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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2025-10-29 23:13:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-29 09:09
这是偶极矩,和跃迁偶极矩完全是两码事
跃迁偶极矩在哪看下文明确说了
Gaussian中用TDDFT计算激发态和 ...

sobereva老师,感谢您的回复!

# td=(nstates=3,root=1) opt freq b3lyp/6-31g(d)


我在最后一步优化的输出中找到了以下内容,如果只考虑大小的话,加粗部分是不是就是我想要的S1向S0的跃迁偶极矩?

如果要考虑方向的话,我是不是只要把 X Y Z的数值 都加上负号就行了?


Ground to excited state transition densities written to RWF  633
Ground to excited state transition electric dipole moments (Au):
       state          X           Y           Z        Dip. S.      Osc.
         1         1.1605      0.0308      0.0391      1.3492      0.0545
         2         0.0375      0.1803      0.0382      0.0354      0.0020
         3        -1.7319     -0.0207     -0.0406      3.0015      0.1744
Ground to excited state transition velocity dipole moments (Au):
       state          X           Y           Z        Dip. S.      Osc.
         1        -0.0760     -0.0021     -0.0025      0.0058      0.0636
         2        -0.0034     -0.0148     -0.0037      0.0002      0.0019
         3         0.1596      0.0023      0.0038      0.0255      0.1949
Ground to excited state transition magnetic dipole moments (Au):
       state          X           Y           Z
         1         0.0036     -0.0658      0.0618
         2         0.0040     -0.0349      0.1102
         3        -0.0093      0.1404     -0.1530
Ground to excited state transition velocity quadrupole moments (Au):
       state          XX          YY          ZZ          XY          XZ          YZ
         1         0.5963      0.0348      0.0087     -0.0269     -0.0172     -0.0029
         2        -0.0032     -0.0085     -0.0003      0.1544      0.0502     -0.0044
         3         0.2317     -0.0881      0.0195      0.0985      0.0860     -0.0066
<0|del|b> * <b|rxdel|0> + <0|del|b> * <b|delr+rdel|0>
Rotatory Strengths (R) in cgs (10**-40 erg-esu-cm/Gauss)
       state          XX          YY          ZZ    R(velocity)    E-M Angle
         1         0.0885     -1.5863     -1.8634     -1.1204       92.40
         2         1.1900      0.6786     -1.0572      0.2705       90.00
         3        -0.3339    -14.1654      0.3673     -4.7107       93.01
1/2[<0|r|b>*<b|rxdel|0> + (<0|rxdel|b>*<b|r|0>)*]
Rotatory Strengths (R) in cgs (10**-40 erg-esu-cm/Gauss)
       state          XX          YY          ZZ     R(length)
         1        -2.9380      1.4326     -1.7094     -1.0716
         2        -0.1057      4.4505     -2.9762      0.4562
         3       -11.3809      2.0575     -4.3931     -4.5722
  1/2[<0|del|b>*<b|r|0> + (<0|r|b>*<b|del|0>)*] (Au)
       state          X           Y           Z        Dip. S.   Osc.(frdel)
         1        -0.0882     -0.0001     -0.0001      0.0883      0.0589
         2        -0.0001     -0.0027     -0.0001      0.0029      0.0020
         3        -0.2764     -0.0000     -0.0002      0.2766      0.1844

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发表于 Post on 2025-10-30 04:30:01 | 只看该作者 Only view this author

跟着视频学习教程中过渡态Ts搜索,出现报错

跟着视频学习教程中过渡态Ts搜索,使用乙烯和HF为反应物,一步一步跟着做。试了几次,每次都出现报错。out文件最后是下面这样的,在老师的文档中也没有发现类似的问题和解决方案。求教。

202510300429212885..png (61.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202510300429212885..png

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发表于 Post on 2025-10-30 04:32:29 | 只看该作者 Only view this author
gif文件是这样的。

202510300432191966..png (33.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-30 08:40:12 | 只看该作者 Only view this author
Jerry_Wang 发表于 2025-10-29 23:13
sobereva老师,感谢您的回复!

# td=(nstates=3,root=1) opt freq b3lyp/6-31g(d)


不区分跃迁方向,没有自己加负号的事。搞清楚跃迁偶极矩积分表达式便知
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2025-10-30 08:40:16 | 只看该作者 Only view this author
输出文件说得很清楚了
检查D:\G16W文件夹下有没有l302.exe。如果没有,检查是不是高斯安装的时候有问题,比如安装了不明来源的盗版
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2025-10-30 08:41:24 | 只看该作者 Only view this author
moiumuio 发表于 2025-10-29 22:41
Hi teacher,
I want to ask, should I optimise the positive/negative charge structure to achieve IP ...

