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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-6-1 11:39:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 09:08
凭直觉就知道不可能产生影响,算也没意义
你也可以把那些离得远的离子坐标冻结住,没准收敛容易点,反正 ...

我想问问对于我要研究的离子液体团簇催化二氧化碳转化这种大体系催化的,我应该用什么方法计算最合适?用什么方法计算能够比较准确地表现多分子催化时分子之间作用力对催化的影响?
我老师说算的分子个数越多越接近实际情况,这样可以比较出分子间作用力对催化活性的影响,对吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-1 12:06:50 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-1 11:30
我可以从3个离子液体用pm6优化开始。然后逐渐加离子液体的个数行不行?3,4,5,6,7。。。这样慢慢用PM6优 ...

可尝试
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-1 12:07:53 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-1 11:39
我想问问对于我要研究的离子液体团簇催化二氧化碳转化这种大体系催化的,我应该用什么方法计算最合适?用 ...


加到几个的时候,把反应位点附近都已经包住了,再增加只会白浪费时间、更难收敛,毫无用处
当然DFT合适,盲目非得把体系搞大号称更接近于实际,就只能用半经验。得不偿失。
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发表于 Post on 2016-6-1 15:46:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 12:07
加到几个的时候,把反应位点附近都已经包住了,再增加只会白浪费时间、更难收敛,毫无用处
当然DFT合 ...

恩,您的意思是不在反应位点附近的离子液体它们彼此之间的作用不会影响催化吗?

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发表于 Post on 2016-6-1 16:10:41 | 只看该作者 Only view this author
dark_cosmos 发表于 2016-6-1 11:26
你好。请问你的反应物与生成物构型的差别大不大。我的计算生成物与反应物构型差别太大,过渡态中的那个原 ...

没有你说的这个错误消息啊

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发表于 Post on 2016-6-1 16:15:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 12:07
加到几个的时候,把反应位点附近都已经包住了,再增加只会白浪费时间、更难收敛,毫无用处
当然DFT合 ...

我还想问问就是我用PM6优化好了这些多分子,可以不用DFT再优化吗?用PM6优化好的是不是可以说明问题了?

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发表于 Post on 2016-6-1 16:43:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 12:07
加到几个的时候,把反应位点附近都已经包住了,再增加只会白浪费时间、更难收敛,毫无用处
当然DFT合 ...

您的意思是我研究这个离子液体团簇没有意义?我现在都到了一种很痛苦的地步,不想做这个,优化不出来,我快疯了,特别不想做这个,我老师非得让我做,心痛。。。

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发表于 Post on 2016-6-1 16:47:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 12:07
加到几个的时候,把反应位点附近都已经包住了,再增加只会白浪费时间、更难收敛,毫无用处
当然DFT合 ...

感觉这个PM6优化好奇怪啊,连之前用DFT优化好三分子的过渡态,现在用pm6优化还优化不出来

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发表于 Post on 2016-6-1 19:35:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 12:07
加到几个的时候,把反应位点附近都已经包住了,再增加只会白浪费时间、更难收敛,毫无用处
当然DFT合 ...

我想想问问我这个体系可以DFT的混合基组优化结构吗?混合基组的输入文件怎么弄?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-1 21:44:45 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-1 19:35
我想想问问我这个体系可以DFT的混合基组优化结构吗?混合基组的输入文件怎么弄?

详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-1 21:45:49 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-1 16:15
我还想问问就是我用PM6优化好了这些多分子,可以不用DFT再优化吗?用PM6优化好的是不是可以说明问题了?


之后最好还是DFT再优化一下。PM6先搞成功了,可以免得在DFT反复优化尝试上面浪费的时间
但也有个别情况PM6优化出来的过渡态在DFT级别下是不存在的,或者说TS结构有很大差别。
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发表于 Post on 2016-6-1 22:00:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 21:45
之后最好还是DFT再优化一下。PM6先搞成功了,可以免得在DFT反复优化尝试上面浪费的时间
但也有个别情 ...

PM6优化出差得到的数据没有说服力吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-2 01:46:38 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-1 22:00
PM6优化出差得到的数据没有说服力吗?

看要求的精度
有没有说服力看人
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发表于 Post on 2016-6-2 08:33:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-1 21:45
之后最好还是DFT再优化一下。PM6先搞成功了,可以免得在DFT反复优化尝试上面浪费的时间
但也有个别情 ...

我发现我用pm6优化的过渡态的趋势与DFT优化的结构差的挺远的,我应该怎么办?

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发表于 Post on 2016-6-2 09:35:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-19 15:54
开壳层:体系有未配对电子
闭壳层:体系中没有未配对电子
满壳层:量化里没这个概念。结构化学里大抵 ...

非常感谢

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