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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-8-6 10:33:54 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-8-5 18:09
优化结构的时候?你确定这是优化结构的时候出现的,不是IRC?

结构优化时候出现的。我以为数据不能用呢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-6 10:35:24 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-8-6 08:22
对于有未成对电子的结构去结构优化可以通过比较不同自旋多重度下的能量找到对应的基态,但是TS过渡态怎么确 ...

反应可能在不同自旋多重度的势能面发生,可以不同自旋多重度都找TS
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-8-6 11:09:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-6 10:35
反应可能在不同自旋多重度的势能面发生,可以不同自旋多重度都找TS

然后呢,怎么确定哪一个自旋多重度下的TS是我要找的呢?老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-6 11:52:26 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-8-6 11:09
然后呢,怎么确定哪一个自旋多重度下的TS是我要找的呢?老师

up to you
有些反应就是牵扯到多个势能面的,诸如Acc. Chem. Res. 2000, 33, 139-145
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-8-6 14:35:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小书童 于 2016-8-6 17:10 编辑
sobereva 发表于 2016-8-6 11:52
up to you
有些反应就是牵扯到多个势能面的,诸如Acc. Chem. Res. 2000, 33, 139-145

哦哦,谢谢老师。我看看这个文献。选定一个多重度的同时,但是走IRC的时候,反应物和产物的多重度不相同,这个IRC的多重度也是up to me吗?

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发表于 Post on 2016-8-6 17:34:29 | 只看该作者 Only view this author

高斯为何打不开ORCA的out文件呢?

如题。手册里说用chemcraft可直接打开out文件,但这个软件只能试用150天,请问下还有什么免费或者能破解的软件可以打开Out文件呢?

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发表于 Post on 2016-8-6 19:08:18 | 只看该作者 Only view this author

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-6 19:47:07 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-8-6 14:35
哦哦,谢谢老师。我看看这个文献。选定一个多重度的同时,但是走IRC的时候,反应物和产物的多重度不相同 ...


有些反应牵扯到多个势能面,反应过程中不同自旋态势能面可能交叉。
你走IRC的时候一次只能在一个势能面上走,得到的反应物和产物自旋多重度肯定相同,但这自旋多重度未必是现实中发生反应时实际的自旋多重度。仔细看看那篇综述。
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发表于 Post on 2016-8-6 20:21:42 | 只看该作者 Only view this author
请问假如TDDFT计算所得某个激发态的组态系数超过1,跃迁组成超过100%,是否正常,是否合理?
搜索了一下“跃迁组成”的帖子,发现都是我开的......

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发表于 Post on 2016-8-6 20:30:14 | 只看该作者 Only view this author
请问最低三重激发态的主要跃迁(跃迁组成超过5%)如下:
H-27-->L+4(7%), H-28-->L+3(5%), H-26-->L+5(5%),
是否合理?
H-28与HOMO的能级差已达0.061819 a.u.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-7 06:23:07 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2016-8-6 20:21
请问假如TDDFT计算所得某个激发态的组态系数超过1,跃迁组成超过100%,是否正常,是否合理?
搜索了一下“ ...

你得考虑去激发导致的负贡献,见
电子激发任务中轨道跃迁贡献的计算
http://sobereva.com/230
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-7 06:23:35 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2016-8-6 20:30
请问最低三重激发态的主要跃迁(跃迁组成超过5%)如下:
H-27-->L+4(7%), H-28-->L+3(5%), H-26-->L+5(5%) ...

也没什么不合理的
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发表于 Post on 2016-8-7 11:00:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-7 06:23
也没什么不合理的

担心审稿人问为何最低能跃迁涉及远离前线的轨道......

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发表于 Post on 2016-8-7 13:00:31 | 只看该作者 Only view this author
有一个概念性的问题:对于A+B=C+D+E型的反应,计算自由能的时候,是A+B放在一块算,C+D+E放在一块算的。这样标准态该怎么定义:对于气相标准态1atm是分别A、B都是1atm,查表计算貌似都是分开来的,这样弄到一块了是按2atm计算么?Sob老师在《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》提到过修正,但是我不清楚这时候我的生成物与反应物需要分别修正多少,是不是2*1.89kcal/mol与3*1.89kcal/mol?

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发表于 Post on 2016-8-7 18:33:57 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2016-8-7 11:00
担心审稿人问为何最低能跃迁涉及远离前线的轨道......

低激发态应该只涉及前线轨道才是意淫

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