Optimize the structures if you want to calculate adiabatic IP/EA, and don't optimize them if you want to calculate vertical IP/EA
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2025-11-5 19:39:11 | 只看该作者 Only view this author
求问各位大量做计算的大佬们是如何整理自己的计算数据的呢?
我的项目需要计算的分子数目特别多,每个分子用过不同的方法做过计算,有单点能、几何优化等任务。我目前是把一次计算的数据全部放在一个文件夹,以分子结构-计算方法-任务命名,感觉已经理不清了。
计算化学有没有对应核磁数据用实验记录本页码或者日期命名等大家普遍遵守的行业规范?

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发表于 Post on 2025-11-5 20:57:23 | 只看该作者 Only view this author
卤素妹妹 发表于 2025-11-5 19:39
求问各位大量做计算的大佬们是如何整理自己的计算数据的呢?
我的项目需要计算的分子数目特别多,每个分子 ...

我会在分子结构和计算方法之间加个序号,这样可以一目了然知道哪个是先算的哪个是后算的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2025-11-6 00:56:33 | 只看该作者 Only view this author

La系配合物优化不合理

各位老师好,我做La离子和两个阴离子分子络合的结构优化,但是-NH2那个位置的氢原子一直有问题,氢原子会一直靠近氮原子直至重叠,不知道怎么修改?不知道基组还是泛函的问题,(La+3价,有机分子-2价,总价态-1,自旋多重度1),感谢各位老师
关键词  #p opt freq scrf=(smd,solvent=H2O) pbe1pbe genecp em=gd3bj int=fine


-1 1


坐标


C O Hdef2svp****LaMWB46****LaMWB46




202511060051082633..png (62.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

报错的结构

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发表于 Post on 2025-11-6 01:23:16 | 只看该作者 Only view this author
N原子没定义基组
不羡大神不羡仙,努力学习每一天

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-6 08:47:11 | 只看该作者 Only view this author
卤素妹妹 发表于 2025-11-5 19:39
求问各位大量做计算的大佬们是如何整理自己的计算数据的呢?
我的项目需要计算的分子数目特别多,每个分子 ...

除了在文件名上体现必要信息外,恰当用目录/子目录,来区分不同分子、任务。并且必要时写个note.txt记录计算流程、不同目录的文件都对应什么
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发表于 Post on 2025-11-6 17:59:46 | 只看该作者 Only view this author
各位老师我想问一下大家目前对于周期性模型的DFT计算都用什么软件呢?我最近用vasp算一些周期性的模型时候发现vasp这个软件结构优化感觉很麻烦,要优化出收敛的构型往往要耗费大量的时间,感觉对比Gaussian的结构优化要头大很多,各位老师对于计算周期性模型的DFT软件有没有什么建议吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-7 01:49:33 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2025-11-6 17:59
各位老师我想问一下大家目前对于周期性模型的DFT计算都用什么软件呢?我最近用vasp算一些周期性的模型时候 ...

一般情况首选CP2K,算中、大体系效率吊打VASP还免费。这也是为什么北京科音的第一性原理计算的培训班(http://www.keinsci.com/KFP)结合的是CP2K讲
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发表于 Post on 2025-11-8 18:41:27 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,请问关于此贴(分子间轨道重叠的图形显示和计算,http://sobereva.com/163),最终采用vmd作图时,是否应该把正值和负值的等值面都做出来呢?此外您博文中写到,乘积正负代表的是重叠轨道的相位相同或相反,但均代表有重叠。那么为什么在计算重叠积分的时候确实直接相加而不是把两部分取模之后再相加呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-8 23:33:56 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2025-11-8 18:41
老师您好,请问关于此贴(分子间轨道重叠的图形显示和计算,http://sobereva.com/163),最终采用vmd作图时 ...

是。博文里在Multiwfn中显示作图时就是正负都显示的
一般意义的重叠积分就是那么定义的,轨道波函数直接相乘的全空间积分。模的乘积的全空间积分是单纯用来衡量重叠程度高低的,而没有考虑相位抵消问题,下文里就算了这种量
使用Multiwfn考察轨道间重叠程度和质心距离
http://sobereva.com/371http://bbs.keinsci.com/thread-5596-1-1.html

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