编译出现了错误，弄了很久 ...

你可以创一个新的虚拟环境，在新环境中使用更高python版本，例如

1. conda create -n mokit-py39 python=3.9
   
2. conda activate mokit-py39
   
3. cd /path/to/mokit/src/
   
4. make all -f Makefile.intel_ifx

复制代码

前两行命令是创建新的虚拟环境（注意，此处我们并没有用conda联网安装mokit），后两行是进入mokit源代码目录去编译。我记得即使没网也可以创建本地python环境。如果编译成功，就在当前环境中使用mokit。退出新建的虚拟环境就是conda deactivate。

若实在无法创建虚拟环境以使用更高版本python，可以到镜像网站下载一个Anaconda Python离线安装包Anaconda3-2024.02-1-Linux-x86_64.sh，发送到服务器上，运行./Anaconda3-2024.02-1-Linux-x86_64.sh
就可以安装更高版本的python了。

如果使用slurm脚本提交任务，就是在脚本中先激活环境，再执行任务
# 指定内存和核数等等
source activate mokit-py39
automr h2o.gjf >h2o.out 2>&1

Xx_DerEnTh

zjxitcc 发表于 2025-5-30 23:31
你可以创一个新的虚拟环境，在新环境中使用更高python版本，例如
前两行命令是创建新的虚拟环境（注意， ...

@hebrewsnabla感谢两位老师，我再试试

Xx_DerEnTh

zjxitcc 发表于 2025-5-30 23:31
你可以创一个新的虚拟环境，在新环境中使用更高python版本，例如
前两行命令是创建新的虚拟环境（注意， ...

老师您好！我升级python版本后编译成功了，但是安装完成后我运行其中的00-h2o_cc-pVDZ_1.5.gjf例子的时候出现了报错，只生成了一个out文件，请教一下老师这个是哪里有问题，麻烦老师了。

hebrewsnabla

Xx_DerEnTh 发表于 2025-5-31 14:47
老师您好！我升级python版本后编译成功了，但是安装完成后我运行其中的00-h2o_cc-pVDZ_1.5.gjf例子的时候 ...

是mokit的bug（使用ifx时），我们修一下。

Xx_DerEnTh

hebrewsnabla 发表于 2025-6-2 17:44
是mokit的bug（使用ifx时），我们修一下。

好的，谢谢老师