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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-8-12 11:15:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-12 01:36
基本上任何情况都可以用纯泛函优化。只不过往往精度比杂化差点而已,也不至于明显不准确。

谢谢sob老师,如果想分析homo lumo,及gap、DOS等用纯泛函优化的结果可以吗?如若不可以是否要用杂化泛函再算一遍单点来分析这些性质呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-12 11:44:47 | 只看该作者 Only view this author
1188542uu 发表于 2016-8-12 11:15
谢谢sob老师,如果想分析homo lumo,及gap、DOS等用纯泛函优化的结果可以吗?如若不可以是否要用杂化泛函 ...

应当用杂化再算次单点。轨道能级对泛函比较敏感,纯泛函对这类问题不灵。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-8-13 06:59:09 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,用orca软件b3lyp-d3/def2-qzvpp(-g,-f)rijcosx做的能量计算后的波函数文件是否可以直接用来做波函数分析(包括,AIM,DOS,RDG,HOMO-LUMO等)和NPA电荷分析?所得结果会不会比小基组def2-svp和def2-tzvp差?

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发表于 Post on 2016-8-13 21:48:47 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,请问一下。使用Gaussian计算吸附水分子的吸附过程中的焓变,得到的值与水的气化潜热能有对应关系吗?能否表征水从气态向液态的转变?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-14 03:26:27 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-8-13 06:59
请问老师,用orca软件b3lyp-d3/def2-qzvpp(-g,-f)rijcosx做的能量计算后的波函数文件是否可以直接用来做 ...


除了怕弥散函数的Mulliken、CDA、Mayer键级等,其它的包括你提到的都不会比小基组差。但是基组这么大分析会很耗时,一般def2-SVP、def2-TZVP足够了。而且要注意orca产生的.molden文件如果带g角动量基函数,用Multiwfn分析结果可能会有点问题,属于orca的bug。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-14 03:30:21 | 只看该作者 Only view this author
1130240115 发表于 2016-8-13 21:48
各位老师,请问一下。使用Gaussian计算吸附水分子的吸附过程中的焓变,得到的值与水的气化潜热能有对应关系 ...

谁吸附水分子?
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发表于 Post on 2016-8-14 07:53:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 1130240115 于 2016-8-14 08:00 编辑

谢谢老师的回复。老师,我使用M062x计算含氧官能团吸附多个水分子。发现吸附水分子的数量增加到一定程度后,再吸附水分子能量变化接近40kJ/mol,接近水的气化潜热。于是就想到了这一问题。

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发表于 Post on 2016-8-14 08:03:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-14 03:26
除了怕弥散函数的Mulliken、CDA、Mayer键级等,其它的包括你提到的都不会比小基组差。但是基组这么大分 ...

多谢sob老师,我用的def2-qzvpp(-g,-f)是不是括号里的-g已经去掉了g角动量?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-14 17:05:49 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-8-14 08:03
多谢sob老师,我用的def2-qzvpp(-g,-f)是不是括号里的-g已经去掉了g角动量?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-14 17:07:14 | 只看该作者 Only view this author
1130240115 发表于 2016-8-14 07:53
谢谢老师的回复。老师,我使用M062x计算含氧官能团吸附多个水分子。发现吸附水分子的数量增加到一定程度 ...

吸附已经很多之后再吸附就相当于水-水之间的相互作用,算出来和汽化热一样是正常的。
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发表于 Post on 2016-8-14 17:12:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-14 17:07
吸附已经很多之后再吸附就相当于水-水之间的相互作用,算出来和汽化热一样是正常的。

谢谢老师的回复。

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发表于 Post on 2016-8-14 21:15:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-12 11:44
应当用杂化再算次单点。轨道能级对泛函比较敏感,纯泛函对这类问题不灵。

谢谢老师

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发表于 Post on 2016-8-15 10:08:15 | 只看该作者 Only view this author
赵云跳槽 发表于 2016-7-21 15:15
通过好心人的帮助解决了这个问题
在$rem中加了两行命令:
ithrsh 12

对这个问题,我问了Qchem公司人员
QChem能够重复出gaussian的结果,通过引入外部电荷的方式
至于计算QChem结果与NWchem的区别,其回答是电荷的布局方式不同
NWChem的CDFT支持Mulliken、Lowdin和Becke三种布居方法,默认是Lowdin
而QChem的CDFT仅支持Becke
如果NWchem使用Becke布局计算CDFT, 则NWChem和QChem得到相识结果
(我本人未测试,这只是他说的)

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发表于 Post on 2016-8-16 21:41:32 | 只看该作者 Only view this author
请问sobereva老师,对于一个反应它在什么情况下是barrierless呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-17 09:48:38 | 只看该作者 Only view this author
大道之行 发表于 2016-8-16 21:41
请问sobereva老师,对于一个反应它在什么情况下是barrierless呢?


找不到过渡态的时候,即反应过程能量单调变化
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