计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

  [复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

122

eV
积分
135

Level 2 能力者

4621#
发表于 Post on 2025-8-25 16:54:00 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-8-25 16:40
没有任何影响,只是最后不输出archive相关的信息而已,只要你不用其他只读archive部分的软件去读这个输出 ...

老师您好!感谢您的回复。但是“Test job not archived”后面还是写了archive的相关内容。您的意思是这个内容即使在输出文件里也不能被只读archive的软件读取吗?

75

帖子

0

威望

279

eV
积分
354

Level 3 能力者

4622#
发表于 Post on 2025-8-25 17:09:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 NHX 于 2025-8-25 17:11 编辑

各位老师好,我想用stable=opt得到U+单体稳定的能量,用的泛函是PBE0-D3(BJ),但是报错l508,头一次遇见这种情况,我尝试换了泛函(例如MN15)就能正常结束,但整个体系已经用PBE0-D3(BJ)算完了,不想换泛函重算,请教各位老师这种情况有什么好的解决办法?谢谢各位老师。

U .zip

90.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

1万

帖子

0

威望

9740

eV
积分
21936

Level 6 (一方通行)

4623#
发表于 Post on 2025-8-25 20:21:54 | 只看该作者 Only view this author
zbhyyds 发表于 2025-8-25 16:54
老师您好!感谢您的回复。但是“Test job not archived”后面还是写了archive的相关内容。您的意思是这个 ...

这个比较奇怪,但是一般用的软件都不是只读archive的,所以不用担心,真的发现打不开了再想办法就行了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

1万

帖子

0

威望

9740

eV
积分
21936

Level 6 (一方通行)

4624#
发表于 Post on 2025-8-25 20:22:26 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2025-8-25 17:09
各位老师好,我想用stable=opt得到U+单体稳定的能量,用的泛函是PBE0-D3(BJ),但是报错l508,头一次遇见这 ...

用PBE0-D3(BJ)读MN15的波函数作为初猜
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

75

帖子

0

威望

279

eV
积分
354

Level 3 能力者

4625#
发表于 Post on 2025-8-25 20:57:21 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-8-25 20:22
用PBE0-D3(BJ)读MN15的波函数作为初猜

感谢老师的回复,我尝试了一下,结果还是显示不稳定,最后仍然报错L508

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124694

管理员

公社社长

4626#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-26 05:51:19 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2025-8-25 20:57
感谢老师的回复,我尝试了一下,结果还是显示不稳定,最后仍然报错L508

不要盲目用stable=opt
U+单原子离子,电子组态是什么样是已知的,应当通过恰当guess=alter调换初猜轨道顺序以收敛到正确的组态。而且就算stable=opt最后给你搞出了它自称稳定的波函数,也应当看轨道占据方式进一步检验,免得被坑。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

75

帖子

0

威望

279

eV
积分
354

Level 3 能力者

4627#
发表于 Post on 2025-8-26 07:13:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-8-26 05:51
不要盲目用stable=opt
U+单原子离子,电子组态是什么样是已知的,应当通过恰当guess=alter调换初猜轨道 ...

好的,感谢sob老师

13

帖子

0

威望

122

eV
积分
135

Level 2 能力者

4628#
发表于 Post on 2025-8-26 12:07:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-8-25 20:21
这个比较奇怪,但是一般用的软件都不是只读archive的,所以不用担心,真的发现打不开了再想办法就行了

好的,谢谢老师的回复!

201

帖子

0

威望

892

eV
积分
1093

Level 4 (黑子)

4629#
发表于 Post on 2025-8-26 22:05:41 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,我想请问一下有没有什么办法可以确认一个化学式构型是否存在呢?我想计算一下类似于N—O—H这类结构分子构型,其中N和H之间存在氢键,我想计算看看H原子能不能沿着氢键转移到N上然后引发后续反应,我现在结构优化N—O—H这种构型的时候可以成功,但是每次结构优化 H—N—O这种构型的时候都失败,然后看优化趋势发现 H—N—O的结构会慢慢结构优化到 N—O—H,就算拉远H和O之间距离,缩短H和N距离最后也会向N—O—H结构转化,我想问一下这是不是说明 H—N—O构型不存在,H原子也不可以通过氢键从O转移到N上呢?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124694

管理员

公社社长

4630#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-27 08:06:55 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2025-8-26 22:05
各位老师,我想请问一下有没有什么办法可以确认一个化学式构型是否存在呢?我想计算一下类似于N—O—H这类 ...

如果用的结构模型正确、计算级别合理、该考虑的问题都考虑了(如溶剂效应)等,说明就是如此,但建议做个距离的柔性扫描以最终确认
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

75

帖子

0

威望

279

eV
积分
354

Level 3 能力者

4631#
发表于 Post on 2025-8-27 19:22:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 NHX 于 2025-8-27 19:28 编辑

各位老师好,目前研究的某个涉及过渡金属的反应机理从过渡态到产物的路径上存在两个交点,图中红线和黑线分别对应不同的自旋多重度的势能面,请教各位老师:
这种在过渡态之后产生的势能面交点,在交点处是否容易发生自旋翻转仍然需要考虑旋轨耦合矩阵元吗?还是说到达交点处直接就会走最低的能量路径,即1->2->3,完全不会生成产物1呢?

1.png (25.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

1.png

8

帖子

0

威望

77

eV
积分
85

Level 2 能力者

4632#
发表于 Post on 2025-8-27 20:18:15 | 只看该作者 Only view this author

请问,linux Gaussian16出现terminated with an error for input file怎么解决?

请问,第一次使用Linux系统(Ubantu 22.04)安装Gaussian,第一次计算任务就出现“terminated with an error for input file提示”,请问怎么解决啊?

尝试了卸载重新安装也没能解决,求助。请问,怎么办呀?

306

帖子

0

威望

1942

eV
积分
2248

Level 5 (御坂)

4633#
发表于 Post on 2025-8-27 20:23:44 | 只看该作者 Only view this author
输入文件出错

8

帖子

0

威望

77

eV
积分
85

Level 2 能力者

4634#
发表于 Post on 2025-8-27 20:30:47 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢谢谢

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124694

管理员

公社社长

4635#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-28 03:52:18 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2025-8-27 19:22
各位老师好,目前研究的某个涉及过渡金属的反应机理从过渡态到产物的路径上存在两个交点,图中红线和黑线分 ...

原理上需要考虑
如果完全没有旋轨耦合,会一直走透热路径
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 05:00 , Processed in 0.504376 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list