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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 01:21:44 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2022-10-11 19:36
各位老师我想问一下我在用赝势基组的时候我该怎么判断自旋呢?比如说我一个元素核外电子是80,我的赝势基组 ...

genecp时不定义赝势就和没用赝势的情况一样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 01:22:07 | 只看该作者 Only view this author
wangyueda 发表于 2022-10-11 14:46
请问下卢老师,Gaussian做opt+freq时,想要提取上一步结构优化的中某一步继续优化时,是不是读取上一步优化 ...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 01:24:03 | 只看该作者 Only view this author
sgcg1997 发表于 2022-10-10 15:58
老师您好,想请教一下这个问题是什么原因?无论是什么结构都会这样,也没有明显的错误代码

认真把此文看了,弄清楚当前版本最多能用多少内存
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 01:36:48 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-10-10 22:12
老师们,对于图中的两种配合物,相同级别下考察了Co-O和Ni-O键的Mayer键级,显示Ni-O的比较大。我用CDA和ET ...

电荷转移量和Mayer键级大小仅在一定条件下有关联,即轨道相互作用造成电子转移

结合ETS-NOCV给出的主要的作用项的图形进行分析

以后波函数分析问题在本帖1L提到的专门的帖子里问
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发表于 Post on 2022-10-12 04:55:00 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2022-10-11 16:01
老师就是相当于先按电子填充规则填充好,只算后5个填充价电子的自旋吗?

对,但是我很好奇你为什么内层电子有75个?除了镧系元素以外(因为有的赝势会把4f算作内层电子),所有元素的内层电子都是偶数,但是镧系元素没有内层电子是75个的。是不是你读错了内层电子数,把其他一个什么地方的75当成这个赝势的内层电子数了?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2022-10-12 07:09:24 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-12 04:55
对,但是我很好奇你为什么内层电子有75个?除了镧系元素以外(因为有的赝势会把4f算作内层电子),所有元 ...

老师我只是举个例子,突然想到了会不会有这种情况就问了一下

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发表于 Post on 2022-10-12 07:13:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-12 01:18
不带极化函数优化根本没意义
都SCF不收敛了,还不代#P监控计算过程?
“很多方法也试过了”这种描述没 ...

好的,谢谢老师,我试试

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发表于 Post on 2022-10-12 09:21:25 | 只看该作者 Only view this author
请教一下各位老师,关于一篇计算环烷烃通过双自由基中间体单分子解离的文献,①计算方法提到CBS-QB3,但是又说用B3LYP/6-31G(d)优化过渡态和跑IRC,那么他是只在计算单点能的时候固定坐标用CBS-QB3吗?②对于单重态双自由基的计算,有提到了结构优化是在UB3LYP/CBSB7,这个是不是就是直接使用CBS-QB3包含的优化过程了?但是CBS-QB3能够自动加上“u”进行非限制性计算吗?

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发表于 Post on 2022-10-12 10:03:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-10 14:40
这种事上传个输出文件一下子别人就清楚了
当前什么关键性信息都没体现,诸如计算级别、体系大小、用的核 ...

老师,我上传了今早上的输出文件,还是和之前没多大差别,麻烦您看一下

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发表于 Post on 2022-10-12 10:07:15 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2022-10-10 11:15
等着呗,急个啥……

这种情况能续算嘛?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-12 12:41:04 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2022-10-12 09:21
请教一下各位老师,关于一篇计算环烷烃通过双自由基中间体单分子解离的文献,①计算方法提到CBS-QB3,但是 ...

没必要去牵扯CBS-QB3,计算过程不便于控制和检查
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发表于 Post on 2022-10-12 14:40:36 | 只看该作者 Only view this author
老师们好,我想算一个质子化的过程以及其初末态、过渡态能量。我的问题是:
1)请问我的初态应该是这个分子还是分子加一个“无穷远”的质子呢?
2)如果是后者的话,这个分子我已经结构优化完毕了,是否需要对这个正离子进行结构优化后再算单点能,还是直接加一个无穷远质子算单点能就可以呢?
感谢各位老师解答!

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发表于 Post on 2022-10-12 14:44:30 | 只看该作者 Only view this author
各位老师我想问一下我在算结构优化的时候一直不收敛报错SCF,用#p监视计算过程了,输出文件应该关注那些数据呢?这些数据反应了什么呢?有没有相应的教程呢?

Co_AO3.out

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发表于 Post on 2022-10-12 16:25:44 | 只看该作者 Only view this author
请教一下老师,对于优化好的单重态双自由基,计算能量的时候是不是要加上guess=read(#p CCSD(T) cc-pVTZ nosymm guess=read )去读取波函数以避免再次构造对称破缺初猜呢?同样地,对初步优化好的结构扫描是不是也要加上guess=read(#p opt=modredundant 6-311g(d,p) nosymm guess=read um062x)呢?谢谢

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发表于 Post on 2022-10-12 17:07:50 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2022-10-12 09:25
请教一下老师,对于优化好的单重态双自由基,计算能量的时候是不是要加上guess=read(#p CCSD(T) cc-pVTZ n ...

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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