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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2026-6-28 01:47:18 | 只看该作者 Only view this author
老师输出文件在这里

P-HBA - FREQ -SMD - FREQ.LOG

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-28 01:50:03 | 只看该作者 Only view this author
TYXB521 发表于 2026-6-28 01:47
老师输出文件在这里

http://bbs.keinsci.com/thread-59759-1-1.html里你已经问过了
同一个问题或者高度类似的问题别在两个地方问
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2026-6-28 01:56:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-28 01:50
http://bbs.keinsci.com/thread-59759-1-1.html里你已经问过了
同一个问题或者高度类似的问题别在两个地 ...

好的老师,第一个帖子我这边浏览不到以为被您删掉了所以重新发了一次

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发表于 Post on 2026-6-28 14:39:42 | 只看该作者 Only view this author
TYXB521 发表于 2026-6-28 01:47
老师输出文件在这里

这个任务正常结束了,输出文件看起来挺正常的,哪里怪了?

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发表于 Post on 2026-6-28 16:41:52 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我要分别对TEP(C6H15O4P),BTFE(C4H4F6O),LiFSI(LiN(SO2F)2)进行opt+freq,选择了DFT,B3LYP,基组要选择什么?
之前尝试了6-31G,6-311G,6-31G(d,p),6-31G(d),都无法达到让这三个分子都收敛

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-28 21:20:03 | 只看该作者 Only view this author
Nsy1 发表于 2026-6-28 16:41
各位老师好,我要分别对TEP(C6H15O4P),BTFE(C4H4F6O),LiFSI(LiN(SO2F)2)进行opt+freq,选择了DFT,B ...

SCF不收敛该怎么解决怎么解决,别随便盲目换基组
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

6-31G,6-311G这样连极化函数都没有的基组没有任何试的意义
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发表于 Post on 2026-6-29 10:50:12 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请问两个不同的中间体(IM)有没有可能通过同一个过渡态(TS)走向同一个中间体?目前一个反应的IM1找到了TS1走到IM2(通过IRC验证),但还发现了一个和IM1结构十分相似且能量接近的IM1',却始终没有找到连接IM1'的TS(尝试了各种手段,QST2,NEB,calcall,小步长,int=superfine),目前怀疑IM1和IM1'会不会经过同一个TS到达中间体IM2。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-29 16:52:57 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2026-6-29 10:50
各位老师好,请问两个不同的中间体(IM)有没有可能通过同一个过渡态(TS)走向同一个中间体?目前一个反应 ...

如果你之前找IM1和IM1'之间的过渡态没找到,可以试试用NEB方法(ORCA、CP2K都支持),看看它们之间的势能曲线和结构变化特征,从而更充分了解当前的势能面特征。说不定二者之间不是一步能变化过去的
仅当TS后面出现势能面二分的情况,才会同时联通IM1和IM1'
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发表于 Post on 2026-6-30 10:41:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-29 16:52
如果你之前找IM1和IM1'之间的过渡态没找到,可以试试用NEB方法(ORCA、CP2K都支持),看看它们之间的势能 ...

感谢sob老师

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发表于 Post on 2026-7-1 23:16:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-29 16:52
如果你之前找IM1和IM1'之间的过渡态没找到,可以试试用NEB方法(ORCA、CP2K都支持),看看它们之间的势能 ...

sob老师您好,请教一下如果出现势能面二分,这种相交的曲线有没有可能出现

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-7-2 02:09:54 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2026-7-1 23:16
sob老师您好,请教一下如果出现势能面二分,这种相交的曲线有没有可能出现

能量相交有可能。但二分处不是正好在过渡态位置,而是在其附近
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发表于 Post on 2026-7-2 10:59:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-7-2 02:09
能量相交有可能。但二分处不是正好在过渡态位置,而是在其附近

感谢sob老师回复

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发表于 Post on 2026-7-2 17:57:28 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,我想用xtb跑动力学模拟物种在水中的脱质子过程,MD中需要引入大量显式水分子。虽然实验的PH为中性,为了加快现象的发生,适当引入1个OH-氢氧根是合理的吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-7-3 00:37:49 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2026-7-2 17:57
请问老师,我想用xtb跑动力学模拟物种在水中的脱质子过程,MD中需要引入大量显式水分子。虽然实验的PH为中 ...

人为因素太大,这和脱质子形成水合质子有很大的不同,不建议这样
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发表于 Post on 2026-7-3 13:52:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-7-3 00:37
人为因素太大,这和脱质子形成水合质子有很大的不同,不建议这样

OK,感谢老师的解答。

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